| 致谢 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| 1.文献综述 | 第10-23页 |
| ·杂种优势 | 第10-14页 |
| ·玉米杂种优势研究的重要性 | 第10页 |
| ·杂种优势的概念 | 第10-11页 |
| ·杂种优势的遗传机制 | 第11-13页 |
| ·显性假说 | 第11页 |
| ·超显性假说 | 第11-12页 |
| ·上位性假说 | 第12页 |
| ·基因差异表达调控与杂种优势 | 第12-13页 |
| ·玉米杂种优势的研究 | 第13-14页 |
| ·microRNA 的研究概况 | 第14-18页 |
| ·microRNA 的概念 | 第14页 |
| ·microRNA 的发现 | 第14页 |
| ·microRNA 的生物学特征 | 第14-16页 |
| ·植物 miRNA 与动物 miRNA 的共同特征 | 第14-15页 |
| ·植物 miRNA 与动物 miRNA 的区别 | 第15-16页 |
| ·microRNA 的生物合成过程 | 第16-17页 |
| ·microRNA 介导的转录调控机制 | 第17页 |
| ·microRNA 在植物发育过程中的研究 | 第17-18页 |
| ·植物 microRNA 的研究方法 | 第18-23页 |
| ·miRNA 文库的构建、克隆和测序 | 第18页 |
| ·miRNA 芯片技术寻找相关的 miRNA | 第18-19页 |
| ·生物信息学在植物 miRNA 研究中的应用 | 第19-20页 |
| ·高通量测序 | 第20页 |
| ·荧光定量 PCR 检测 miRNA | 第20-22页 |
| ·实时荧光定量 PCR 检测 miRNA 引物扩增方法 | 第21-22页 |
| ·实时荧光定量的数据分析方法 | 第22页 |
| ·其他 miRNA 检测方法 | 第22-23页 |
| ·玉米 microRNA 的研究 | 第23页 |
| 2.引言 | 第23-24页 |
| 3.材料与方法 | 第24-35页 |
| ·试验材料 | 第24-26页 |
| ·供试玉米材料 | 第24页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第24-25页 |
| ·生化试剂及分子生物学试剂 | 第25页 |
| ·常用溶液的配制 | 第25页 |
| ·使用的数据库和软件 | 第25-26页 |
| ·实验方法 | 第26-27页 |
| ·玉米种子的处理 | 第26页 |
| ·组织样品的取样 | 第26页 |
| ·实验材料总 RNA 的提取 | 第26-27页 |
| ·实验用品的前处理 | 第26页 |
| ·实验样品总 RNA 的提取 | 第26-27页 |
| ·RNA 质量检测 | 第27页 |
| ·注意事项 | 第27页 |
| ·miRNA 和 miRNA 候选靶基因的差异表达分析 | 第27-35页 |
| ·Solexa 测序 | 第27-29页 |
| ·处理材料 Solexa 测序 | 第27页 |
| ·Solexa 测序原理及流程（图 3-1） | 第27-28页 |
| ·Solexa 测序序列分析 | 第28-29页 |
| ·miRNA 引物 | 第29-31页 |
| ·miRNA 靶基因的预测 | 第31页 |
| ·RNA 纯化与反转录 | 第31-32页 |
| ·cNDA 第一链的合成 | 第32-33页 |
| ·引物特异性鉴定 | 第33-34页 |
| ·实时定量 PCR 对 miRNA 和其候选靶基因进行相对定量分析 | 第34-35页 |
| 4. 结果与分析 | 第35-53页 |
| ·玉米籽粒萌发期胚总 RNA 的质量检测 | 第35-36页 |
| ·玉米籽粒萌发期的已知 miRNAs | 第36-40页 |
| ·玉米杂交种和其亲本中检测到的已知的 miRNAs | 第36-39页 |
| ·玉米籽粒萌发期与杂种优势相关 miRNA 的分类 | 第39-40页 |
| ·玉米籽粒萌发期新发现的 miRNAs | 第40-45页 |
| ·玉米籽粒萌期 miRNA 靶基因的预测与功能注释 | 第45-48页 |
| ·保守 miRNA 靶基因的预测与功能注释 | 第45-47页 |
| ·新 miRNA 的靶基因预测与功能注释 | 第47-48页 |
| ·玉米籽粒萌发期 miRNA 和其靶基因的差异表达 | 第48-53页 |
| ·差异 miRNA 的筛选分析 | 第48页 |
| ·miRNA 茎环法反转录质量检测 | 第48-49页 |
| ·qRT-PCR 检测 | 第49-50页 |
| ·RT-PCR 检测保守 miRNA 和其靶基因的表达量 | 第50-52页 |
| ·RT-PCR 检测新 miRNA 的表达量 | 第52-53页 |
| 5. 结论与讨论 | 第53-60页 |
| ·结论 | 第53-54页 |
| ·讨论 | 第54-60页 |
| ·高通量测序技术的可行性 | 第54页 |
| ·玉米籽粒萌发期 miRNA 的分析 | 第54-55页 |
| ·玉米杂种优势的遗传基础 | 第55页 |
| ·玉米杂种优势相关 miRNA 的差异表达 | 第55页 |
| ·miRNA 靶基因预测及表达分析 | 第55-56页 |
| ·玉米籽粒萌发期有关杂种优势可能的调控机制 | 第56-58页 |
| ·进一步研究方向 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| ABSTRACT | 第69-71页 |
| 附表 | 第71-96页 |
