| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-13页 |
| ·引言 | 第10-11页 |
| ·Caspase-3 酶介绍 | 第11页 |
| ·Caspase-3 酶的发现 | 第11页 |
| ·Caspase-3 酶的结构与分布 | 第11页 |
| ·Caspase-3 酶抑制剂的研究进展 | 第11-12页 |
| ·Caspase-3 酶抑制剂分类 | 第11-12页 |
| ·Caspase-3 酶抑制剂研究现状 | 第12页 |
| ·本课题研究意义及创新之处 | 第12-13页 |
| 第2章 理论基础及计算方法 | 第13-20页 |
| ·分子对接 | 第13-16页 |
| ·分子对接的分类 | 第13-14页 |
| ·典型分子对接软件 | 第14-15页 |
| ·分子对接中的重要问题 | 第15页 |
| ·配体-受体相互作用类型 | 第15-16页 |
| ·分子动力学模拟 | 第16-18页 |
| ·常用分子动力学软件 | 第16页 |
| ·力场 | 第16-17页 |
| ·溶剂效应 | 第17-18页 |
| ·MM/PBSA 计算方法 | 第18页 |
| ·本章小结 | 第18-20页 |
| 第3章 桦木酸及其衍生物与 Capase-3 分子对接计算 | 第20-36页 |
| ·引言 | 第20页 |
| ·分子对接计算步骤 | 第20-21页 |
| ·实验材料的选取与准备 | 第21-24页 |
| ·桦木酸及其衍生物抑制剂配体的选取 | 第22-23页 |
| ·受体的准备 | 第23-24页 |
| ·对接参数 | 第24-25页 |
| ·分子对接结果 | 第25-35页 |
| ·Caspase-3 与 Bet01 对接结果 | 第25-27页 |
| ·Caspase-3 与 Bet02 对接结果 | 第27-29页 |
| ·Caspase-3 与 Bet03 对接结果 | 第29-31页 |
| ·Caspase-3 与 Bet04 对接结果 | 第31-33页 |
| ·Caspase-3 与 Bet05 对接结果 | 第33-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第4章 桦木酸及其衍生物与 Caspase-3 分子动力学模拟 | 第36-56页 |
| ·引言 | 第36页 |
| ·分子动力学模拟计算步骤 | 第36-37页 |
| ·实验参数 | 第37-38页 |
| ·结合自由能计算 | 第38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-54页 |
| ·Cas-Bet01 复合物体系 | 第38-42页 |
| ·Cas-Bet02 复合物体系 | 第42-45页 |
| ·Cas-Bet03 复合物体系 | 第45-48页 |
| ·Cas-Bet04 复合物体系 | 第48-51页 |
| ·Cas-Bet05 复合物体系 | 第51-54页 |
| ·本章小结 | 第54-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |