摘要 | 第3-5页 |
abstract | 第5-6页 |
第1章 引言 | 第10-21页 |
1.1 马六甲肉食螨研究概况 | 第10-11页 |
1.1.1 马六甲肉食螨生活史研究 | 第10页 |
1.1.2 马六甲肉食螨在生态学上的运用 | 第10-11页 |
1.2 分子系统地理学研究概况 | 第11-17页 |
1.2.1 系统地理学简介 | 第11-12页 |
1.2.2 系统地理学研究使用的分子标记 | 第12-15页 |
1.2.2.1 限制性片段长度多态性(RFLP) | 第12-13页 |
1.2.2.2 单核苷酸多态性(SNPs) | 第13页 |
1.2.2.3 DNA标记 | 第13-14页 |
1.2.2.4 微卫星(ISSR) | 第14页 |
1.2.2.5 显性标记 | 第14页 |
1.2.2.6 分子标记未来发展趋势 | 第14-15页 |
1.2.3 生物遗传谱系的分布模式及其影响因素 | 第15-16页 |
1.2.4 我国生物系统地理结构 | 第16-17页 |
1.3 人为干扰对系统地理结构的影响 | 第17页 |
1.4 螨类系统地理学研究概况 | 第17-18页 |
1.4.1 国内螨类分子系统地理学研究 | 第17-18页 |
1.4.2 国外螨类分子系统地理学研究 | 第18页 |
1.5 本文的目的与意义 | 第18-21页 |
第2章 材料与方法 | 第21-27页 |
2.1 材料 | 第21-23页 |
2.1.1 马六甲肉食螨样品采集 | 第21-22页 |
2.1.2 马六甲肉食螨样品形态学鉴定 | 第22-23页 |
2.2 仪器与试剂 | 第23-24页 |
2.2.1 主要仪器 | 第23页 |
2.2.2 基因组DNA提取试剂 | 第23页 |
2.2.3 PCR反应试剂 | 第23-24页 |
2.2.4 电泳试剂 | 第24页 |
2.3 实验方法 | 第24-26页 |
2.3.1 马六甲肉食螨基因组DNA提取 | 第24-25页 |
2.3.2 mtDNA目的片段PCR扩增 | 第25-26页 |
2.3.2.1 PCR反应体系 | 第25页 |
2.3.2.2 PCR反应程序 | 第25-26页 |
2.3.3 PCR产物电泳检测目的片段 | 第26页 |
2.3.4 序列测定 | 第26页 |
2.4 数据处理 | 第26-27页 |
第3章 COI分子标记结果与分析 | 第27-48页 |
3.1 COI标记的实验结果 | 第27-32页 |
3.1.1 COI标记的DNA序列碱基组成 | 第27-31页 |
3.1.2 COI序列的种群遗传多样性 | 第31-32页 |
3.2 基于COI马六甲肉食螨的系统发生关系 | 第32-38页 |
3.2.1 单倍型网络图 | 第32-35页 |
3.2.2 单倍型的系统发育树 | 第35-37页 |
3.2.3 个体的系统发育树 | 第37-38页 |
3.2.4 种群遗传距离系统发育树 | 第38页 |
3.3 种群遗传结构分析 | 第38-48页 |
3.3.1 种群的遗传距离 | 第38-39页 |
3.3.2 种群之间的遗传分化(FST) | 第39页 |
3.3.3 中性检验 | 第39页 |
3.3.4 AMOVA(分子方差分析) | 第39-46页 |
3.3.5 空间遗传结构分析 | 第46-48页 |
第4章 12SrRNA标记结果与分析 | 第48-64页 |
4.1 12S rRNA标记的实验结果 | 第48-51页 |
4.1.1 12S rRNA标记的DNA序列碱基组成 | 第48-50页 |
4.1.2 12S rRNA序列的种群遗传多样性 | 第50-51页 |
4.2 基于12SrRNA马六甲肉食螨的系统发生关系 | 第51-58页 |
4.2.1 单倍型网络图 | 第51-53页 |
4.2.2 单倍型的系统发育树 | 第53-54页 |
4.2.3 个体的系统发育树 | 第54-57页 |
4.2.4 种群遗传距离系统发育树 | 第57-58页 |
4.3 种群遗传结构分析 | 第58-64页 |
4.3.1 种群的遗传距离 | 第58页 |
4.3.2 种群之间的遗传分化(FST) | 第58页 |
4.3.3 中性检验 | 第58页 |
4.3.4 AMOVA(分子方差分析) | 第58-62页 |
4.3.5 空间遗传结构分析 | 第62-64页 |
第5章 分析与讨论 | 第64-70页 |
5.1 碱基组成与多样性分析与讨论 | 第64页 |
5.2 马六甲肉食螨系统地理结构 | 第64-65页 |
5.3 自然地理环境与人为干扰对系统地理结构的影响 | 第65-70页 |
5.3.1 自然地理环境对系统地理结构的影响 | 第67-69页 |
5.3.2 人为干扰对系统地理结构的影响 | 第69-70页 |
第6章 主要结论及展望 | 第70-72页 |
6.1 主要结论 | 第70-71页 |
6.2 本研究的不足之处 | 第71页 |
6.3 展望 | 第71-72页 |
致谢 | 第72-73页 |
参考文献 | 第73-78页 |