线虫和水稻中环状RNA的预测及分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-19页 |
| ·环状RNA简介 | 第10-15页 |
| ·环状RNA的生物起源 | 第11-13页 |
| ·环状RNA的特征 | 第13页 |
| ·环状RNA的功能 | 第13-15页 |
| ·环状RNA的建库方式 | 第15页 |
| ·环状RNA的预测方法 | 第15-17页 |
| ·miRNA结合方式 | 第17-18页 |
| ·研究的目的与意义 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-26页 |
| ·数据来源和生物信息学工具 | 第19-21页 |
| ·RNA-seq数据来源 | 第19-20页 |
| ·microRNA数据来源 | 第20页 |
| ·参考基因组以及基因组注释信息来源 | 第20页 |
| ·生物信息学工具 | 第20-21页 |
| ·数据分析方法 | 第21-26页 |
| ·数据预处理 | 第21-22页 |
| ·环状RNA的预测 | 第22-24页 |
| ·表达量统计 | 第24页 |
| ·miRNA结合位点统计 | 第24-25页 |
| ·GO富集和表达模式聚类 | 第25页 |
| ·内含子反向互补配对 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-39页 |
| ·线虫环状RNA分析 | 第26-34页 |
| ·线虫环状RNA的基本特征 | 第26-28页 |
| ·RNase R对环状RNA的作用 | 第28-30页 |
| ·环状RNA的多样性和可选择性 | 第30-31页 |
| ·线虫环状RNA侧翼内含子特征 | 第31-32页 |
| ·miRNA在环状RNA上的结合位点 | 第32-33页 |
| ·GO富集和表达模式聚类 | 第33-34页 |
| ·植物环状RNA分析 | 第34-39页 |
| ·水稻环状RNA的基本特征 | 第34-36页 |
| ·水稻环状RNA侧翼内含子特征 | 第36-37页 |
| ·拟南芥环状RNA的基本特征 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| 5 展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-48页 |
| 附录 | 第48-57页 |
| 附录I：水稻环状RNA | 第48-56页 |
| 附录II：拟南芥环状RNA | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
