| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-18页 |
| ·多胺类化合物简述 | 第10-16页 |
| ·多胺类分子的分类 | 第10-13页 |
| ·多胺类小分子与DNA的作用方式 | 第13-14页 |
| ·多胺类小分子对DNA序列的选择性 | 第14-16页 |
| ·课题的研究意义 | 第16-18页 |
| 第二章 计算方法与原理 | 第18-22页 |
| ·量子化学计算方法 | 第18-19页 |
| ·分子对接方法 | 第19-20页 |
| ·分子对接的一般原理 | 第19-20页 |
| ·分子对接的互补性 | 第20页 |
| ·分子对接方法分类 | 第20页 |
| ·分子动力学模拟方法 | 第20-22页 |
| ·分子动力学发展的历程 | 第20-21页 |
| ·分子动力学模拟的基本原理 | 第21页 |
| ·分子动力学模拟的过程 | 第21-22页 |
| 第三章 多胺类小分子与DNA最佳结合模式的分子对接 | 第22-43页 |
| ·引言 | 第22页 |
| ·研究对象 | 第22页 |
| ·计算细节 | 第22-26页 |
| ·小分子结构的优化 | 第22-23页 |
| ·AutoDock分子对接 | 第23-26页 |
| ·结果与讨论 | 第26-42页 |
| ·以DB75为母体修饰结构的一系列分子 | 第26-28页 |
| ·以DB293为母体修饰结构的一系列分子 | 第28-38页 |
| ·配体分子的长度对结合作用的影响 | 第38-40页 |
| ·配体分子的曲率对结合作用的影响 | 第40-42页 |
| ·小结 | 第42-43页 |
| 第四章 对称性可逆脒与DNA相互作用的分子动力学模拟 | 第43-60页 |
| ·研究背景 | 第43-44页 |
| ·研究模型和计算细节 | 第44-49页 |
| ·初始构型 | 第44-47页 |
| ·力场参数的准备 | 第47-48页 |
| ·分子动力学模拟 | 第48页 |
| ·轨迹分析 | 第48页 |
| ·结合自由能的计算 | 第48-49页 |
| ·结果与讨论 | 第49-58页 |
| ·分子动力学模拟的一般特征 | 第49-50页 |
| ·氢键分析 | 第50-52页 |
| ·DNA构象动力学 | 第52-58页 |
| ·结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-68页 |
| 个人简历 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |