| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第11-13页 |
| 第一章 苏云金芽胞杆菌鞭毛合成调控初步探究 | 第13-57页 |
| 1 前言 | 第13-22页 |
| ·细菌鞭毛简介 | 第13-19页 |
| ·鞭毛形态及结构 | 第13-15页 |
| ·细菌鞭毛蛋白的合成调控 | 第15-18页 |
| ·细菌的趋化性 | 第18-19页 |
| ·苏云金芽胞杆菌简介 | 第19-20页 |
| ·基本生物学特征 | 第19-20页 |
| ·基因组测序情况概述 | 第20页 |
| ·中华亚种CT-43的主要特性 | 第20页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第20-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-39页 |
| ·实验材料 | 第22-28页 |
| ·菌株与质粒 | 第22-23页 |
| ·引物 | 第23-24页 |
| ·培养基及主要试剂耗材 | 第24-25页 |
| ·主要试剂配方 | 第25-27页 |
| ·主要仪器 | 第27-28页 |
| ·实验方法 | 第28-39页 |
| ·序列分析 | 第28页 |
| ·鞭毛染色实验 | 第28-29页 |
| ·运动性实验 | 第29页 |
| ·表达载体构建及过表达菌株筛选相关操作 | 第29-32页 |
| ·琼脂糖电泳 | 第32页 |
| ·苏云金芽胞杆菌RT-PCR相关操作 | 第32-34页 |
| ·鞭毛丝蛋白制备 | 第34-35页 |
| ·抗体制备及纯化 | 第35-37页 |
| ·Western blot | 第37-39页 |
| 3 结果与讨论 | 第39-55页 |
| ·生物信息学分析 | 第39-42页 |
| ·鞭毛合成基因簇的比较分析 | 第39-40页 |
| ·序列相似性比对 | 第40-42页 |
| ·调控基因flgM和sigD在基因组中定位分析 | 第42页 |
| ·CT-43鞭毛相关性状验证 | 第42-45页 |
| ·鞭毛染色和细菌运动性实验 | 第42-43页 |
| ·鞭毛相关基因的PCR检测 | 第43-45页 |
| ·工程菌构建 | 第45-49页 |
| ·表达载体的构建 | 第45-46页 |
| ·工程菌筛选 | 第46-49页 |
| ·鞭毛合成相关基因转录情况 | 第49-51页 |
| ·引物验证 | 第50页 |
| ·部分鞭毛结构基因和Ⅲ分泌系统基因的转录分析 | 第50-51页 |
| ·鞭毛丝蛋白表达检测 | 第51-55页 |
| ·抗体制备 | 第52-53页 |
| ·CT-43中鞭毛丝蛋白表达情况检测 | 第53-55页 |
| 4 总结与展望 | 第55-57页 |
| 第二章 砷氧化菌株Acidovorax sp.NO1的插入序列分析 | 第57-83页 |
| 1 前言 | 第57-67页 |
| ·可移动遗传因子 | 第57页 |
| ·插入序列 | 第57-61页 |
| ·插入序列的结构特性 | 第57-58页 |
| ·插入序列分类与命名 | 第58-61页 |
| ·食酸菌属 | 第61-65页 |
| ·食酸菌属的描述 | 第61-62页 |
| ·食酸菌属的研究概况 | 第62-64页 |
| ·食酸菌属的基因组测序情况 | 第64-65页 |
| ·Acidovorax sp.NO1 | 第65页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第65-67页 |
| 2 材料与方法 | 第67-68页 |
| ·实验材料 | 第67页 |
| ·实验方法 | 第67-68页 |
| ·基因组数据的获得 | 第67页 |
| ·插入序列的确认和分类 | 第67页 |
| ·进化分析 | 第67-68页 |
| 3 结果与讨论 | 第68-81页 |
| ·菌株NO1插入序列的分布与特性 | 第68-73页 |
| ·IS3家族 | 第68页 |
| ·IS5家族 | 第68页 |
| ·Tn3家族 | 第68-69页 |
| ·IS21家族 | 第69页 |
| ·IS66家族 | 第69页 |
| ·NO-1中其他家族的插入序列 | 第69-70页 |
| ·小结 | 第70-73页 |
| ·食酸菌属基因组中插入序列的分布与特性 | 第73-78页 |
| ·环境菌株中插入序列分析 | 第74-75页 |
| ·植物致病菌插入序列分析 | 第75-77页 |
| ·小结 | 第77-78页 |
| ·插入序列在食酸菌中的比较基因组研究 | 第78-81页 |
| ·已测序食酸菌基因组的MSLA进化分析 | 第78-79页 |
| ·IS3家族插入序列在食酸菌中的进化关系 | 第79-80页 |
| ·IS5家族的插入序列在食酸菌中的进化分析 | 第80-81页 |
| 4 总结与展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-90页 |
| 附录 | 第90-106页 |
| 致谢 | 第106页 |