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植物防御素的生物信息学分析及葡萄防御素基因的克隆

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 前言第11-12页
第二章 植物防御素的研究进展概述第12-21页
   ·植物防御素的结构特点及分类第12-15页
     ·植物防御素的氨基酸组成第12页
     ·植物防御素的空间结构第12-14页
     ·植物防御素的分类第14-15页
   ·植物防御素的合成及表达第15-16页
     ·植物防御素的生物合成第15页
     ·植物防御素的表达及调控第15-16页
   ·植物防御素的产生机理和作用机制第16-18页
     ·植物防御素的产生机理第16-17页
     ·植物防御素的作用机制第17-18页
   ·拟南芥中的植物防御素第18-20页
   ·植物防御素的基因工程研究第20-21页
第三章 植物防御素基因的预测和序列分析第21-26页
   ·数据的获得方法第22页
   ·结果与讨论第22-26页
     ·植物中预测出的防御素基因特征第22-23页
     ·植物防御素的信号肽分析第23页
     ·植物防御素基因间的氨基酸序列比对第23-24页
     ·不同植物间防御素的进化关系第24-26页
第四章 葡萄防御素的生物信息学分析第26-40页
   ·分析方法第26页
   ·结果与讨论第26-40页
     ·葡萄防御素核苷酸序列及其推导的氨基酸序列的组成和理化性质第26-27页
     ·葡萄防御素氨基酸序列翻译后的磷酸化修饰预测第27-28页
     ·信号肽的预测和分析第28-30页
     ·葡萄防御素氨基酸序列疏水性/亲水性的预测和分析第30-31页
     ·不同葡萄防御素跨膜结构域的预测和分析第31-33页
     ·葡萄防御素的二级结构预测第33页
     ·葡萄防御素功能结构域分析第33-34页
     ·葡萄防御素的基因组信息第34-35页
     ·四种葡萄防御素的电子表达谱分析第35-36页
     ·葡萄防御素与拟南芥防御素氨基酸序列的同源性比较第36页
     ·葡萄防御素与拟南芥防御素2 家族的内含子序列比较第36-37页
     ·葡萄防御素启动子分析第37-40页
第五章 葡萄防御素的克隆第40-50页
   ·实验材料第40-41页
     ·植物材料第40页
     ·主要药品第40页
     ·主要试剂及溶液配制第40-41页
     ·主要仪器第41页
   ·实验方法第41-47页
     ·葡萄各器官 RNA 提取第41-42页
     ·RNA 的纯化第42页
     ·DNA 的消化第42-43页
     ·RNA 反转录成cDNA第43-44页
     ·引物设计第44页
     ·PCR 扩增第44-45页
     ·凝胶回收第45页
     ·连接反应第45-46页
     ·大肠杆菌感受态的制备第46页
     ·转化反应第46-47页
     ·菌液 PCR第47页
     ·质粒的提取第47页
   ·结果与讨论第47-50页
     ·RNA 提取第47-48页
     ·PCR 结果第48-49页
     ·转化的平板第49页
     ·测序结果第49页
     ·质粒提取结果第49-50页
第六章 全文总结第50-52页
参考文献第52-57页
附录第57-86页
 附录1 115 种植物防御素基因的特征及它们的序列分析第57-68页
 附录2 植物防御素基因间的氨基酸序列比对第68-70页
 附录3 葡萄防御素氨基酸序列翻译后的磷酸化修饰预测第70-71页
 附录4 葡萄防御素氨基酸序列信号肽的预测分析第71-72页
 附录5 葡萄防御素的疏水性/亲水性预测第72-73页
 附录6 葡萄防御素二级结构的预测第73-74页
 附录7 葡萄防御素的内含子序列第74-76页
 附录8 VvPDF1 和VvPDF2 在1 号染色体上的位置比较第76-77页
 附录9 拟南芥防御素2 家族基因内含子序列第77-78页
 附录10 葡萄防御素启动子分析第78-83页
 附录11 葡萄防御素基因的测序结果第83-86页
致谢第86页

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