摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5页 |
1 文献综述 | 第8-19页 |
1.1 研究背景 | 第8-10页 |
1.1.1 生物学特性 | 第8页 |
1.1.2 地理分布 | 第8-9页 |
1.1.3 乌桕种质资源现状 | 第9页 |
1.1.4 经济价值和药用价值 | 第9-10页 |
1.1.5 观赏价值和生态价值 | 第10页 |
1.2 测序技术 | 第10-14页 |
1.2.1 DNA测序技术的发展 | 第10-13页 |
1.2.2 转录组测序 | 第13-14页 |
1.3 分子标记 | 第14-17页 |
1.3.1 分子标记技术种类 | 第14-16页 |
1.3.2 分子标记在乌桕中的应用 | 第16-17页 |
1.4 研究内容 | 第17页 |
1.5 技术路线 | 第17页 |
1.6 研究的目的 | 第17-19页 |
2 乌桕转录组测序 | 第19-28页 |
2.1 材料和方法 | 第19-20页 |
2.1.1 材料 | 第19页 |
2.1.2 RNA的提取 | 第19页 |
2.1.3 cDNA文库的建立和测序 | 第19页 |
2.1.4 组装与注释 | 第19-20页 |
2.2 结果与分析 | 第20-26页 |
2.2.1 转录组测序与从头组装 | 第20-21页 |
2.2.2 Unigene的注释 | 第21-26页 |
2.3 讨论 | 第26-28页 |
3 乌桕EST-SSR标记开发 | 第28-35页 |
3.1 试验材料 | 第28-29页 |
3.2 主要仪器设备 | 第29页 |
3.3 转录组微卫星搜索及SSR引物设计 | 第29-30页 |
3.4 试验方法 | 第30-31页 |
3.4.1 DNA的提取 | 第30页 |
3.4.2 PCR反应体系 | 第30-31页 |
3.4.3 电泳检测 | 第31页 |
3.4.4 聚丙烯酰胺电泳 | 第31页 |
3.5 EST-SSR引物的筛选 | 第31-32页 |
3.6 结果与分析 | 第32-34页 |
3.7 讨论 | 第34-35页 |
4 乌桕种质资源的遗传评价 | 第35-43页 |
4.1 试验材料 | 第35-36页 |
4.2 试验方法 | 第36页 |
4.3 统计方法 | 第36-37页 |
4.4 结果与分析 | 第37-41页 |
4.4.1 分子标记多样性分析 | 第37-38页 |
4.4.2 乌桕良株资源遗传评价 | 第38-39页 |
4.4.3 乌桕良株聚类分析 | 第39-41页 |
4.5 讨论 | 第41-43页 |
5 结论 | 第43-45页 |
参考文献 | 第45-51页 |
附录 | 第51-54页 |
附表1 Unigene 统计数据 | 第51-52页 |
附表2 COS功能匹配统计数据 | 第52-53页 |
附表3 乌桕群体间的Nei's遗传距离和遗传相似系数 | 第53-54页 |
致谢 | 第54页 |