木薯抗寒性的表达谱分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 1 序言 | 第10-20页 |
| ·木薯抗寒研究进展 | 第10-14页 |
| ·木薯概述 | 第10-11页 |
| ·植物的寒害介绍 | 第11页 |
| ·寒害与植物生理的关系 | 第11-12页 |
| ·植物寒害的生理变化 | 第12-13页 |
| ·植物抗寒基因工程研究进展 | 第13-14页 |
| ·表达谱分析进展 | 第14-19页 |
| ·基因芯片 | 第14-15页 |
| ·测序技术概述 | 第15-18页 |
| ·数据分析 | 第18-19页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-26页 |
| ·植物的材料及其低温处理 | 第20页 |
| ·RNA的提取 | 第20-21页 |
| ·测序实验 | 第21-22页 |
| ·测序流程 | 第21-22页 |
| ·精密仪器和药品规格 | 第22页 |
| ·统计分析 | 第22-23页 |
| ·原始序列数据 | 第22-23页 |
| ·数据处理的步骤 | 第23页 |
| ·标签的基因注释 | 第23页 |
| ·转录本的组装与注释 | 第23-24页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第24页 |
| ·Gene Ontology功能富集分析 | 第24-25页 |
| ·pathway富集显著性分析 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-64页 |
| ·RNA提取质量检测 | 第26页 |
| ·测序评估 | 第26-28页 |
| ·Clean Tag拷贝数及种类分布统计 | 第28-31页 |
| ·Tag基因功能注释 | 第31-32页 |
| ·差异基因的筛选 | 第32-34页 |
| ·表达模式聚类分析 | 第34-37页 |
| ·Gene Ontology功能富集 | 第37-49页 |
| ·Pathway差异显著性分析 | 第49-64页 |
| 4 讨论 | 第64-69页 |
| ·木薯RNA提取的探讨 | 第64页 |
| ·Tag与转录本注释的探讨 | 第64页 |
| ·关于低温胁迫下木薯叶片和块根差异表达基因丰度 | 第64-65页 |
| ·显著性差异分析及pathway分析的探讨 | 第65页 |
| ·与抗寒相关的基因表达探讨 | 第65-67页 |
| ·GO富集分析与表达模式聚类的探讨 | 第67-68页 |
| ·本研究的不足以及进一步研究的思路 | 第68-69页 |
| 5 结论 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
