| 缩写词表 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-16页 |
| 第一章 前言 | 第16-39页 |
| 1 深海微生物研究的概况 | 第17-21页 |
| 2 微生物呼吸作用的多样性及其意义 | 第21-24页 |
| ·微生物呼吸作用的多样性 | 第21-23页 |
| ·微生物呼吸作用的重要意义 | 第23-24页 |
| 3 微生物以DMSO为终末电子受体的厌氧呼吸的研究概况 | 第24-37页 |
| ·钼氧转移酶的分类 | 第24-26页 |
| ·钼氧转移酶的定义 | 第25页 |
| ·钼氧转移酶的分类 | 第25-26页 |
| ·古菌中DMSO厌氧呼吸机制的研究概况 | 第26-27页 |
| ·细菌的DMSO厌氧呼吸机制的研究概况 | 第27-34页 |
| ·大肠杆菌的DMSO厌氧呼吸机制的研究 | 第27-29页 |
| ·球形红细菌的DMSO厌氧呼吸机制的研究 | 第29-31页 |
| ·希瓦氏菌的DMSO厌氧呼吸机制的研究 | 第31-34页 |
| ·DMSO厌氧呼吸作用与环境关系的研究 | 第34-37页 |
| 4 本论文的研究目的和意义 | 第37-39页 |
| 第二章 深海细菌Shewanella piezotolerans WP3中DMSO厌氧呼吸系统及其调控机制的研究 | 第39-74页 |
| 1 材料与方法 | 第39-54页 |
| ·材料 | 第39-44页 |
| ·菌株与质粒 | 第39页 |
| ·引物 | 第39-41页 |
| ·主要仪器 | 第41-42页 |
| ·工具软件 | 第42页 |
| ·主要试剂 | 第42-43页 |
| ·工具酶 | 第43页 |
| ·试剂盒 | 第43页 |
| ·常用溶液、培养基的配制 | 第43-44页 |
| ·方法 | 第44-54页 |
| ·不同条件下的细菌培养 | 第44-45页 |
| ·细菌总DNA的提取 | 第45页 |
| ·WP3总RNA的提取 | 第45-46页 |
| ·基因组DNA的去除及RNA的纯化 | 第46页 |
| ·PCR反应 | 第46-47页 |
| ·菌落PCR | 第47-48页 |
| ·琼脂糖凝胶上DNA片段的回收 | 第48页 |
| ·PCR产物的回收 | 第48页 |
| ·核酸内切酶酶切反应 | 第48页 |
| ·连接反应 | 第48-49页 |
| ·化学感受态细胞的制备 | 第49页 |
| ·质粒的化学转化 | 第49页 |
| ·质粒提取 | 第49页 |
| ·同源性比对 | 第49-50页 |
| ·反转录PCR(RT—PCR) | 第50页 |
| ·缺失突变载体和突变菌株的构建(双亲杂交) | 第50-53页 |
| ·双缺失突变菌株的构建 | 第53-54页 |
| 2 结果与讨论 | 第54-74页 |
| ·希瓦氏菌中与DMSO厌氧呼吸相关的基因 | 第54-56页 |
| ·WP3中dms基因共转录的研究 | 第56-58页 |
| ·WP3中dms基因在厌氧条件下的表达变化 | 第58-59页 |
| ·WP3中dms基因在DMSO厌氧呼吸中的作用 | 第59-68页 |
| ·Wp3中dmAs、mdsB单缺失突变体的构建及突变株的表型分析 | 第59-63页 |
| ·WP3中双dmsB基因缺失突变体的构建及突变株的表型分析 | 第63-66页 |
| ·WP3中dmsA-1的缺失对dmsA-2和dmsB-2转录水平的影响 | 第66-67页 |
| ·WP3中dmsA-2的缺失对dmsA-1和dmsB-1转录水平的影响 | 第67-68页 |
| ·不同浓度的DMSO对dms基因在厌氧条件下的转录水平的影响 | 第68-70页 |
| ·WP3的DMSO厌氧呼吸作用的调控 | 第70-72页 |
| ·EtrA并不是DMSO厌氧呼吸所必需的 | 第70-71页 |
| ·Fur在DMSO厌氧呼吸中的作用 | 第71-72页 |
| ·DMSO还原酶A亚基的建树 | 第72-74页 |
| 第三章 总结与展望 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-81页 |
| 附录 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
