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基于线粒体COI和12S rRNA基因的马六甲肉食螨分子系统地理学研究

摘要第3-5页
abstract第5-6页
第1章 引言第10-21页
    1.1 马六甲肉食螨研究概况第10-11页
        1.1.1 马六甲肉食螨生活史研究第10页
        1.1.2 马六甲肉食螨在生态学上的运用第10-11页
    1.2 分子系统地理学研究概况第11-17页
        1.2.1 系统地理学简介第11-12页
        1.2.2 系统地理学研究使用的分子标记第12-15页
            1.2.2.1 限制性片段长度多态性(RFLP)第12-13页
            1.2.2.2 单核苷酸多态性(SNPs)第13页
            1.2.2.3 DNA标记第13-14页
            1.2.2.4 微卫星(ISSR)第14页
            1.2.2.5 显性标记第14页
            1.2.2.6 分子标记未来发展趋势第14-15页
        1.2.3 生物遗传谱系的分布模式及其影响因素第15-16页
        1.2.4 我国生物系统地理结构第16-17页
    1.3 人为干扰对系统地理结构的影响第17页
    1.4 螨类系统地理学研究概况第17-18页
        1.4.1 国内螨类分子系统地理学研究第17-18页
        1.4.2 国外螨类分子系统地理学研究第18页
    1.5 本文的目的与意义第18-21页
第2章 材料与方法第21-27页
    2.1 材料第21-23页
        2.1.1 马六甲肉食螨样品采集第21-22页
        2.1.2 马六甲肉食螨样品形态学鉴定第22-23页
    2.2 仪器与试剂第23-24页
        2.2.1 主要仪器第23页
        2.2.2 基因组DNA提取试剂第23页
        2.2.3 PCR反应试剂第23-24页
        2.2.4 电泳试剂第24页
    2.3 实验方法第24-26页
        2.3.1 马六甲肉食螨基因组DNA提取第24-25页
        2.3.2 mtDNA目的片段PCR扩增第25-26页
            2.3.2.1 PCR反应体系第25页
            2.3.2.2 PCR反应程序第25-26页
        2.3.3 PCR产物电泳检测目的片段第26页
        2.3.4 序列测定第26页
    2.4 数据处理第26-27页
第3章 COI分子标记结果与分析第27-48页
    3.1 COI标记的实验结果第27-32页
        3.1.1 COI标记的DNA序列碱基组成第27-31页
        3.1.2 COI序列的种群遗传多样性第31-32页
    3.2 基于COI马六甲肉食螨的系统发生关系第32-38页
        3.2.1 单倍型网络图第32-35页
        3.2.2 单倍型的系统发育树第35-37页
        3.2.3 个体的系统发育树第37-38页
        3.2.4 种群遗传距离系统发育树第38页
    3.3 种群遗传结构分析第38-48页
        3.3.1 种群的遗传距离第38-39页
        3.3.2 种群之间的遗传分化(FST)第39页
        3.3.3 中性检验第39页
        3.3.4 AMOVA(分子方差分析)第39-46页
        3.3.5 空间遗传结构分析第46-48页
第4章 12SrRNA标记结果与分析第48-64页
    4.1 12S rRNA标记的实验结果第48-51页
        4.1.1 12S rRNA标记的DNA序列碱基组成第48-50页
        4.1.2 12S rRNA序列的种群遗传多样性第50-51页
    4.2 基于12SrRNA马六甲肉食螨的系统发生关系第51-58页
        4.2.1 单倍型网络图第51-53页
        4.2.2 单倍型的系统发育树第53-54页
        4.2.3 个体的系统发育树第54-57页
        4.2.4 种群遗传距离系统发育树第57-58页
    4.3 种群遗传结构分析第58-64页
        4.3.1 种群的遗传距离第58页
        4.3.2 种群之间的遗传分化(FST)第58页
        4.3.3 中性检验第58页
        4.3.4 AMOVA(分子方差分析)第58-62页
        4.3.5 空间遗传结构分析第62-64页
第5章 分析与讨论第64-70页
    5.1 碱基组成与多样性分析与讨论第64页
    5.2 马六甲肉食螨系统地理结构第64-65页
    5.3 自然地理环境与人为干扰对系统地理结构的影响第65-70页
        5.3.1 自然地理环境对系统地理结构的影响第67-69页
        5.3.2 人为干扰对系统地理结构的影响第69-70页
第6章 主要结论及展望第70-72页
    6.1 主要结论第70-71页
    6.2 本研究的不足之处第71页
    6.3 展望第71-72页
致谢第72-73页
参考文献第73-78页

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