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日本沼虾微卫星标记开发、遗传结构分析及性别相关遗传标记筛选研究

中文摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
1、引言第14-32页
   ·分子标记技术简介第14-20页
     ·RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)标记第14-15页
     ·RAPD(random amplified polymorphic DNA)技术第15-17页
     ·AFLP(amplified fragment length polymorphism)标记第17-18页
     ·SSR(simple sequence repeats)标记第18-19页
     ·SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)标记第19-20页
   ·微卫星位点分离方法第20-24页
     ·传统方法第20-21页
     ·微卫星富集法第21-23页
     ·FIASCO 法第23页
     ·数据查找法第23-24页
     ·近缘物种筛选法第24页
   ·分子标记技术在虾类遗传多样性研究中的应用第24-28页
     ·分子标记在野生虾类遗传多样性中的应用第25-27页
     ·分子标记在养殖与野生虾类间的遗传多样性研究中的应用第27-28页
   ·虾蟹类的性别决定及性别相关分子标记的研究第28-30页
   ·日本沼虾研究现状第30-31页
     ·日本沼虾分子标记开发及遗传多样性分析研究现状第30页
     ·日本沼虾性别相关基因及分子标记研究现状第30-31页
   ·本研究的目的、意义第31-32页
2、材料与方法第32-47页
   ·试验用日本沼虾第32-33页
   ·试剂和仪器第33-34页
   ·基因组 DNA 提取第34页
   ·微卫星基因组富集文库构建第34-39页
     ·基因组 DNA 酶切第35-36页
     ·接头的制备第36页
     ·连接第36页
     ·预扩增第36-37页
     ·生物素探针杂交第37-38页
     ·磁珠富集第38页
     ·PCR 扩增第38-39页
     ·克隆、测序第39页
   ·ISSR-PCR 法开发微卫星标记第39-40页
   ·序列分析及微卫星引物设计第40-41页
   ·PAGE第41-42页
   ·荧光标记 SSR第42页
   ·AFLP第42-46页
     ·基因组 DNA 提取第42-43页
     ·限制性酶切及连接第43页
     ·预扩增第43-44页
     ·选择性扩增第44-46页
   ·数据分析第46-47页
3、结果第47-77页
   ·FIASCO 法开发多态性微卫星标记第47-55页
     ·FIASCO 文库构建结果第47-49页
     ·测序统计及引物设计第49-53页
     ·微卫星标记多态性分析第53-55页
   ·ISSR-PCR 法开发微卫星标记结果第55-61页
     ·ISSR-PCR 法预扩增结果第55-56页
     ·克隆后菌液检测结果第56-57页
     ·测序统计及引物设计结果第57-59页
     ·微卫星标记多态性分析第59-61页
   ·开发的微卫星序列特征分析第61-63页
   ·4 个日本沼虾群体遗传结构分析第63-70页
     ·4 个日本沼虾群体荧光 SSR 基因分型结果第63-66页
     ·4 个日本沼虾群体的遗传多样性第66-67页
     ·群体遗传分化和遗传距离第67-69页
     ·4 个日本沼虾群体遗传分化第69-70页
   ·日本沼虾性别相关分子标记筛选第70-77页
     ·基因组 DNA 的提取第70-71页
     ·性别相关 SSR 标记的筛选第71-73页
     ·基因组 DNA 酶切、预扩增第73-74页
     ·选择性扩增和性别相关 AFLP 分子标记的筛选第74-77页
4、讨论第77-84页
   ·微卫星标记的开发第77-80页
     ·微卫星位点的分离方法第77-78页
     ·微卫星标记效用的评价第78-80页
     ·I型微卫星标记的分离第80页
   ·微卫星二核苷酸的重复类型第80-81页
   ·群体遗传结构分析第81-83页
   ·性别相关分子标记第83-84页
5.结论第84-86页
6.主要参考文献第86-103页
7. 致谢第103-104页
8. 读博期间发表文章情况第104页

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