| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-18页 |
| ·基因家族 | 第13-14页 |
| ·基因家族概念及特征 | 第13-14页 |
| ·基因家族起源与研究 | 第14页 |
| ·转录因子概述 | 第14-16页 |
| ·植物中 AP2/EREPB 基因家族 | 第16-17页 |
| ·AP2/EREPB 基因家族的分类 | 第16页 |
| ·AP2/EREPB 基因家族的功能 | 第16-17页 |
| ·棉花基因组测序与家族基因研究 | 第17页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第17-18页 |
| 第二章 棉花中 AP2/EREBP 家族的全基因组鉴定、分类 | 第18-28页 |
| ·实验材料 | 第18页 |
| ·实验方法 | 第18-20页 |
| ·HMMER 的使用及家族成员鉴定 | 第18-19页 |
| ·进化树构建 | 第19页 |
| ·亚家族分类 | 第19-20页 |
| ·染色体物理分布 | 第20页 |
| ·棉花 DNA 提取 | 第20页 |
| ·PCR 相关 | 第20页 |
| ·结果与分析 | 第20-27页 |
| ·AP2/EREBP 家族基因的鉴定 | 第20-23页 |
| ·AP2/EREBP 的亚家族分类与命名 | 第23-25页 |
| ·AP2/EREBP 家族基因的染色体分布 | 第25-27页 |
| ·讨论 | 第27-28页 |
| 第三章 棉花 RAV 亚基因家族的全基因组分析 | 第28-41页 |
| ·材料与方法 | 第28-29页 |
| ·材料 | 第28页 |
| ·序列和结构域分析 | 第28页 |
| ·系统发育及进化分析 | 第28页 |
| ·染色体物理定位 | 第28-29页 |
| ·结果与分析 | 第29-40页 |
| ·棉花 RAV 基因家族成员的鉴定 | 第29-30页 |
| ·棉花RAV蛋白的理化特性和结构域分析 | 第30-35页 |
| ·棉花 RAV 亚基因家族的系统发育分析 | 第35-37页 |
| ·棉花 RAV 基因的选择压力分析 | 第37-38页 |
| ·棉花 RAV 基因在染色体上的物理定位 | 第38-40页 |
| ·讨论 | 第40-41页 |
| 第四章 达尔文氏棉转录组测序 | 第41-47页 |
| ·材料与方法 | 第41-43页 |
| ·实验材料 | 第41页 |
| ·实验方法 | 第41-42页 |
| ·Blast 搜索 | 第42页 |
| ·RPKM 值计算 | 第42-43页 |
| ·实验结果 | 第43-46页 |
| ·RNA 质量检测 | 第43页 |
| ·测序拼接序列 | 第43-44页 |
| ·基因注释 | 第44-45页 |
| ·差异表达基因分析和富集分析 | 第45页 |
| ·棉花 AP2/EREBP 基因家族的差异表达 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-47页 |
| 第五章 棉花 RAV 基因的表达分析 | 第47-51页 |
| ·材料与方法 | 第47页 |
| ·与陆地棉 EST、Unigene 数据库比对 | 第47页 |
| ·陆地棉 RAV 基因黄萎病菌胁迫后 RT-PCR 表达检测 | 第47页 |
| ·RAV 基因的表达分析 | 第47-50页 |
| ·在达尔文氏棉中旱胁迫后 | 第47-48页 |
| ·搜索陆地棉中此家族的 RAV 基因 | 第48-49页 |
| ·陆地棉 RAV 基因黄萎病菌胁迫的 RT-PCR | 第49-50页 |
| ·讨论 | 第50-51页 |
| 第六章 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 附录 | 第56-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 作者简历 | 第75页 |
