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木聚糖酶蛋白质序列分析、分子进化和分子模拟

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-11页
第一章 绪论第11-45页
   ·木聚糖酶和半纤维素第11-13页
   ·木聚糖酶的应用第13-17页
     ·在纸浆造纸工业中应用第13-14页
     ·在动物饲料中的应用第14页
     ·在食品工业中的应用第14-15页
     ·在烘焙食品中的应用第15页
     ·与植物的防御反应有关第15页
     ·在制备功能性低聚糖中的应用第15-16页
     ·在转化环境友好燃料-乙醇中的应用第16页
     ·在临床上同酶-过敏原相关第16页
     ·其它方面的应用第16-17页
   ·木聚糖酶的分类和结构第17-20页
   ·木聚糖酶的作用机理第20-24页
   ·木聚糖酶基因的调节第24页
   ·木聚糖酶工程第24-31页
     ·氨基酸修饰在木聚糖酶活性位点研究中的应用第25-26页
     ·定点突变(SDM)在结构-功能分析中的应用第26-27页
     ·定点突变(SDM)在改造木聚糖酶性质方面的应用第27页
     ·蛋白质工程在木聚糖酶pH值方面的研究第27-28页
     ·蛋白质工程在木聚糖酶热稳定性方面的研究第28-31页
   ·目前的问题第31-33页
     ·木聚糖酶作用温度第31页
     ·木聚糖酶作用pH值第31-32页
     ·底物特异性第32页
     ·木聚糖酶活性和产量第32-33页
   ·研究内容第33-34页
 参考文献第34-45页
第二章 木聚糖酶数据库的构建第45-57页
   ·木聚糖酶蛋白质序列的收集第45-46页
   ·木聚糖酶最适pH值和最适温度的收集第46-50页
   ·木聚糖酶三维结构数据的收集第50-51页
 参考文献第51-57页
第三章 木聚糖酶氨基酸二联体同最适温度的关系第57-85页
   ·前言第57-59页
     ·木聚糖酶最适温度在工业应用中的作用第57页
     ·酶热稳定性的研究第57-58页
     ·木聚糖酶最适温度的选择第58-59页
   ·材料和方法第59-60页
   ·F/10家族木聚糖酶氨基酸二联体同最适温度的关系第60-68页
     ·结果第60-64页
       ·F/10 木聚糖酶进化树的分析第60-62页
       ·最优回归方程第62页
       ·方程有效性和最大/最小温度的计算第62-64页
     ·讨论第64-66页
       ·对单个氨基酸的分析第64-65页
       ·对氨基酸二联体的分析第65-66页
     ·与F/10木聚糖酶最适温度有关的氨基酸二联体在空间结构中的位置第66-67页
     ·小结第67-68页
   ·G/11 家族木聚糖酶氨基酸二联体同最适温度的关系第68-77页
     ·结果第70-72页
       ·对G/11木聚糖酶进化树的分析第70页
       ·最优回归方程第70-71页
       ·方程有效性和最大/最小温度的计算第71-72页
     ·讨论第72-75页
       ·对单个氨基酸的分析第73-74页
       ·对氨基酸二联体的分析第74-75页
     ·与G/11木聚糖酶最适温度有关的氨基酸二联体在空间结构中的位置第75-77页
   ·两个木聚糖酶家族之间的比较第77页
   ·结论第77-78页
 参考文献第78-85页
第四章 木聚糖酶氨基酸二联体同最适pH 的关系第85-106页
   ·前言第85-86页
     ·木聚糖酶最适pH值在工业应用中的作用第85页
     ·对酶pH值的研究第85-86页
   ·材料和方法第86-87页
   ·F/10家族木聚糖酶氨基酸二联体同最适pH值的关系第87-94页
     ·结果第87-89页
       ·最优回归方程第87-88页
       ·方程的有效性和最大/最小pH值的计算第88-89页
     ·讨论第89-91页
       ·对单个氨基酸的分析.第89页
       ·对氨基酸二联体的分析.第89-91页
     ·与F/10 木聚糖酶最适pH 有关的氨基酸二联体在空间结构中的位置第91-93页
     ·回归方程的应用第93-94页
     ·小结第94页
   ·G/11 家族木聚糖酶氨基酸二联体同最适pH 值的关系第94-100页
     ·结果第94-96页
       ·最优回归方程第95页
       ·方程的有效性和最大/最小pH值的计算第95-96页
     ·讨论第96-97页
       ·对于单个氨基酸的分析第96-97页
       ·对于氨基酸二联体的分析第97页
     ·与G/11 木聚糖酶最适pH 有关的氨基酸在空间结构中的位置第97-98页
     ·两个木聚糖酶家族之间的比较第98页
     ·结论第98-100页
 参考文献第100-106页
第五章 主成分分析对F/10 和G/11 木聚糖酶的分类第106-115页
   ·前言第106页
   ·材料和方法第106-108页
     ·数据库的构建第106-107页
     ·氨基酸含量和主成分的计算第107页
     ·构建鉴别方程第107页
     ·方程的检验第107-108页
   ·结果和讨论第108-112页
     ·主要成分第108页
     ·鉴别方程第108页
     ·方程的有效性第108-112页
     ·主成分的意义第112页
   ·结论第112-113页
 参考文献第113-115页
第六章 木聚糖酶的分子进化第115-126页
   ·前言第115页
   ·材料和方法第115-116页
     ·数据库的构建第115-116页
     ·进化树的构建第116页
     ·木聚糖酶空间结构图的构建第116页
   ·结果和讨论第116-121页
     ·F/10 木聚糖酶家族分子进化第116-119页
     ·G/11 木聚糖酶家族分子进化第119-120页
     ·两个木聚糖酶家族之间的比较第120-121页
   ·结论第121-123页
 参考文献第123-126页
第七章 对海栖热袍菌木聚糖酶B 的分子结构模拟第126-148页
   ·分子模拟概述第126-127页
   ·海栖热袍菌木聚糖酶B第127-129页
     ·木聚糖酶B 的蛋白质序列第127-128页
     ·信号肽分析第128-129页
   ·海栖热袍菌木聚糖酶B 的分子模拟第129-134页
     ·分子模拟界面第129页
     ·递交需要模拟的蛋白质序列第129-131页
     ·寻找构建分子结构的模板第131页
     ·产生批处理文件第131-132页
     ·分子结构的组装第132页
     ·结构的优化第132页
     ·模拟结构的发送第132-134页
   ·对模拟的木聚糖酶B 结构分析第134-135页
   ·二级结构结构含量同木聚糖酶最适温度之间的关系第135-138页
   ·木聚糖酶B 活性中心第138-141页
     ·活性中心的查找第138-140页
     ·对已知结构F/10 木聚糖酶序列比对检查活性中心第140-141页
     ·活性中心在蛋白质结构中的位置第141页
   ·蛋白质分子模拟中的问题第141-144页
     ·模板选择第142页
     ·序列相似性较低的问题第142-143页
     ·结构的优化第143-144页
 参考文献第144-148页
缩略语第148-149页
致谢第149-151页
博士期间发表文章第151-152页

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