| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第11-33页 |
| 1. 微生物与秀丽隐杆线虫之间存在共生关系 | 第11页 |
| 2. 微生物应对食菌线虫捕食压力而进化出的抵御机制 | 第11-16页 |
| 2.1 通过感染机制杀死线虫 | 第12-13页 |
| 2.2 通过释放毒素和蛋白酶等杀线虫 | 第13-15页 |
| 2.3 通过间接方式抵御线虫捕食 | 第15-16页 |
| 3. 鼻疽诺卡氏菌概述 | 第16-19页 |
| 4. 秀丽隐杆线虫作为微生物-宿主互作的研究模型 | 第19-22页 |
| 4.1 线虫的生理和发育特点概述 | 第19-21页 |
| 4.2 秀丽隐杆线虫作为研究对象的优势 | 第21-22页 |
| 5. 秀丽隐杆线虫对微生物的防御机制 | 第22-31页 |
| 5.1 线虫的物理和生理保护机制 | 第22页 |
| 5.2 线虫通过逃避行为躲避有害微生物 | 第22-23页 |
| 5.3 线虫对细菌的识别机制 | 第23-24页 |
| 5.4 线虫对微生物的免疫机制 | 第24-31页 |
| 6. 研究的目的与意义 | 第31-33页 |
| 第二章 秀丽隐杆线虫成虫阶段依赖p38 MAPK途径抵抗鼻疽诺卡氏菌 | 第33-63页 |
| 1. 前言 | 第33页 |
| 2. 实验材料与方法 | 第33-50页 |
| 2.1 实验材料 | 第33-40页 |
| 2.1.1 实验用仪器 | 第34页 |
| 2.1.2 实验用试剂 | 第34-35页 |
| 2.1.3 实验用试剂盒 | 第35页 |
| 2.1.4 实验用培养基及配置方法 | 第35-36页 |
| 2.1.5 实验用溶液的配制方法 | 第36-39页 |
| 2.1.6 转基因和突变 C.elegans线虫株 | 第39页 |
| 2.1.7 菌株 | 第39页 |
| 2.1.8 定量RT-PCR引物 | 第39-40页 |
| 2.2 实验方法 | 第40-50页 |
| 2.2.1 线虫培养 | 第40页 |
| 2.2.2 线虫的冻存与复苏 | 第40-41页 |
| 2.2.2.1 线虫冻存 | 第40-41页 |
| 2.2.2.2 线虫复苏 | 第41页 |
| 2.2.3 线虫同步化 | 第41-42页 |
| 2.2.4 线虫RNAi分析实验 | 第42-43页 |
| 2.2.5 鼻疽诺卡氏菌侵染线虫实验 | 第43-44页 |
| 2.2.6 线虫逃避实验 | 第44-45页 |
| 2.2.7 显微镜分析实验 | 第45页 |
| 2.2.8 RT-PCR实验 | 第45-47页 |
| 2.2.8.1 线虫总RNA提取 | 第45-46页 |
| 2.2.8.2 cDNA合成 | 第46页 |
| 2.2.8.3 RT-PCR操作流程 | 第46-47页 |
| 2.2.9 蛋白免疫印迹 | 第47-50页 |
| 2.2.9.1 线虫蛋白提取 | 第47页 |
| 2.2.9.2 蛋白含量测定 | 第47-48页 |
| 2.2.9.3 SDS-PAGE蛋白电泳 | 第48页 |
| 2.2.9.4 转膜 | 第48-49页 |
| 2.2.9.5 封闭 | 第49页 |
| 2.2.9.6 抗体孵育 | 第49-50页 |
| 2.2.10 统计学分析 | 第50页 |
| 3. 实验结果 | 第50-59页 |
| 3.1 鼻疽诺卡氏菌不影响线虫成虫寿命 | 第50-51页 |
| 3.2 成虫依赖p38 MAPK途径抵御鼻疽诺卡氏菌 | 第51-54页 |
| 3.3 抵御鼻疽诺卡氏菌激活成虫p38 MAPK途径 | 第54-55页 |
| 3.4 鼻疽诺卡氏菌通过p38 MAPK途径激活SKN-1 | 第55-58页 |
| 3.5 SKN-1介导线虫对鼻疽诺卡氏菌的抵抗 | 第58-59页 |
| 4. 讨论 | 第59-63页 |
