| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| ·生物信息学 | 第9-10页 |
| ·研究背景与意义 | 第10-13页 |
| ·研究背景 | 第10-11页 |
| ·研究意义 | 第11-13页 |
| ·国内外研究现状 | 第13-15页 |
| ·本论文所做的工作及论文组织结构 | 第15-16页 |
| ·论文所做工作 | 第15页 |
| ·本论文的组织结构 | 第15-16页 |
| ·本章小结 | 第16-17页 |
| 第二章 RNA二级结构相似性计算方法及聚类方法 | 第17-28页 |
| ·RNA二级结构相似牲计算方法 | 第17-25页 |
| ·基于字符串比较的相似性计算 | 第17-18页 |
| ·基于树的拓扑结构的相似性计算 | 第18-22页 |
| ·基于图形表示法的相似性计算 | 第22-24页 |
| ·基于Lempel-Ziv算法的相似性计算 | 第24-25页 |
| ·聚类算法简介 | 第25-27页 |
| ·基于划分的方法(partitioning methods) | 第25-26页 |
| ·基于层次的方法(hierarchical methods) | 第26页 |
| ·基于密度的方法(density-based methods) | 第26页 |
| ·基于网格的方法(grid-based methods) | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第三章 点括号图表示法和CT文件表示法的相互转换 | 第28-38页 |
| ·RNA二级结构及其子结构 | 第28-30页 |
| ·RNA二级结构的平面图表示 | 第30-32页 |
| ·平面图形表示法 | 第30-31页 |
| ·点括号图表示 | 第31页 |
| ·CT文件表示 | 第31-32页 |
| ·转换算法 | 第32-36页 |
| ·点括号图到二级结构平面图(即对应的CT文件)的转换 | 第32-34页 |
| ·二级结构平面图(即对应的CT文件)到点括号图的转换 | 第34-36页 |
| ·实例分析 | 第36-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第四章 相似性的计算及其聚类分析 | 第38-50页 |
| ·RNA二级结构的语义结构图表示 | 第38-40页 |
| ·RNA二级结构相似性的计算 | 第40-44页 |
| ·数据来源及其数据处理 | 第40-41页 |
| ·基于语义结构图表示的RNA二级结构相似性计算 | 第41-44页 |
| ·基于层次聚类的RNA二级结构分类 | 第44-46页 |
| ·实验结果分析 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-50页 |
| 第五章 总结与展望 | 第50-52页 |
| ·全文总结 | 第50页 |
| ·研究课题展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 附录 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第57页 |
