| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略语表 | 第8-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-56页 |
| ·细菌与生物膜概述 | 第16-17页 |
| ·细菌概念 | 第16页 |
| ·芽胞杆菌形态学特征 | 第16页 |
| ·生物膜概念 | 第16-17页 |
| ·细菌生物膜的形成、组成成分及生物学意义 | 第17-26页 |
| ·细菌生物膜形成条件 | 第17-21页 |
| ·与植物相关的生物膜 | 第21-23页 |
| ·细菌生物膜的组成结构 | 第23-25页 |
| ·细菌生物膜的作用 | 第25-26页 |
| ·细菌生物膜的生活史 | 第26-28页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜研究进展 | 第28-37页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜的形成方式及组成成分 | 第28-32页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜形成过程中的基因调控途径 | 第32-36页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜与生防的关系 | 第36-37页 |
| ·枯草芽胞杆菌生物膜研究进展 | 第37-52页 |
| ·枯草芽胞杆菌生物膜形成方式 | 第37-38页 |
| ·枯草芽胞杆菌生物膜基质组成成分 | 第38-42页 |
| ·枯草芽胞杆菌生物膜形成过程中的基因调控网络 | 第42-49页 |
| ·枯草芽胞杆菌生物膜的发展及消解 | 第49-50页 |
| ·生物膜在生防枯草芽胞杆菌生防中发挥的重要功能 | 第50-52页 |
| ·研究内容及目的意义 | 第52-56页 |
| ·研究内容 | 第52-53页 |
| ·研究目的与意义 | 第53-56页 |
| 第二章 蜡样芽胞杆菌生物膜形成机制研究 | 第56-91页 |
| ·实验材料 | 第56-66页 |
| ·细菌菌株、质粒及培养条件 | 第56-59页 |
| ·酶和引物合成 | 第59-61页 |
| ·培养基及实验溶液配制 | 第61-65页 |
| ·主要实验仪器 | 第65-66页 |
| ·实验方法 | 第66-77页 |
| ·生物信息学分析 | 第66页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第66页 |
| ·B.cereus 905菌株感受态细胞的制备及电击转化 | 第66-67页 |
| ·B.cereus菌株基因组DNA的提取 | 第67-68页 |
| ·质粒DNA的小量提取 | 第68页 |
| ·缺失突变重组质粒的构建 | 第68-72页 |
| ·目标基因缺失突变体的构建及筛选 | 第72-74页 |
| ·功能互补载体的构建 | 第74-75页 |
| ·蜡样芽胞杆菌形成潜底型生物膜的定量分析 | 第75页 |
| ·蜡样芽胞杆菌形成潜底型生物膜的定性分析 | 第75页 |
| ·蜡样芽胞杆菌在MSgg中形成薄皮型生物膜的分析 | 第75-76页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜形成中pH的测定 | 第76页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜对Proteinase K和DNase I敏感性的测定 | 第76页 |
| ·蜡样芽胞杆菌芽孢的形成 | 第76-77页 |
| ·蜡样芽胞杆菌玻片的制备 | 第77页 |
| ·结果与分析 | 第77-88页 |
| ·B.cereus 905基因组中含有相关的生物膜基因 | 第77-81页 |
| ·B.cereus 905可以在MSgg中形成薄皮型生物膜 | 第81-83页 |
| ·促进905形成潜底型生物膜条件的筛选 | 第83-84页 |
| ·弱酸性条件是905形成潜底型生物膜的必需条件 | 第84-86页 |
| ·胞外DNA和蛋白是905生物膜的主要组成成分 | 第86-88页 |
| ·小结 | 第88页 |
| ·讨论 | 第88-91页 |
| 第三章 枯草芽胞杆菌酪氨酸激酶调节器TkmA在生物膜形成过程中的功能研究 | 第91-131页 |
| ·实验材料 | 第91-98页 |
| ·菌株、质粒及培养条件 | 第91-95页 |
| ·酶和引物合成 | 第95-96页 |
| ·培养基与实验溶液配制 | 第96-98页 |
| ·实验方法 | 第98-112页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒热激转化 | 第98页 |
| ·B.subtilis菌株基因组DNA的提取 | 第98-99页 |
| ·质粒DNA的小量提取 | 第99页 |
| ·枯草芽胞杆菌基因缺失突变体的构建 | 第99-103页 |
| ·枯草芽胞杆菌ΔtkmA突变体功能互补菌株的构建 | 第103页 |
| ·枯草芽胞杆菌ΔtkmA突变体epsA互补菌株的构建 | 第103-104页 |
| ·枯草芽胞杆菌ΔtkmA突变体点突变互补菌株的构建 | 第104-105页 |
| ·点突变菌株YC997,YC999,TG043,YC998,YC1200和TG044的构建 | 第105-107页 |
| ·组成型表达LacZ菌株的构建 | 第107-110页 |
| ·EpsAB过量表达菌株的构建 | 第110-111页 |
| ·抑制突变体YC820突变序列的确定 | 第111页 |
| ·β-半乳糖苷酶活性的测定 | 第111-112页 |
| ·枯草芽胞杆菌生物膜评价 | 第112页 |
| ·结果与分析 | 第112-127页 |
| ·tkmA-ugd操纵子调控区序列分析 | 第112-114页 |
| ·tkmA缺失突变体在LBGM培养基中形成生物膜的能力显著降低 | 第114-115页 |
| ·TkmA结构域的定点突变分析 | 第115-117页 |
| ·ΔtkmA-ugd的抑制突变体生物膜检测及序列分析 | 第117-119页 |
| ·单核苷酸突变降低sinR的表达量,显著地提高epsA-O的表达量 | 第119-120页 |
| ·过量表达EpsAB可以回补AtkmA或ΔtkmA-ugd造成的生物膜形成缺陷 | 第120-122页 |
| ·SpoOA和DegU对tkmA-ugd和epsA-O操纵子的复杂性调控 | 第122-125页 |
| ·tkmA在LBGM中的表达量高于在MSgg中的表达量,而epsA正好相反 | 第125-126页 |
| ·在LBGM和MSgg中DegU和Spo0A调节tkmA和epsA的表达量 | 第126-127页 |
| ·小结 | 第127-128页 |
| ·讨论 | 第128-131页 |
| 第四章 结论与展望 | 第131-134页 |
| ·结论 | 第131-132页 |
| ·生物膜形成类型的多样性研究 | 第131页 |
| ·营养影响生物膜形成的研究 | 第131页 |
| ·蜡样芽胞杆菌生物膜形成机制研究 | 第131-132页 |
| ·本研究的创新性 | 第132页 |
| ·蜡样芽胞杆菌利用两种独立的机制形成生物膜 | 第132页 |
| ·TkmA在枯草芽胞杆菌生物膜产生过程中表现出新功能 | 第132页 |
| ·展望 | 第132-134页 |
| 参考文献 | 第134-146页 |
| 附录 | 第146-204页 |
| 附录1——GenBank收录的Bacillus cereus 905的序列 | 第146-190页 |
| 附录2——GenBank收录的Bacillus subtilis NCIB 3610的序列 | 第190-204页 |
| 致谢 | 第204-206页 |
| 作者简历 | 第206-208页 |
