| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-21页 |
| ·研究背景 | 第14-15页 |
| ·RNA 二级结构预测研究现状 | 第15-18页 |
| ·论文主要工作 | 第18-19页 |
| ·论文结构安排 | 第19-21页 |
| 第二章 RNA 二级结构预测 | 第21-43页 |
| ·RNA 生物学背景 | 第21-24页 |
| ·RNA 分子结构 | 第21-23页 |
| ·RNA 分类与功能 | 第23-24页 |
| ·RNA 序列结构 | 第24-31页 |
| ·RNA 序列结构分级 | 第24-26页 |
| ·RNA 二级结构 | 第26-28页 |
| ·假结结构 | 第28-31页 |
| ·带假结 RNA 二级结构预测算法 | 第31-42页 |
| ·比较序列分析方法 | 第31-32页 |
| ·最大权重匹配算法 | 第32-34页 |
| ·最小自由能量算法 | 第34-41页 |
| ·预测算法特点 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第三章 基于禁忌搜索的带假结 RNA 二级结构预测算法 | 第43-79页 |
| ·禁忌搜索算法介绍 | 第43-44页 |
| ·算法总述 | 第44-45页 |
| ·目标函数设计 | 第45-55页 |
| ·非假结结构自由能量计算 | 第46-51页 |
| ·H 型假结自由能量计算 | 第51-54页 |
| ·非 H 型假结自由能量计算 | 第54-55页 |
| ·初始化处理 | 第55-57页 |
| ·集中性搜索 | 第57-58页 |
| ·扩充性搜索 | 第58-60页 |
| ·循环迭代停止条件 | 第60页 |
| ·算法总流程 | 第60-61页 |
| ·算法实验对比 | 第61-78页 |
| ·测试序列与评价指标 | 第61-64页 |
| ·TSARNAP 参数取值选择 | 第64-67页 |
| ·预测算法比较 | 第67-78页 |
| ·本章小结 | 第78-79页 |
| 第四章 基于布谷鸟搜索的带假结 RNA 二级结构预测算法 | 第79-103页 |
| ·布谷鸟搜索算法介绍 | 第79-80页 |
| ·算法总述 | 第80-81页 |
| ·目标函数设计 | 第81-82页 |
| ·初始化处理 | 第82-83页 |
| ·鸟巢搜索 | 第83-84页 |
| ·弃蛋搜索 | 第84-85页 |
| ·算法运行终止条件 | 第85页 |
| ·算法总流程 | 第85-86页 |
| ·算法实验对比 | 第86-101页 |
| ·测试序列与实验方法 | 第86页 |
| ·CSARNAP 参数取值选择 | 第86-90页 |
| ·预测算法比较 | 第90-101页 |
| ·本章小结 | 第101-103页 |
| 第五章 结论 | 第103-105页 |
| ·论文工作总结 | 第103-104页 |
| ·后续工作展望 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-110页 |
| 攻硕期间取得的研究成果 | 第110-111页 |