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海南四种植原体病害病原的分子鉴定及长春花相关病害植原体质粒、sec基因分析

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
1. 序言第12-18页
   ·植原体病害研究第12-15页
     ·植原体病害的发现及命名第12页
     ·植原体的主要特征第12-13页
     ·植原体病害的传播途径第13页
     ·植原体病害的症状及危害第13页
     ·植原体的分类鉴定依据第13-14页
       ·根据生物学特性的分类第13页
       ·根据16S rRNA和rp分组第13-14页
       ·基于延伸因子tuf基因的分类第14页
       ·基于Sec基因的分类第14页
     ·植原体病害的检测方法第14-15页
     ·植原体质粒研究第15页
     ·植原体病害的防治第15页
   ·长春花相关植原体病害研究进展第15-16页
     ·长春花小叶病研究现状第16页
     ·长春花黄化病研究现状第16页
     ·长春花变叶病研究现状第16页
   ·本研究的目的和意义第16-18页
2. 海南四种植原体病害病原的分子鉴定第18-35页
   ·材料与方法第18-24页
     ·材料第18-20页
       ·样品的采集第18页
       ·菌株和质粒第18页
       ·生化及分子生物学试剂第18页
       ·缓冲液及培养基配方第18-19页
       ·主要实验仪器第19-20页
     ·方法第20-24页
       ·植物总DNA提取第20-21页
       ·植原体16S rDNA基因的PCR扩增第21-22页
       ·PCR产物的克隆及测序第22-24页
       ·序列分析软件第24页
   ·结果与分析第24-34页
     ·辣椒小叶病病原分子鉴定第24-25页
       ·辣椒小叶病的田间症状表现第24-25页
       ·辣椒小叶病的PCR第25页
     ·胡椒黄化病病原分子鉴定第25-27页
       ·胡椒黄化病的田间症状表现第25-26页
       ·胡椒黄化病的PCR第26-27页
     ·假花生黄化病病原分子鉴定第27-28页
       ·假花生黄化病的田间症状表现第27页
       ·假花生黄化病的PCR第27-28页
     ·木薯丛枝病病原分子鉴定第28-29页
       ·木薯丛枝病的田间表现第28-29页
       ·木薯丛枝病PCR第29页
     ·序列分析第29-30页
     ·构建系统进化树第30页
     ·RFLP电子酶切图谱分析第30-34页
   ·讨论第34-35页
3. 植原体质粒DNA克隆及其分子特征第35-54页
   ·材料与方法第35-39页
     ·材料第35页
       ·样品的采集第35页
       ·菌株和质粒第35页
       ·生化及分子生物学试剂第35页
       ·缓冲液及培养基配方第35页
       ·主要实验仪器第35页
     ·方法第35-39页
       ·植物总DNA提取第35页
       ·植原体质粒的第一次PCR扩增第35-36页
       ·植原体质粒的第二次PCR扩增第36页
       ·PCR产物的克隆及测序第36页
       ·序列分析第36-37页
       ·pPLLHn-1ORF3基因的克隆第37-38页
       ·pPLLHn-1ORF4基因的克隆第38页
       ·pPLLHn-1ORF3表达载体的构建及验证第38-39页
   ·结果与分析第39-52页
     ·pPLLHn-1的克隆第39页
     ·pPLLHn-1的序列特征第39-40页
     ·pPLLHn-1编码的蛋白同源性比较第40-41页
     ·pPLLHn-1编码的蛋白特征预测第41-45页
       ·质粒编码蛋白跨膜结构预测第41-42页
       ·质粒蛋白亚细胞定位预测第42-45页
     ·质粒DNA全序列的系统进化分析第45页
     ·植原体质粒的变异分析第45-49页
       ·质粒数目的变异第45-48页
       ·质粒编码的RepA基因的变异分析第48页
       ·质粒编码的SSB基因的变异分析第48-49页
     ·pPLLHn-1ORF3基因的克隆第49-50页
     ·pPLLHn-1ORF4基因的克隆第50页
     ·PBI121-pPLLHn1ORF3表达载体的构建及验证第50-52页
       ·PBI121-pPLLHn1ORF3表达载体的酶切验证第50-52页
       ·PBI121-pPLLHn1ORF3表达载体的PCR验证第52页
   ·讨论第52-54页
4. 植原体secA与secY基因的克隆与分析第54-64页
   ·材料与方法第54-57页
     ·材料第54页
       ·样品的采集第54页
       ·菌株和质粒第54页
       ·生化及分子生物学试剂第54页
       ·缓冲液及培养基配方第54页
       ·主要实验仪器第54页
     ·方法第54-57页
       ·植物总DNA提取第54页
       ·长春花小叶病植原体secY基因的PCR扩增第54-55页
       ·长春花小叶病植原体secA基因的PCR扩增第55页
       ·长春花黄化病植原体secY基因的PCR扩增第55-56页
       ·长春花黄化病植原体secA基因的PCR扩增第56页
       ·PCR产物的克隆及测序第56-57页
       ·序列分析第57页
   ·结果与分析第57-63页
     ·长春花小叶病植原体secY基因和secA基因的克隆与序列分析第57-60页
       ·长春花小叶病植原体secY基因的克隆与序列分析第57-58页
       ·长春花小叶病植原体secA基因的克隆与序列分析第58-59页
       ·长春花小叶病植原体secY基因的生物信息学分析第59-60页
       ·长春花小叶病植原体secA基因的生物信息学分析第60页
     ·长春花黄化病植原体secY基因和secA基因的克隆与序列分析第60-63页
       ·长春花黄化病植原体secY基因的克隆与序列分析第60-61页
       ·长春花黄化病植原体secA基因的克隆与序列分析第61-62页
       ·长春花黄化病植原体secY基因的生物信息学分析第62页
       ·长春花黄化病植原体secA基因的生物信息学分析第62-63页
   ·讨论第63-64页
5. 结论第64-65页
致谢第65-66页
硕士期间发表的学术论文第66-67页
附录一 英文缩略表第67-70页
附录二 23个疑似植原体病害样品的症状表现及采集地第70-73页
参考文献第73-76页

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