生物信息学中序列比对问题研究
| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 1 绪论 | 第8-15页 |
| ·研究背景 | 第8-13页 |
| ·生物信息学概述 | 第8-11页 |
| ·相关背景知识 | 第11-13页 |
| ·序列比对及研究意义 | 第13-14页 |
| ·文章的主要内容 | 第14-15页 |
| 2 序列比对 | 第15-39页 |
| ·序列比对的相关概念 | 第15-24页 |
| ·序列比对定义 | 第15-16页 |
| ·序列比对分类 | 第16页 |
| ·打分方案 | 第16-23页 |
| ·同源序列 | 第23-24页 |
| ·进化树 | 第24页 |
| ·双序列比对问题 | 第24-33页 |
| ·双序列比对描述 | 第24-26页 |
| ·双序列比对算法 | 第26-33页 |
| ·多序列比对问题 | 第33-39页 |
| ·多序列比对描述 | 第33-34页 |
| ·多序列比对算法 | 第34-39页 |
| 3 基于片段对和动态规划的双序列比对算法 | 第39-45页 |
| ·相关定义 | 第39-40页 |
| ·算法的基本思想 | 第40页 |
| ·算法描述 | 第40-45页 |
| ·基本步骤 | 第40-42页 |
| ·算法流程图 | 第42页 |
| ·主要过程实例图示 | 第42-45页 |
| 4 双序列点阵图比对系统DotWin | 第45-54页 |
| ·前言 | 第45-46页 |
| ·快速比对的策略和主要步骤 | 第46页 |
| ·开发及运行环境 | 第46页 |
| ·系统功能 | 第46-52页 |
| ·文件操作模块 | 第46-48页 |
| ·点阵图计算模块 | 第48页 |
| ·局部放大模块 | 第48-50页 |
| ·参数设置模块 | 第50-51页 |
| ·自动查找模块 | 第51页 |
| ·其他功能 | 第51-52页 |
| ·主要计算参数设置说明 | 第52-54页 |
| ·tuple的计算和设置 | 第52-53页 |
| ·替换矩阵 | 第53-54页 |
| 总结与讨论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 硕士在读期间发表和待发表的论文 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
