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花鲈简化基因组和转录组测序及基因表达分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 引言第12-20页
    1.1 花鲈的研究概述第12-13页
    1.2 碱性磷酸酶研究第13-15页
        1.2.1 碱性磷酸酶的结构和分布第14页
        1.2.2 碱性磷酸酶的生理作用第14-15页
    1.3 胃泌素家族及其受体概述第15-19页
        1.3.1 胃泌素结构及其受体概述第16页
        1.3.2 胃泌素内分泌细胞分布第16-17页
        1.3.3 胃泌素功能和调节因素第17-19页
    1.4 研究目的与意义第19-20页
第二章 花鲈基因信息挖掘第20-42页
    2.1 实验材料第20-21页
        2.1.1 实验动物第20-21页
        2.1.2 主要生化试剂第21页
    2.2 实验方法第21-24页
        2.2.1 花鲈基因组DNA和总RNA的提取与检测第21页
        2.2.2 文库制备及质检第21页
        2.2.3 上机测序第21-22页
        2.2.4 基因注释及功能聚类分析第22页
        2.2.5 SSR引物筛选第22-23页
        2.2.6 多态性检测第23页
        2.2.7 数据分析第23-24页
    2.3 实验结果第24-40页
        2.3.1 花鲈基因组denovo测序结果分析第24-27页
        2.3.2 微卫星引物筛选结果第27-28页
        2.3.3 花鲈7个组织转录组数据分析第28-29页
        2.3.4 花鲈七个组织Unigene功能注释与分析第29-40页
        2.3.5 七个组织转录组微卫星统计第40页
    2.4 讨论第40-42页
        2.4.1 花鲈简化基因组测序的构建及应用第40-41页
        2.4.2 花鲈转录组文库的构建及应用第41-42页
第三章 花鲈肠道碱性磷酸酶基因表达和功能分析第42-57页
    3.1 实验材料第42-43页
    3.2 实验方法第43-46页
        3.2.1 Lm-alpi基因鉴定第43-44页
        3.2.2 Lm-alpi生物信息学分析第44页
        3.2.3 免疫组织化学第44页
        3.2.4 质粒构建和转染第44-45页
        3.2.5 基因表达第45-46页
        3.2.6 酶活测定第46页
        3.2.7 数据分析第46页
    3.3 实验结果第46-54页
        3.3.1 Lm-alpi基因鉴定第46-51页
        3.3.2 Lm-alpi免疫定位第51页
        3.3.3 Lm-alpi在胚胎和组织中转录模式第51-52页
        3.3.4 LPS处理后Lm-alpi的动态变化第52-53页
        3.3.5 Lm-alpi对于脱盐反应的动态变化第53-54页
    3.4 讨论第54-57页
        3.4.1 Alp家族同源性分析第54页
        3.4.2 蛋白序列和Alpi结构第54-55页
        3.4.3 Alpi在消化道中的功能第55-57页
第四章 花鲈胃泌素的细胞定位和表达第57-68页
    4.1 实验材料第57页
    4.2 实验方法第57-60页
        4.2.1 RNA提取第57页
        4.2.2 引物设计及扩增第57-58页
        4.2.3 切胶回收第58页
        4.2.4 目的片段与表达载体连接第58-59页
        4.2.5 转化连接产物第59页
        4.2.6 重组质粒的筛选和鉴定第59页
        4.2.7 同源性及聚类分析第59页
        4.2.8 免疫组化第59-60页
    4.3 实验结果第60-66页
        4.3.1 Gas相关基因的分子鉴定与特征第60-66页
        4.3.2 Lm-gas表达蛋白的组织分布第66页
    4.4 讨论第66-68页
        4.4.1 Lm-gasDNA分子鉴定与特征第66-67页
        4.4.2 Lm-gas细胞表达与定位第67-68页
结论第68-69页
参考文献第69-75页
致谢第75页

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