摘要 | 第7-10页 |
ABSTRACT | 第10-13页 |
第一章 文献综述 | 第18-33页 |
1.1 我国枣食芽象甲研究概述 | 第18-20页 |
1.1.1 我国枣树分布及病虫害现状 | 第18页 |
1.1.2 我国枣食芽象甲分布概况 | 第18-19页 |
1.1.3 枣食芽象甲生物学特征 | 第19页 |
1.1.4 枣食芽象甲的研究现状 | 第19-20页 |
1.2 种群遗传多样性和遗传结构研究 | 第20-24页 |
1.2.1 种群遗传多样性及遗传结构概念 | 第20页 |
1.2.2 遗传多样性与遗传结构的影响因素 | 第20-21页 |
1.2.3 遗传多样性与遗传结构的研究方法 | 第21-23页 |
1.2.4 遗传多样性及遗传结构的研究意义 | 第23-24页 |
1.3 分子系统地理学研究 | 第24-29页 |
1.3.1 分子系统地理学概念 | 第24页 |
1.3.2 分子系统地理学重要理论 | 第24-26页 |
1.3.3 分子系统地理学研究方法 | 第26-27页 |
1.3.4 分子系统地理学的研究应用 | 第27-29页 |
1.4 物种生态位模型研究 | 第29-31页 |
1.4.1 生态位的概念和发展 | 第30页 |
1.4.2 生态位模型的概念和类型 | 第30页 |
1.4.3 生态位模型的研究应用 | 第30-31页 |
1.5 本研究目的和意义 | 第31-33页 |
1.5.1 研究目的意义 | 第31-32页 |
1.5.2 研究技术路线 | 第32-33页 |
第二章 基于转录组数据的枣食芽象甲微卫星位点信息分析 | 第33-44页 |
2.1 材料与方法 | 第33-36页 |
2.1.1 供试成虫 | 第33页 |
2.1.2 主要仪器及试剂 | 第33-34页 |
2.1.3 成虫总RNA的提取 | 第34页 |
2.1.4 cDNA文库构建及转录组测序 | 第34页 |
2.1.5 转录组数据组装分析及微卫星筛选 | 第34-35页 |
2.1.6 成虫基因组DNA提取及质量检测 | 第35页 |
2.1.7 微卫星引物设计及PCR扩增 | 第35-36页 |
2.1.8 非变性聚丙烯酰胺电泳及T载体连接转化 | 第36页 |
2.2 结果与分析 | 第36-42页 |
2.2.1 转录组序列组装及注释 | 第36-37页 |
2.2.2 微卫星位点在转录组中的分布特征 | 第37-40页 |
2.2.3 微卫星引物PCR扩增 | 第40页 |
2.2.4 非变性聚丙烯酰胺电泳及连接转化引物筛选 | 第40-42页 |
2.3 讨论 | 第42-44页 |
第三章 枣食芽象甲线粒体基因组全序列测定与系统发育研究 | 第44-53页 |
3.1 材料与方法 | 第44-46页 |
3.1.1 供试成虫 | 第44-45页 |
3.1.2 主要仪器和试剂 | 第45页 |
3.1.3 成虫基因组DNA提取及质量检测 | 第45页 |
3.1.4 DNA文库构建及测序 | 第45页 |
3.1.5 数据预处理及线粒体基因组序列拼接和鉴定 | 第45页 |
3.1.6 基因功能注释和全基因组圈图绘制 | 第45页 |
3.1.7 系统发育分析 | 第45-46页 |
3.2 结果与分析 | 第46-51页 |
3.2.1 线粒体全基因组结构 | 第46-48页 |
3.2.2 线粒体基因组蛋白质编码基因特征 | 第48-49页 |
3.2.3 线粒体基因组非编码区特征 | 第49-50页 |
3.2.4 枣食芽象甲系统发育关系研究 | 第50-51页 |
3.3 讨论 | 第51-53页 |
第四章 基于微卫星的枣食芽象甲地理种群遗传多样性及遗传结构研究 | 第53-71页 |
4.1 材料与方法 | 第53-58页 |
4.1.1 供试成虫及采样信息 | 第53-54页 |
4.1.2 试剂和仪器 | 第54页 |
4.1.3 基因组DNA提取及质量检测 | 第54-55页 |
4.1.4 微卫星荧光标记引物的合成及PCR扩增 | 第55-56页 |
4.1.5 毛细管电泳基因分型 | 第56页 |
4.1.6 种群遗传多样性分析 | 第56-57页 |
4.1.7 种群遗传结构分析 | 第57-58页 |
4.2 结果与分析 | 第58-68页 |
4.2.1 荧光标记PCR扩增结果检测 | 第58页 |
4.2.2 微卫星位点基因分型分析 | 第58-59页 |
