基于随机微分方程和结构EM算法的系统发生树的构建
中文摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-6页 |
第一章 序言 | 第6-13页 |
·生物背景知识的介绍 | 第6-9页 |
·序列间距离的确定 | 第9-10页 |
·基于序列比对 | 第9页 |
·基于统计的方法 | 第9-10页 |
·基于距离构建系统发生树的方法 | 第10-13页 |
·非加权分组平均法 | 第11页 |
·邻近加入法 | 第11-13页 |
第二章 随机微分方程和 EM 算法 | 第13-17页 |
·随机微分方程 | 第13-15页 |
·EM 算法 | 第15-17页 |
·EM 算法的步骤 | 第15-16页 |
·EM 算法的收敛性 | 第16-17页 |
第三章 基于随机微分方程的系统发生树的构建 | 第17-22页 |
·模型的建立 | 第17-19页 |
·对随机微分方程的求解 | 第19-22页 |
·Gibbs 抽样方法 | 第20页 |
·用Gibbs 抽样求解随机微分方程 | 第20-22页 |
第四章 基于结构 EM 算法的系统发生树的构建 | 第22-29页 |
·结构EM 算法的思想 | 第22-23页 |
·似然函数的确定 | 第23-26页 |
·结构已知时的系统发生树的似然函数的确定 | 第24-25页 |
·滑轮原则 | 第25-26页 |
·用结构EM 算法构建系统发生树 | 第26-29页 |
第五章 结论与研究 | 第29-30页 |
参考文献 | 第30-32页 |
致谢 | 第32页 |