基于k词的DNA序列分析的模型研究及应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-25页 |
| ·计算分子生物学的研究背景及研究内容 | 第9-10页 |
| ·计算分子生物学研究中的一些基础知识 | 第10-14页 |
| ·生物序列分析的研究模型概述 | 第14-23页 |
| ·比对模型概述 | 第15-17页 |
| ·非比对模型概述 | 第17-23页 |
| ·本文主要工作 | 第23-25页 |
| 2 DNA序列的几何图形表示模型 | 第25-43页 |
| ·引言 | 第25页 |
| ·DNA序列的图形表示 | 第25-29页 |
| ·3D曲线的应用 | 第29-41页 |
| ·利用3D曲线的投影曲线进行突变分析 | 第29-32页 |
| ·相似性分析和进化分析 | 第32-41页 |
| ·提出的特征曲线的数值刻画量 | 第32-34页 |
| ·基于两个特征描述子的相似性分析和进化分析 | 第34-36页 |
| ·与其他方法的比较 | 第36-41页 |
| ·总结与讨论 | 第41-43页 |
| 3 基于推广的伪氨基酸组成方法的模型 | 第43-57页 |
| ·引言 | 第43页 |
| ·基于伪氨基酸组成方法的模型的建立 | 第43-46页 |
| ·关于双核苷酸的DNA初始序列的逻辑表示 | 第43-45页 |
| ·LZ复杂度 | 第45页 |
| ·DNA序列特征向量的建立 | 第45-46页 |
| ·实验结果和讨论 | 第46-54页 |
| ·实验数据及其进化树的构建 | 第46-49页 |
| ·w值的选取 | 第49-54页 |
| ·本章小节 | 第54-57页 |
| 4 DNA序列分析的一个概率模型 | 第57-73页 |
| ·引言 | 第57页 |
| ·基于k词的一个新概率分布的模型建立 | 第57-59页 |
| ·k词的新概率分布 | 第57-58页 |
| ·DNA序列的特征向量的构建 | 第58-59页 |
| ·实验结果和讨论 | 第59-71页 |
| ·构建48个戊型肝炎病毒的进化树 | 第59-60页 |
| ·构建20个真哺乳亚纲动物进化树 | 第60-69页 |
| ·减去背景概率的分析 | 第69-71页 |
| ·本章小结 | 第71-73页 |
| 结论与展望 | 第73-75页 |
| 结论 | 第73-74页 |
| 展望 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-83页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第83-85页 |
| 论文创新点摘要 | 第85-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 作者简介 | 第88-89页 |
