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新型氨基酸结构表征方法及其在定量构效关系中应用研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
中英文缩写一览表第11-12页
1 绪论第12-22页
   ·定量构效关系研究概述第12-16页
     ·定量构效关系研究进展第13-15页
     ·定量构效关系研究前景第15-16页
   ·肽定量构效关系研究进展第16-18页
   ·蛋白质特性及功能预测研究进展第18-19页
   ·本文主要研究内容及创新之处第19-22页
     ·本文主要研究内容第19-21页
     ·本文主要创新之处第21-22页
2 统计建模方法与模型分析第22-34页
   ·统计建模方法第22-29页
     ·多元线性回归第22-23页
     ·主成分分析第23-24页
     ·偏最小二乘回归第24-25页
     ·线性判别分析第25-26页
     ·支持向量机第26-28页
     ·遗传算法第28-29页
   ·模型的评价第29-31页
     ·常用模型统计量第29-30页
     ·模型的验证第30-31页
   ·模型应用域第31-34页
     ·杠杆距离第32页
     ·残差标准偏差第32页
     ·相似性距离第32-34页
3 氨基酸分子结构表征第34-44页
   ·分子结构表征方法第34-35页
   ·氨基酸物化描述子-VHESH第35-38页
     ·物化参数选择第35页
     ·主成分分析第35-38页
   ·氨基酸拓扑描述子-VSTPV第38-44页
     ·拓扑性质参数选择第38-42页
     ·主成分分析第42-44页
4 肽定量构效关系研究第44-84页
   ·血管紧张素转化酶抑制剂定量构效关系研究第44-52页
     ·数据集选取与结构表征第44页
     ·基于VHESH 表征的QSAR 研究第44-49页
     ·基于VSTPV 表征的QSAR 研究第49-52页
   ·后叶催产素定量构效关系研究第52-59页
     ·数据集选取与结构表征第52页
     ·基于VHESH 表征的QSAR 研究第52-57页
     ·基于VSTPV 表征的QSAR 研究第57-59页
   ·人类1 型双载蛋白SH3 结构域亲和肽定量构效关系研究第59-68页
     ·数据集选取与结构表征第60页
     ·基于VHESH 表征的QSAR 研究第60-65页
     ·基于VSTPV 表征的QSAR 研究第65-68页
   ·阳离子抗菌肽定量构效关系研究第68-78页
     ·数据集选取与结构表征第69页
     ·基于VHESH 表征的QSAR 研究第69-76页
     ·基于VSTPV 表征的QSAR 研究第76-78页
   ·细胞穿膜肽预测第78-82页
     ·数据集选取与结构表征第79-81页
     ·结果与讨论第81-82页
   ·小结第82-84页
5 肽衍生物定量构效关系研究第84-98页
   ·缓激肽促进剂定量构效关系研究第84-88页
     ·数据集选取及结构表征第84页
     ·QSAR 模型结果与讨论第84-88页
   ·牛乳铁蛋白水解肽抗菌活性定量构效关系研究第88-92页
     ·数据集选取与结构表征第88-89页
     ·QSAR 模型结果与讨论第89-92页
   ·弹性蛋白酶-底物反应动力学常数定量构效关系研究第92-97页
     ·数据集选取与结构表征第92-93页
     ·QSAR 模型结果与讨论第93-97页
   ·小结第97-98页
6 蛋白质结构与特性及功能关系研究第98-118页
   ·人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测研究第98-103页
     ·数据集选取与结构表征第98-99页
     ·基于VHESH 表征的裂解位点研究第99-101页
     ·基于VSTPV 表征的裂解位点研究第101-103页
   ·蛋白激酶磷酸化特异位点预测研究第103-111页
     ·数据集选取与结构表征第103-104页
     ·基于VHESH 表征的磷酸化位点研究第104-108页
     ·基于VSTPV 表征的磷酸化位点研究第108-111页
   ·蛋白质与RNA 相互作用位点预测研究第111-117页
     ·数据集选取与结构表征第113页
     ·基于VHESH 表征的相互作用位点研究第113-115页
     ·基于VSTPV 表征的相互作用位点研究第115-117页
   ·小结第117-118页
7 结论与展望第118-122页
   ·结论第118-121页
   ·展望第121-122页
致谢第122-123页
参考文献第123-140页
附录第140-162页
 A. 作者在攻读学位期间发表的论文目录第140-141页
 B. 作者在攻读学位期间参与的相关科研工作第141页
 C. 天然氨基酸 113 种物化性质名称第141-143页
 D. 天然氨基酸 113 种物化性质原始变量第143-146页
 E. 166 种氨基酸 85 种拓扑性质名称第146-147页
 F. 166 种氨基酸 85 种拓扑性质原始变量第147-162页

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