4.2.3 哈迪-温伯格平衡检验 | 第59-60页 |
4.2.4 微卫星位点的无效等位基因频率 | 第60页 |
4.2.5 微卫星位点的遗传多样性分析 | 第60-61页 |
4.2.6 微卫星位点的等位基因频率 | 第61页 |
4.2.7 不同地理种群的遗传多样性分析 | 第61-62页 |
4.2.8 不同地理种群的遗传分化和基因流分析 | 第62-63页 |
4.2.9 种群系统发育树分析 | 第63-64页 |
4.2.10 种群主成分分析 | 第64-65页 |
4.2.11 STRUCTURE结构分析 | 第65-67页 |
4.2.12 种群间遗传距离与地理距离的相关性分析 | 第67-68页 |
4.2.13 AMOVA分子方差分析 | 第68页 |
4.3 讨论 | 第68-71页 |
第五章 基于线粒体和核基因的枣食芽象甲地理种群遗传多样性和遗传结构研究 | 第71-89页 |
5.1 材料与方法 | 第72-75页 |
5.1.1 供试成虫 | 第72页 |
5.1.2 试剂和仪器 | 第72页 |
5.1.3 基因组DNA提取 | 第72-73页 |
5.1.4 线粒体基因引物筛选及PCR扩增 | 第73页 |
5.1.5 核基因引物筛选及PCR扩增 | 第73-74页 |
5.1.6 序列比对分析 | 第74页 |
5.1.7 种群遗传多样性分析 | 第74页 |
5.1.8 单倍型系统发育分析 | 第74页 |
5.1.9 种群遗传结构分析 | 第74-75页 |
5.2 结果与分析 | 第75-87页 |
5.2.1 PCR扩增及测序结果检测 | 第75-77页 |
5.2.2 基因序列变异统计和单倍型分析 | 第77-79页 |
5.2.3 地理种群的遗传多样性分析 | 第79-81页 |
5.2.4 单倍型在地理种群中的分布 | 第81页 |
5.2.5 地理种群的单倍型系统发育分析 | 第81-83页 |
5.2.6 地理种群的单倍型邻接网络分析 | 第83-85页 |
5.2.7 地理种群空间分组分析 | 第85页 |
5.2.8 地理种群遗传分化和基因流分析 | 第85-87页 |
5.3 讨论 | 第87-89页 |
第六章 枣食芽象甲在我国的适生性与适生环境因子分析 | 第89-98页 |
6.1 材料与方法 | 第89-91页 |
6.1.1 枣食芽象甲全国分布数据 | 第89-90页 |
6.1.2 环境变量指标的选取 | 第90页 |
6.1.3 MaxEnt模型适生性分析 | 第90-91页 |
6.1.4 模型评价和适生环境因子分析 | 第91页 |
6.1.5 不同时期适生区分布变化及避难所推测 | 第91页 |
6.2 结果与分析 | 第91-96页 |
6.2.1 MaxEnt模型评价 | 第91-92页 |
6.2.2 适生性分布预测结果 | 第92-94页 |
6.2.3 适生区分布变化及避难所推测 | 第94-95页 |
6.2.4 主要适生环境因子分析 | 第95-96页 |
6.3 讨论 | 第96-98页 |
第七章 枣食芽象甲种群历史动态及扩散路径分析 | 第98-109页 |
7.1 材料与方法 | 第98-100页 |
7.1.1 种群历史动态分析 | 第98-99页 |
7.1.2 种群分歧时间估算 | 第99页 |
7.1.3 种群历史迁移率分析 | 第99页 |
7.1.4 种群扩散路径预测 | 第99-100页 |
7.2 结果与分析 | 第100-107页 |
7.2.1 种群历史动态分析 | 第100-103页 |
7.2.2 种群分歧时间估算 | 第103-104页 |
7.2.3 种群历史迁移率分析 | 第104-105页 |
7.2.4 种群扩散路径预测 | 第105-107页 |
7.3 讨论 | 第107-109页 |
第八章 全文总结与研究展望 | 第109-112页 |
8.1 全文主要结论 | 第109-110页 |
8.2 本文创新点 | 第110-111页 |
8.3 问题与展望 | 第111-112页 |
参考文献 | 第112-129页 |
附录A 8个微卫星位点在不同种群中的等位基因数量及频率 | 第129-133页 |
附录B WORLDCLIM环境变量指标值名称 | 第133-134页 |
附录C 枣食芽象甲不同类群相邻种群间的迁移率 | 第134-135页 |
致谢 | 第135-137页 |
个人简历 | 第137页 |