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我国枣食芽象甲种群遗传结构、适生性及种群历史动态研究

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
第一章 文献综述第18-33页
    1.1 我国枣食芽象甲研究概述第18-20页
        1.1.1 我国枣树分布及病虫害现状第18页
        1.1.2 我国枣食芽象甲分布概况第18-19页
        1.1.3 枣食芽象甲生物学特征第19页
        1.1.4 枣食芽象甲的研究现状第19-20页
    1.2 种群遗传多样性和遗传结构研究第20-24页
        1.2.1 种群遗传多样性及遗传结构概念第20页
        1.2.2 遗传多样性与遗传结构的影响因素第20-21页
        1.2.3 遗传多样性与遗传结构的研究方法第21-23页
        1.2.4 遗传多样性及遗传结构的研究意义第23-24页
    1.3 分子系统地理学研究第24-29页
        1.3.1 分子系统地理学概念第24页
        1.3.2 分子系统地理学重要理论第24-26页
        1.3.3 分子系统地理学研究方法第26-27页
        1.3.4 分子系统地理学的研究应用第27-29页
    1.4 物种生态位模型研究第29-31页
        1.4.1 生态位的概念和发展第30页
        1.4.2 生态位模型的概念和类型第30页
        1.4.3 生态位模型的研究应用第30-31页
    1.5 本研究目的和意义第31-33页
        1.5.1 研究目的意义第31-32页
        1.5.2 研究技术路线第32-33页
第二章 基于转录组数据的枣食芽象甲微卫星位点信息分析第33-44页
    2.1 材料与方法第33-36页
        2.1.1 供试成虫第33页
        2.1.2 主要仪器及试剂第33-34页
        2.1.3 成虫总RNA的提取第34页
        2.1.4 cDNA文库构建及转录组测序第34页
        2.1.5 转录组数据组装分析及微卫星筛选第34-35页
        2.1.6 成虫基因组DNA提取及质量检测第35页
        2.1.7 微卫星引物设计及PCR扩增第35-36页
        2.1.8 非变性聚丙烯酰胺电泳及T载体连接转化第36页
    2.2 结果与分析第36-42页
        2.2.1 转录组序列组装及注释第36-37页
        2.2.2 微卫星位点在转录组中的分布特征第37-40页
        2.2.3 微卫星引物PCR扩增第40页
        2.2.4 非变性聚丙烯酰胺电泳及连接转化引物筛选第40-42页
    2.3 讨论第42-44页
第三章 枣食芽象甲线粒体基因组全序列测定与系统发育研究第44-53页
    3.1 材料与方法第44-46页
        3.1.1 供试成虫第44-45页
        3.1.2 主要仪器和试剂第45页
        3.1.3 成虫基因组DNA提取及质量检测第45页
        3.1.4 DNA文库构建及测序第45页
        3.1.5 数据预处理及线粒体基因组序列拼接和鉴定第45页
        3.1.6 基因功能注释和全基因组圈图绘制第45页
        3.1.7 系统发育分析第45-46页
    3.2 结果与分析第46-51页
        3.2.1 线粒体全基因组结构第46-48页
        3.2.2 线粒体基因组蛋白质编码基因特征第48-49页
        3.2.3 线粒体基因组非编码区特征第49-50页
        3.2.4 枣食芽象甲系统发育关系研究第50-51页
    3.3 讨论第51-53页
第四章 基于微卫星的枣食芽象甲地理种群遗传多样性及遗传结构研究第53-71页
    4.1 材料与方法第53-58页
        4.1.1 供试成虫及采样信息第53-54页
        4.1.2 试剂和仪器第54页
        4.1.3 基因组DNA提取及质量检测第54-55页
        4.1.4 微卫星荧光标记引物的合成及PCR扩增第55-56页
        4.1.5 毛细管电泳基因分型第56页
        4.1.6 种群遗传多样性分析第56-57页
        4.1.7 种群遗传结构分析第57-58页
    4.2 结果与分析第58-68页
        4.2.1 荧光标记PCR扩增结果检测第58页
