进化分析与结构预测中的若干问题研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-19页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第9-10页 |
| ·分子生物学知识概述 | 第10-16页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第16-17页 |
| ·本文的主要工作 | 第17-19页 |
| 2 基于DNA序列的进化分析 | 第19-55页 |
| ·生物序列分析中的比对和非比对方法 | 第19-29页 |
| ·生物序列分析中的比对方法 | 第19-21页 |
| ·生物序列分析中的非比对方法 | 第21-29页 |
| ·进化树的构建和评价方法 | 第29-31页 |
| ·进化树的构建方法 | 第29-31页 |
| ·进化树的评价方法 | 第31页 |
| ·基于去除随机背景的特征向量构建进化树 | 第31-43页 |
| ·特征向量和距离矩阵 | 第31-32页 |
| ·实例分析与方法比较 | 第32-39页 |
| ·字长k的选择 | 第39-43页 |
| ·基于k-字平均间隔的进化分析 | 第43-54页 |
| ·k-字平均间隔 | 第44-45页 |
| ·实验数据与距离度量 | 第45-46页 |
| ·实例分析与方法比较 | 第46-51页 |
| ·k和k-字对进化分析的影响 | 第51-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 3 一种新的蛋白质二级结构预测方法 | 第55-75页 |
| ·蛋白质二级结构预测概述 | 第55-56页 |
| ·常用蛋白质结构数据库介绍 | 第56-57页 |
| ·用支持向量机预测蛋白质二级结构 | 第57-74页 |
| ·蛋白质结构数据集 | 第57-59页 |
| ·支持向量机 | 第59-63页 |
| ·蛋白质二级结构特征的提取 | 第63-66页 |
| ·特征选择 | 第66-67页 |
| ·刀切法检验与算法性能评估 | 第67页 |
| ·各种蛋白质二级结构预测方法的比较 | 第67-74页 |
| ·本章小结 | 第74-75页 |
| 结论与展望 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-85页 |
| 攻读博士学位期间学术论文完成情况 | 第85-87页 |
| 论文创新点摘要 | 第87-89页 |
| 致谢 | 第89-91页 |
| 作者简介 | 第91-93页 |
