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玉米低磷胁迫响应miRNA及其靶基因的鉴定与功能研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 文献综述第10-28页
    1.1 miRNA的发现第10页
    1.2 miRNA的生物合成及作用方式第10-12页
    1.3 影响作物性状关键miRNA的发现和鉴定第12-13页
    1.4 miRNA功能研究的主要手段第13-16页
        1.4.1 amiRNA(artificial miRNA)技术第13-14页
        1.4.2 串联短片段靶标模拟(short tandem target mimic,STTM)技术第14-15页
        1.4.3 CRISPR/Cas9 基因编辑技术第15-16页
    1.5 参与调控农作物性状的miRNA第16-24页
        1.5.1 调控作物株型的miRNA第16-18页
        1.5.2 调控作物花期的miRNA第18-19页
        1.5.3 调控作物育性的miRNA第19-20页
        1.5.4 调控作物种子/果实发育的miRNA第20-22页
        1.5.5 调控作物抗逆性状形成的miRNA第22-23页
        1.5.6 调控作物其他性状的miRNA第23-24页
    1.6 缺磷对玉米的影响第24页
    1.7 植物缺磷胁迫适应研究进展第24-26页
        1.7.1 响应缺磷胁迫的miRNA第25页
        1.7.2 植物中响应缺磷胁迫的基因第25-26页
    1.8 研究目的与意义第26-27页
    1.9 技术路线第27-28页
第2章 材料与方法第28-38页
    2.1 实验材料第28-29页
        2.1.1 植物材料第28页
        2.1.2 试剂第28-29页
        2.1.3 仪器第29页
    2.2 实验方法第29-38页
        2.2.1 水培玉米第29-31页
        2.2.2 RNA提取第31页
        2.2.3 small RNA library的构建第31-33页
        2.2.4 玉米转录组的高通量测序第33页
        2.2.5 转录组生物信息学分析第33-34页
        2.2.6 Northern blot第34-36页
        2.2.7 反转录第36页
        2.2.8 实时荧光定量PCR(q PCR)第36-38页
第3章 实验结果与分析第38-59页
    3.1 缺磷胁迫对玉米幼苗生长的影响第38-39页
    3.2 mRNA-seq分析第39-52页
        3.2.1 测序数据质量评估第39-41页
        3.2.2 差异表达基因分析第41-42页
        3.2.3 差异表达基因GO注释及富集分析第42-47页
        3.2.4 差异表达基因时空特异性分析第47-49页
        3.2.5 响应缺磷胁迫相关的GO term第49-50页
        3.2.6 RT-qPCR验证响应缺磷胁迫的基因第50-52页
    3.3 small RNA-seq分析第52-59页
        3.3.1 小RNA测序数据质量评估第52-53页
        3.3.2 小RNA长度分布第53-54页
        3.3.3 差异表达miRNA的筛选第54-55页
        3.3.4 差异表达miRNA的验证第55页
        3.3.5 miRNA靶基因的预测及验证第55-59页
第4章 讨论第59-62页
参考文献第62-73页
附录第73-94页
致谢第94页

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