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感染猪链球菌2型的猪脑组织转录组学分析

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略词表第10-11页
1 文献综述第11-20页
   ·猪链球菌2型研究进展第11-20页
     ·猪链球菌2型概述第12页
     ·猪链球菌2型致病机制研究进展第12-15页
       ·SS2的定植及其在血液中的散播第13-15页
   ·差异表达基因的研究方法第15-20页
     ·mRNA差异显示技术(mRNADD)第15-16页
     ·抑制性消减杂交技术(SSH)第16-17页
     ·基因表达系列分析技术(serial analysis of gene express,SAGE)第17-18页
     ·生物芯片技术(Biochip)第18-20页
2 研究目的与意义第20-21页
3 试验材料及方法第21-41页
   ·试验材料第21-24页
     ·菌种第21-22页
     ·实验动物第22页
     ·细胞系第22页
     ·主要试剂及药品第22-23页
     ·主要仪器第23-24页
     ·培养基及缓冲液配制第24页
   ·试验流程及方法第24-41页
     ·猪链球菌2型的培养第24页
     ·猪链球菌2型计数第24-25页
     ·仔猪人工感染实验第25页
     ·组织样采集和细菌血清型鉴定第25-26页
     ·RNA提取和芯片杂交第26-31页
       ·RNA提取第26页
       ·RNA纯化第26-27页
       ·cDNA第一链合成第27页
       ·cDNA第二链合成第27-28页
       ·双链cDNA纯化第28页
       ·生物素标记cRNA第28-29页
       ·cRNA纯化第29页
       ·cRNA片段化第29-30页
       ·芯片杂交第30页
       ·芯片清洗染色、扫描第30-31页
     ·差异表达基因的聚类分析第31页
     ·荧光定量基因PCR对芯片数据检验第31-34页
       ·荧光定量PCR基本原理第32页
       ·RNA提取第32页
       ·cDNA合成第32-33页
       ·引物的设计合成第33页
       ·cDNAPCR扩增鉴定和RNA样品中DNA检测第33-34页
       ·荧光定量反应第34页
     ·差异表达基因功能分析第34页
     ·差异表达基因在细胞水平中的荧光定量分析第34-36页
       ·细菌培养第34页
       ·猪肺上皮细胞(JSPLC)培养第34-35页
       ·细菌与细胞的相互作用第35页
       ·RNA提取第35页
       ·cDNA合成第35-36页
       ·引物的设计与合成第36页
       ·DNA去除第36页
       ·差异表达基因在细胞水平的荧光定量分析第36页
     ·差异表达基因真核表达载体的构建第36-41页
       ·引物设计与合成第36-37页
       ·目的基因扩增第37页
       ·PCR产物回收及纯化第37-38页
       ·目的基因TA克隆第38页
       ·感受态制备第38页
       ·连接产物及质粒的转化第38页
       ·质粒的小量制备第38页
       ·重组质粒的鉴定第38页
       ·真核质粒pcDNA3.1—ODC和pcDNA3.1—P38的构建第38-41页
4 试验结果与分析第41-52页
   ·仔猪发病症状第41页
   ·组织样品采集和分离菌的鉴定第41页
   ·RNA质量检测及芯片杂交第41-43页
   ·芯片杂交结果第43-44页
   ·差异表达基因的聚类分析第44-45页
   ·芯片结果的荧光定量PCR验证第45-46页
   ·差异表达基因的功能分析第46-50页
     ·差异表达基因GO和pathway分析第46-48页
     ·差异表达基因分析第48-50页
   ·差异表达基因在细胞水平的荧光定量分析第50页
   ·ODC和P38真核表达载体的构建第50-52页
5 讨论第52-54页
6 全文小结第54-55页
参考文献第55-65页
致谢第65页

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