        4.2.2 微卫星位点基因分型分析第58-59页
        4.2.3 哈迪-温伯格平衡检验第59-60页
        4.2.4 微卫星位点的无效等位基因频率第60页
        4.2.5 微卫星位点的遗传多样性分析第60-61页
        4.2.6 微卫星位点的等位基因频率第61页
        4.2.7 不同地理种群的遗传多样性分析第61-62页
        4.2.8 不同地理种群的遗传分化和基因流分析第62-63页
        4.2.9 种群系统发育树分析第63-64页
        4.2.10 种群主成分分析第64-65页
        4.2.11 STRUCTURE结构分析第65-67页
        4.2.12 种群间遗传距离与地理距离的相关性分析第67-68页
        4.2.13 AMOVA分子方差分析第68页
    4.3 讨论第68-71页
第五章 基于线粒体和核基因的枣食芽象甲地理种群遗传多样性和遗传结构研究第71-89页
    5.1 材料与方法第72-75页
        5.1.1 供试成虫第72页
        5.1.2 试剂和仪器第72页
        5.1.3 基因组DNA提取第72-73页
        5.1.4 线粒体基因引物筛选及PCR扩增第73页
        5.1.5 核基因引物筛选及PCR扩增第73-74页
        5.1.6 序列比对分析第74页
        5.1.7 种群遗传多样性分析第74页
        5.1.8 单倍型系统发育分析第74页
        5.1.9 种群遗传结构分析第74-75页
    5.2 结果与分析第75-87页
        5.2.1 PCR扩增及测序结果检测第75-77页
        5.2.2 基因序列变异统计和单倍型分析第77-79页
        5.2.3 地理种群的遗传多样性分析第79-81页
        5.2.4 单倍型在地理种群中的分布第81页
        5.2.5 地理种群的单倍型系统发育分析第81-83页
        5.2.6 地理种群的单倍型邻接网络分析第83-85页
        5.2.7 地理种群空间分组分析第85页
        5.2.8 地理种群遗传分化和基因流分析第85-87页
    5.3 讨论第87-89页
第六章 枣食芽象甲在我国的适生性与适生环境因子分析第89-98页
    6.1 材料与方法第89-91页
        6.1.1 枣食芽象甲全国分布数据第89-90页
        6.1.2 环境变量指标的选取第90页
        6.1.3 MaxEnt模型适生性分析第90-91页
        6.1.4 模型评价和适生环境因子分析第91页
        6.1.5 不同时期适生区分布变化及避难所推测第91页
    6.2 结果与分析第91-96页
        6.2.1 MaxEnt模型评价第91-92页
        6.2.2 适生性分布预测结果第92-94页
        6.2.3 适生区分布变化及避难所推测第94-95页
        6.2.4 主要适生环境因子分析第95-96页
    6.3 讨论第96-98页
第七章 枣食芽象甲种群历史动态及扩散路径分析第98-109页
    7.1 材料与方法第98-100页
        7.1.1 种群历史动态分析第98-99页
        7.1.2 种群分歧时间估算第99页
        7.1.3 种群历史迁移率分析第99页
        7.1.4 种群扩散路径预测第99-100页
    7.2 结果与分析第100-107页
        7.2.1 种群历史动态分析第100-103页
        7.2.2 种群分歧时间估算第103-104页
        7.2.3 种群历史迁移率分析第104-105页
        7.2.4 种群扩散路径预测第105-107页
    7.3 讨论第107-109页
第八章 全文总结与研究展望第109-112页
    8.1 全文主要结论第109-110页
    8.2 本文创新点第110-111页
    8.3 问题与展望第111-112页
参考文献第112-129页
附录A 8个微卫星位点在不同种群中的等位基因数量及频率第129-133页
附录B WORLDCLIM环境变量指标值名称第133-134页
附录C 枣食芽象甲不同类群相邻种群间的迁移率第134-135页
致谢第135-137页
个人简历第137页

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