| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第6-16页 |
| 1．1． 紫膜和菌紫质的结构和光循环 | 第6-9页 |
| 1．2． 质子通道 | 第9-11页 |
| 1．3． 质子跨膜运动步骤 | 第11-13页 |
| 1．4． 光循环过程中BR的结构变化 | 第13-14页 |
| 1．5． 质子转移过程中的静电牵引（electrostatic steering）作用 | 第14-16页 |
| 第二章 基于事件概念的生物光色素分子光循环过程的描述 | 第16-24页 |
| 2．1． 归属于生物光色素光循环的事件及其之间的关系 | 第16-18页 |
| 2．2． 光循环事件间的转移及其以事件为基础的光循环表达 | 第18-24页 |
| 2．2．1． 光循环基本事件间的转移 | 第18-19页 |
| 2．2．2． 光循环中的并联事件及光循环事件 | 第19-21页 |
| 2．2．3． 以事件为基础的生物光色素光循环模型 | 第21-24页 |
| 2．2．3．1． 生物光色素光循环的事件关系模型 | 第21页 |
| 2．2．3．2． 生物光色素光循环的事件密度动力学模型 | 第21-24页 |
| 第三章 以PH调控的菌紫质光循环的事件模型 | 第24-34页 |
| 3．1． 不同PH环境下的菌紫质光循环的基本事件 | 第24-27页 |
| 3．2． 以PH调控的菌紫质光循环事件 | 第27-28页 |
| 3．3． 以PH调控的菌紫质光循环事件密度动力学模型 | 第28-30页 |
| 3．4． 以PH调控的菌紫质光循环事件关系模型和事件框图模型 | 第30-34页 |
| 第四章 菌紫质事件密度动力学模型的光照响应 | 第34-54页 |
| 4．1． 方法与模型 | 第34-39页 |
| 4．1．1． PH和温度参数的选取 | 第34页 |
| 4．1．2． 光循环事件密度向量 | 第34页 |
| 4．1．3． 建立M矩阵 | 第34-36页 |
| 4．1．4． 建立微分方程组 | 第36-39页 |
| 4．1．4．1． 脉冲光照情形 | 第36-37页 |
| 4．1．4．2． 持续光照情形 | 第37-39页 |
| 4．1．5． 动力学速率系数K的来源、计算程序的编写和程序的运算 | 第39页 |
| 4．2． 菌紫质事件密度动力学模型对脉冲光照响应及其讨论 | 第39-46页 |
| 4．3． 菌紫质事件密度动力学模型对持续光照的响应及其讨论 | 第46-54页 |
| 第五章 不同脉冲宽度下菌紫质光循环的动力学特性研究 | 第54-61页 |
| 5．1． 方法与模型 | 第54-56页 |
| 5．1．1． 参数选取 | 第54页 |
| 5．1．2． 光循环事件密度向量，M矩阵及计算程序 | 第54-56页 |
| 5．2． 结果与讨论 | 第56-61页 |
| 第六章 菌紫质光循环过程事件密度的时段FFT分析 | 第61-72页 |
| 6．1． 方法和模型 | 第61-62页 |
| 6．2． 结果与讨论 | 第62-72页 |
| 结束语 | 第72-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-78页 |
