| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一部分 前言 | 第10-21页 |
| 1 线粒体基本特征 | 第10-11页 |
| 2 动物线粒体基因组基本特征 | 第11-12页 |
| 3 线粒体基因组的研究策略 | 第12-13页 |
| 4 自然选择检测与线粒体DNA的相对进化速率 | 第13-16页 |
| 5 直翅目(Orthoptera)昆虫概况及研究进展 | 第16-19页 |
| ·直翅目简介 | 第16页 |
| ·直翅目分类 | 第16-17页 |
| ·蜢总科简介 | 第17-19页 |
| 6 研究目的和意义 | 第19-21页 |
| 第二部分 实验材料与研究方法 | 第21-35页 |
| 1 实验材料 | 第21-23页 |
| ·实验标本的采集、保存与鉴定 | 第21页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第21-23页 |
| ·生物软件及统计学软件 | 第23页 |
| 2 试验方法 | 第23-28页 |
| ·总DNA提取 | 第23-24页 |
| ·总DNA检测 | 第24页 |
| ·PCR引物设计与扩增 | 第24-28页 |
| 3 数据处理及分析 | 第28-29页 |
| 4 直翅目昆虫系统发育研究 | 第29-33页 |
| ·序列数据来源 | 第29-31页 |
| ·整理数据 | 第31页 |
| ·序列组成分析 | 第31页 |
| ·检测系统发育信号 | 第31-32页 |
| ·构建系统树的方法 | 第32-33页 |
| 5 计算相对进化速率 | 第33-35页 |
| ·数据集划分 | 第33页 |
| ·非同义替换与同义替换比值(Ka/Ks)的计算 | 第33-34页 |
| ·统计学处理 | 第34-35页 |
| 第三部分 实验结果 | 第35-38页 |
| 1 总DNA的提取 | 第35页 |
| 2 Long-PCR扩增结果 | 第35-36页 |
| 3 sub-PCR扩增结果 | 第36-37页 |
| 4 序列组装 | 第37-38页 |
| 第四部分 郑氏比蜢线粒体基因组分析结果 | 第38-47页 |
| 1 线粒体基因组结构以及基因排列顺序 | 第38页 |
| 2 线粒体基因组碱基组成 | 第38-42页 |
| 3 蛋白编码基因中密码子使用情况 | 第42页 |
| 4 tRNA二级结构 | 第42-43页 |
| 5 rRNA二级结构 | 第43-46页 |
| 6 A+T丰富区 | 第46-47页 |
| 第五部分 郑氏比蜢线粒体基因组的分析和讨论 | 第47-51页 |
| 1 基因排列顺序 | 第47页 |
| 2 tRNA二级结构 | 第47-48页 |
| 3 rRNA二级结构 | 第48-50页 |
| 4 A+T富集区 | 第50-51页 |
| 第六部分 直翅目系统发育关系 | 第51-73页 |
| 1 联合数据集的序列组成分析 | 第51页 |
| 2 替换饱和性分析 | 第51-54页 |
| 3 gl检验与PTP检验 | 第54-56页 |
| 4 系统发育分析结果 | 第56-71页 |
| ·最大简约法建树 | 第56-57页 |
| ·最大似然法建树 | 第57-58页 |
| ·贝叶斯建树 | 第58-71页 |
| 5 系统发育分析讨论 | 第71-73页 |
| 第七部分 相对进化速率的计算与分析 | 第73-83页 |
| 1 相对速率计算结果 | 第73-79页 |
| 2 讨论 | 第79-83页 |
| ·三种翅型昆虫的相对进化速率关系 | 第79-81页 |
| ·三种生态型昆虫的相对进化速率关系 | 第81-83页 |
| 第八部分 结论 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第92页 |