| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-19页 |
| ·项目来源 | 第12页 |
| ·研究的背景和意义 | 第12-14页 |
| ·国内外的研究现状、水平和发展趋势 | 第14-17页 |
| ·论文主要工作 | 第17页 |
| ·论文结构安排 | 第17-19页 |
| 第2章 基于图形的 RNA 二级结构相似性分析及假结结构分析 | 第19-29页 |
| ·RNA 二级结构的表示方法 | 第19-21页 |
| ·RNA 二级结构及其子结构 | 第19-20页 |
| ·RNA 二级结构的表示方法 | 第20-21页 |
| ·RNA 二级结构的图形表示方法 | 第21-24页 |
| ·二维坐标轴的图形表示法 | 第21-22页 |
| ·三维坐标轴的图形表示法 | 第22-24页 |
| ·高维坐标轴的图形表示法 | 第24页 |
| ·基于图形的序列相似性分析 | 第24-26页 |
| ·特征矩阵 | 第25页 |
| ·矩阵不变量 | 第25-26页 |
| ·假结的结构分析 | 第26-28页 |
| ·假结的分类 | 第26-27页 |
| ·含假结 RNA 二级结构的弧图特征 | 第27-28页 |
| ·小结 | 第28-29页 |
| 第3章 一种新的 RNA 二级结构的 2D 图形表示方法及相似性分析 | 第29-41页 |
| ·引言 | 第29页 |
| ·RNA 二级结构及其子结构 | 第29-31页 |
| ·RNA 二级结构和子结构的数学定义 | 第29-30页 |
| ·RNA 二级结构的图形表示方法 | 第30-31页 |
| ·RNA 二级结构的图形表示方法 | 第31-35页 |
| ·RNA 二级结构的新图形 | 第31-33页 |
| ·新图形的特性 | 第33-35页 |
| ·RNA 二级结构的相似性分析 | 第35-39页 |
| ·RNA 二级结构的相似性分析算法 | 第35-36页 |
| ·实验数据 | 第36-37页 |
| ·RNA 二级结构的数字特征 | 第37-38页 |
| ·相似性分析 | 第38-39页 |
| ·小结 | 第39-41页 |
| 第4章 基于 RNA 二级结构弧图特征的图形表示方法及相似性分析 | 第41-57页 |
| ·引言 | 第41页 |
| ·基于 RNA 二级结构弧图语法的弧图特征 | 第41-48页 |
| ·弧图语法的相关概念 | 第41-42页 |
| ·弧的位置关系及其数学定义 | 第42-43页 |
| ·约简的 RNA 二级结构弧图语法双要素 | 第43-45页 |
| ·相邻弧的结构情形分析 | 第45-46页 |
| ·基于极大闭区间的孤图特征 | 第46-48页 |
| ·基于极大闭区间弧图特征的RNA二级结构图形表示方法 | 第48-53页 |
| ·RNA 二级结构特征区间 | 第48页 |
| ·含假结的 RNA 二级结构的新图形 | 第48-51页 |
| ·实验数据 | 第51-53页 |
| ·RNA 二级结构的相似性分析 | 第53-56页 |
| ·含假结 RNA 二级结构的数字特征 | 第53-54页 |
| ·实验结果与分析 | 第54-56页 |
| ·小结 | 第56-57页 |
| 结论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 附录A (攻读硕士学位期间所发表的学术论文目录) | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |