| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 图目录 | 第11-12页 |
| 表目录 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第13-29页 |
| ·表观遗传简介 | 第13页 |
| ·DNA甲基化 | 第13-25页 |
| ·DNA甲基化及其形成 | 第13-14页 |
| ·DNA甲基转移酶 | 第14-15页 |
| ·DNA甲基化异常 | 第15-16页 |
| ·DNA甲基化检测方法 | 第16-19页 |
| ·DNA甲基化测序数据的分析流程 | 第19-21页 |
| ·DNA甲基化模式的动态性和差异性分析 | 第21-25页 |
| ·几种特殊的DNA甲基化模式 | 第25页 |
| ·精子中的DNA甲基化 | 第25-27页 |
| ·DNA甲基化重编程事件 | 第25-26页 |
| ·精子中DNA甲基化的研究进展 | 第26-27页 |
| ·本课题的研究内容和意义 | 第27-29页 |
| ·前期研究基础——DNA甲基化与细胞分化、重编程 | 第27页 |
| ·本课题的研究内容 | 第27-29页 |
| 2 材料和方法 | 第29-33页 |
| ·数据来源 | 第29页 |
| ·分析流程 | 第29-33页 |
| ·数据格式转换 | 第29页 |
| ·数据预处理 | 第29-30页 |
| ·数据比对 | 第30页 |
| ·甲基化模式的提取 | 第30-31页 |
| ·CSM的鉴定 | 第31-32页 |
| ·SNP与DNA甲基化 | 第32页 |
| ·差异甲基化区域的鉴定 | 第32-33页 |
| 3 结果 | 第33-47页 |
| ·精子细胞中全基因组DNA甲基化图谱的基本特征 | 第33-38页 |
| ·DNA甲基化图谱整体特征 | 第33-34页 |
| ·DNA甲基化与基因组功能元件的关联 | 第34-38页 |
| ·DNA甲基化水平与模式熵的关系 | 第38页 |
| ·同一个精子细胞群体内的DNA甲基化模式异质性分析 | 第38-43页 |
| ·管家基因的DNA甲基化模式 | 第38-40页 |
| ·CSM区域的鉴定 | 第40-42页 |
| ·CSM与SNP | 第42页 |
| ·CSM与其他细胞系的ASM | 第42-43页 |
| ·同一物种内不同个体之间DNA甲基化模式分析 | 第43-47页 |
| ·DNA甲基化模式与样本的关联性分析 | 第43-45页 |
| ·差异甲基化区域的鉴定 | 第45-47页 |
| 4 结论 | 第47-49页 |
| 5 讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-65页 |
| 附录A 计算工具和相关数据库的网络链接 | 第57-59页 |
| 附录B DNA甲基化分析相关图表 | 第59-65页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第65页 |