| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| ·丝状噬菌体概述 | 第11-12页 |
| ·噬菌体展示技术 | 第12-14页 |
| ·噬菌体展示数据的信号与噪声 | 第14-15页 |
| ·噬菌体展示数据预处理研究进展 | 第15-16页 |
| ·本文的主要研究内容及结构安排 | 第16-17页 |
| 第二章 基于模体的靶位无关多肽检测工具 | 第17-24页 |
| ·模体收集 | 第17-19页 |
| ·靶位无关多肽检测工具 TUPScan | 第19-20页 |
| ·TUPScan 的开发 | 第19页 |
| ·TUPScan 的使用 | 第19-20页 |
| ·TUPScan 在 B 细胞表位预测中的应用 | 第20-23页 |
| ·测试数据集 | 第21页 |
| ·表位预测程序介绍 | 第21-22页 |
| ·表位预测结果分析 | 第22-23页 |
| ·TUPScan 在疫苗开发上的应用 | 第23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 基于模拟肽数据库的靶位无关多肽检测工具 | 第24-44页 |
| ·模拟肽数据库 MimoDB | 第24-34页 |
| ·MimoDB 结构设计 | 第24-28页 |
| ·MimoDB 数据采集 | 第28-29页 |
| ·MimoDB 升级历史 | 第29-30页 |
| ·MimoDB 数据统计 | 第30-32页 |
| ·MimoDB 用户界面 | 第32-34页 |
| ·基于数据库搜索的 TUP 检测工具 MimoSearch | 第34-36页 |
| ·基于数据库比对的 TUP 检测工具 MimoBlast | 第36-38页 |
| ·MimoDB 附带的两个工具 | 第38-42页 |
| ·基于模拟肽蛋白互作位点预测的标准测试集 MimoBench | 第38-41页 |
| ·标准测试集 MimoBench 构建 | 第38-39页 |
| ·蛋白质相互作用位点预测工具介绍 | 第39页 |
| ·预测工具的性能分析 | 第39-41页 |
| ·基于数据库的模体匹配工具 MimoScan | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 第四章 基于支持向量机的靶位无关多肽检测工具 | 第44-56页 |
| ·支持向量机 | 第44-45页 |
| ·特征编码模式 | 第45页 |
| ·预测效果评估方法 | 第45-46页 |
| ·增殖优势多肽预测工具 PhD7Faster | 第46-52页 |
| ·训练数据集 | 第46-47页 |
| ·多肽序列分析 | 第47-49页 |
| ·基于 SVM 的增殖优势多肽预测 | 第49-50页 |
| ·不同机器学习方法间的比较 | 第50-51页 |
| ·预测模型构建 | 第51页 |
| ·网络服务 | 第51-52页 |
| ·亲和素结合肽预测工具 Avidinbinder | 第52-55页 |
| ·训练数据集 | 第53页 |
| ·基于 SVM 的亲和素结合肽预测 | 第53-54页 |
| ·不同机器学习方法间的比较 | 第54页 |
| ·网络服务 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第五章 噬菌体展示实验数据的预处理工具包 SAROTUP | 第56-59页 |
| ·SAROTUP 网络服务平台 | 第56-57页 |
| ·SAROTUP 的输入标准和警告 | 第57-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 第六章 总结和展望 | 第59-61页 |
| ·全文总结 | 第59-60页 |
| ·后续工作展望 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 攻硕期间取得的研究成果 | 第68-69页 |
