| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-27页 |
| 引言 | 第10页 |
| ·水稻纹枯病(rice sheath blight)研究进展 | 第10-12页 |
| ·水稻纹枯病菌介绍 | 第10-11页 |
| ·水稻纹枯病当前研究情况 | 第11-12页 |
| ·真菌基因组学研究现状 | 第12页 |
| ·转录组分析与重要功能基因的挖掘 | 第12-18页 |
| ·获取转录组的数据的主要方法 | 第13-14页 |
| ·RNA的测序平台 | 第14-18页 |
| ·RNA-seq的应用 | 第18页 |
| ·植物与病原物的互作 | 第18-26页 |
| ·植物与病原物互作中的基因-基因关系 | 第19-24页 |
| ·水稻纹枯病抗性研究 | 第24-26页 |
| ·糖基转移酶Glycosyltransferasee效应分子的研究 | 第26页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第26-27页 |
| 2. 水稻纹枯病菌AG-1IA中GT-2-like基因的功能及进化的初步研究 | 第27-35页 |
| ·实验材料 | 第27-28页 |
| ·菌株及载体 | 第27-28页 |
| ·实验方法 | 第28-35页 |
| ·菌株纯化、活化及培养 | 第28页 |
| ·主要试剂及试剂盒 | 第28页 |
| ·实验仪器及设备 | 第28-29页 |
| ·纹枯病菌AG 1IA总RNA提取、鉴定、胶回收纯化 | 第29-32页 |
| ·原核表达及功能验证 | 第32-35页 |
| 3 纹枯病菌抗感水稻转录组分析及抗性候选基因的筛选与功能验证 | 第35-42页 |
| ·实验材料 | 第35-37页 |
| ·水稻材料 | 第35页 |
| ·菌株及载体 | 第35页 |
| ·主要化学和分子试剂 | 第35页 |
| ·仪器设备 | 第35-36页 |
| ·细菌培养基 | 第36-37页 |
| ·实验方法 | 第37-42页 |
| ·水稻材料RNA的提取及质量检测 | 第37-38页 |
| ·RNA-seq测序 | 第38页 |
| ·基因表达差异分析流程 | 第38-39页 |
| ·抗性候选基冈筛选 | 第39页 |
| ·shr1-TQ全长基因克隆 | 第39-41页 |
| ·载体构建及检测 | 第41-42页 |
| 4 结果与分析 | 第42-51页 |
| ·AG1IA中GT-2-like的表达及功能验证 | 第42-45页 |
| ·AG1IA菌株RNA的提取 | 第42页 |
| ·原核表达载体构建 | 第42-44页 |
| ·SDS-PAGE及蛋白纯化 | 第44-45页 |
| ·GT-2-like基因的在四川地区的群体进化 | 第45-48页 |
| ·32株纹枯病菌的总RNA提取及RT-PCR | 第45-46页 |
| ·GT-2-like基因在各菌株中的存在情况,序列比对结果及进化分析 | 第46-48页 |
| ·水稻抗纹枯病抗性候选基因筛选及功能验证 | 第48-51页 |
| ·水稻RNA的提取 | 第48-49页 |
| ·抗性候选基因的获得 | 第49-51页 |
| 5 讨论 | 第51-52页 |
| ·基因组测序与生物信息学学分析在功能基因组研究中的应用 | 第51页 |
| ·effector在病原物侵染植物过程中的作用 | 第51页 |
| ·转录组分析的应用 | 第51-52页 |
| ·过量表达与基因干涉在植物功能基因研究中的应用 | 第52页 |
| 6 后续实验展望 | 第52-54页 |
| ·进一步对GT-2-like基因的研究 | 第52-53页 |
| ·水稻抗性基因方面 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
