| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 缩略语 | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-15页 |
| ·现代药物研究概况 | 第9-11页 |
| ·现代药物研发的基本流程 | 第9-10页 |
| ·当前药物研发的困境 | 第10-11页 |
| ·生物相关性的引出 | 第11-13页 |
| ·生物相关性提出的理论依据 | 第11-12页 |
| ·该领域现状及动态分析 | 第12-13页 |
| ·本论文的研究计划 | 第13-15页 |
| 第二章 理论基础 | 第15-27页 |
| ·计算机辅助药物设计研究概况 | 第15-18页 |
| ·计算机辅助药物设计的重要作用 | 第15-16页 |
| ·计算机辅助药物设计方法 | 第16-18页 |
| ·化学信息学研究概况 | 第18-19页 |
| ·化学信息学的研究内容 | 第18-19页 |
| ·本论文应用的化学信息学方法 | 第19-23页 |
| ·分子描述符 | 第19-20页 |
| ·分子相似性理论 | 第20-22页 |
| ·化学空间与主成分分析 | 第22-23页 |
| ·本论文应用的硬件/软件/数据库简介 | 第23-27页 |
| ·应用硬件 | 第23页 |
| ·应用软件 | 第23-24页 |
| ·应用数据库 | 第24-27页 |
| 第三章 生物相关性指标的合理性验证 | 第27-37页 |
| ·生物相关性代表化合物数据库的构建 | 第27-28页 |
| ·数据准备 | 第27页 |
| ·生物相关性数据库的构建 | 第27-28页 |
| ·化学空间分析 | 第28-29页 |
| ·数据来源与处理 | 第28页 |
| ·化学空间的计算与分析 | 第28-29页 |
| ·生物相关性的前期研究 | 第29-30页 |
| ·生物相关性计算方法的提出 | 第30-32页 |
| ·基于分子相似性的生物相关性算法 | 第30-32页 |
| ·生物相关性的计算步骤 | 第32页 |
| ·DNP、CMC、ACD-3D、MDDR数据库的生物相关性比较 | 第32-35页 |
| ·数据来源与处理 | 第32-33页 |
| ·结果分析 | 第33-35页 |
| ·本章小结 | 第35-37页 |
| 第四章 生物相关性在药物设计中的初步应用 | 第37-49页 |
| ·引言 | 第37页 |
| ·本章使用的计算方法 | 第37-39页 |
| ·生物相关性的计算方法 | 第37-38页 |
| ·类药性的计算方法 | 第38页 |
| ·药物筛选成功率的计算方法 | 第38-39页 |
| ·CMC与MDDR中同活性化合物的生物相关性比较 | 第39-43页 |
| ·数据准备 | 第39-40页 |
| ·结果分析 | 第40-43页 |
| ·不同药物开发阶段化合物的生物相关性比较 | 第43-46页 |
| ·数据准备 | 第43-44页 |
| ·结果分析 | 第44-46页 |
| ·不同上市年代药物的生物相关性比较 | 第46-48页 |
| ·数据准备 | 第46页 |
| ·结果分析 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第五章 基于不同级别样本数据库的生物相关性研究 | 第49-57页 |
| ·引言 | 第49页 |
| ·样本数据库的构建 | 第49-50页 |
| ·初级代谢产物代表化合物库的构建 | 第49-50页 |
| ·天然产物代表化合物库的构建 | 第50页 |
| ·DNP、CMC、ACD-3D、MDDR数据库的生物相关性比较 | 第50-52页 |
| ·数据来源 | 第50页 |
| ·结果分析 | 第50-52页 |
| ·CMC与MDDR中同活性化合物的生物相关性比较 | 第52-53页 |
| ·数据来源 | 第52页 |
| ·结果分析 | 第52-53页 |
| ·不同药物开发阶段化合物的生物相关性比较 | 第53-55页 |
| ·数据来源 | 第53-54页 |
| ·结果分析 | 第54-55页 |
| ·不同上市年代药物的生物相关性比较 | 第55-56页 |
| ·数据来源 | 第55页 |
| ·结果分析 | 第55-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 第六章 贝叶斯归类算法对生物相关性的评估 | 第57-63页 |
| ·引言 | 第57页 |
| ·贝叶斯归类学习算法 | 第57页 |
| ·DNP、CMC、MDDR数据库的生物相关性比较 | 第57-59页 |
| ·数据来源 | 第58页 |
| ·结果分析 | 第58-59页 |
| ·CMC与MDDR中同活性化合物的生物相关性比较 | 第59-60页 |
| ·数据来源 | 第59页 |
| ·结果分析 | 第59-60页 |
| ·不同药物开发阶段化合物的生物相关性比较 | 第60页 |
| ·数据来源 | 第60页 |
| ·结果分析 | 第60页 |
| ·不同上市年代药物的生物相关性比较 | 第60-61页 |
| ·数据来源 | 第60-61页 |
| ·结果分析 | 第61页 |
| ·本章小结 | 第61-63页 |
| 第七章 生物相关性的Pipeline Pilot流程实现 | 第63-67页 |
| ·引言 | 第63页 |
| ·生物相关性的Pipeline Pilot流程处理 | 第63-66页 |
| ·生物相关性计算流程的构建 | 第63-64页 |
| ·结果分析 | 第64-66页 |
| ·本章小结 | 第66-67页 |
| 第八章 生物相关性影响因素的确定及其与现有指标的关系 | 第67-75页 |
| ·引言 | 第67页 |
| ·生物相关性与毒性的关系 | 第67-70页 |
| ·数据来源与处理 | 第67页 |
| ·结果分析 | 第67-70页 |
| ·生物相关性与类药性的关系 | 第70-72页 |
| ·数据来源 | 第70页 |
| ·类药性计算方法 | 第70页 |
| ·结果分析 | 第70-72页 |
| ·生物相关性影响因素的确定 | 第72-74页 |
| ·数据准备 | 第72-73页 |
| ·方法与步骤 | 第73页 |
| ·结果分析 | 第73-74页 |
| ·本章小结 | 第74-75页 |
| 第九章 论文总结 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-83页 |
| 附录 数据附表 | 第83-89页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第89-91页 |
| 致谢 | 第91页 |