| 第三章 鼻疽诺卡氏菌分泌物抑制线虫卵不孵化的机制 | 第63-108页 |
| 1 前言 | 第63-65页 |
| 2. 实验材料与方法 | 第65-75页 |
| 2.1 实验材料 | 第65-66页 |
| 2.1.1 实验用仪器 | 第65页 |
| 2.1.2 实验用试剂 | 第65页 |
| 2.1.3 实验用培养基及配置方法 | 第65页 |
| 2.1.4 实验用培养基及配置方法 | 第65-66页 |
| 2.1.5 实验用溶液的配制方法 | 第66页 |
| 2.1.6 转基因和突变 C.elegans线虫株 | 第66页 |
| 2.1.7 菌株 | 第66页 |
| 2.1.8 定量RT-PCR引物 | 第66页 |
| 2.2 实验方法 | 第66-75页 |
| 2.2.1 线虫培养 | 第66-67页 |
| 2.2.2 线虫的冻存与复苏 | 第67页 |
| 2.2.3 线虫同步化 | 第67页 |
| 2.2.4 线虫RNAi分析实验 | 第67页 |
| 2.2.5 线虫诱导N.farcinica发酵实验 | 第67-68页 |
| 2.2.5.1 大剂量线虫诱导N.farcinica发酵实验 | 第67-68页 |
| 2.2.5.2 小剂量线虫诱导N.farcinica发酵实验 | 第68页 |
| 2.2.6 诱导发酵液萃取实验 | 第68-69页 |
| 2.2.7 未诱导N.farcinica发酵实验 | 第69页 |
| 2.2.8 未诱导发酵液萃取实验 | 第69页 |
| 2.2.9 诱导产物/未诱导产物浸泡线虫卵实验 | 第69-70页 |
| 2.2.10 ROS检测实验 | 第70-72页 |
| 2.2.10.1 -二氢乙啶(DHE)染色 | 第71页 |
| 2.2.10.2 DCFH-DA染色 | 第71页 |
| 2.2.10.3 CellRox Deep Red染色 | 第71-72页 |
| 2.2.11 溶酶体功能检测 | 第72-73页 |
| 2.2.11.1 LysoSensor Green DND-189染色 | 第72-73页 |
| 2.2.11.2 组织蛋白酶B活性检测 | 第73页 |
| 2.2.12 ATP检测 | 第73-74页 |
| 2.2.13 显微镜分析实验 | 第74页 |
| 2.2.14 RT-PCR实验 | 第74-75页 |
| 2.2.14.1 线虫卵总RNA提取 | 第74页 |
| 2.2.14.2 cDNA合成 | 第74页 |
| 2.2.14.3 RT-PCR操作流程 | 第74-75页 |
| 2.2.15 蛋白免疫印迹 | 第75页 |
| 2.2.16 统计学分析 | 第75页 |
| 3. 实验结果 | 第75-104页 |
| 3.1 鼻疽诺卡氏菌抑制线虫卵的孵化 | 第75-76页 |
| 3.2 线虫诱导鼻疽诺卡氏菌产生的分泌产物抑制线虫卵的孵化 | 第76-79页 |
| 3.3 诱导产物导致线粒体机能受损 | 第79-82页 |
| 3.4 诱导产物导致溶酶体扩大和功能受损 | 第82-86页 |
| 3.5 线粒体功能受损导致溶酶体功能异常 | 第86-90页 |
| 3.6 诱导产物通过抑制UPR~(mt)下游伴侣分子导致线粒体功能受损以及溶酶体功能受损 | 第90-96页 |
| 3.7 诱导产物抑制线虫卵中的自噬流 | 第96-97页 |
| 3.8 诱导产物增加ROS水平导致溶酶体功能受损致使线虫卵不孵化 | 第97-104页 |
| 4. 讨论 | 第104-108页 |
| 第四章 全文总结与展望 | 第108-111页 |
| 附录 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-130页 |
| 读博士期间（待）发表、撰写的学术论文 | 第130-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
