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基于转录组测序的火龙果SSR分子标记开发及种质遗传多样性评价

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
英文缩略词表第11-12页
第一章 引言第12-20页
    1.1 火龙果种质资源概述第12页
    1.2 分子标记在植物上的应用第12-14页
    1.3 SSR分子标记技术第14-18页
        1.3.1 SSR的定义及原理第14-15页
        1.3.2 SSR标记的优缺点第15页
        1.3.3 SSR标记的分类第15-16页
        1.3.4 SSR标记在植物上的应用第16-18页
    1.4 立题意义与技术路线第18-19页
        1.4.1 立题意义第18页
        1.4.2 技术路线第18-19页
    1.5 拟解决问题第19-20页
第二章 转录组SSR位点分析及其分子标记的开发第20-40页
    2.1 研究材料第20-25页
        2.1.1 转录组数据来源第20页
        2.1.2 植物材料第20-24页
        2.1.3 药品耗材与仪器设备第24页
        2.1.4 主要试剂配制第24-25页
    2.2 方法第25-29页
        2.2.1 转录组数据分析及引物设计第25-26页
        2.2.2 基因组DNA提取第26页
        2.2.3 PCR反应体系的优化第26-27页
        2.2.4 退火温度的筛选第27页
        2.2.5 变性胶技术体系的优化第27-28页
        2.2.6 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的制备第28页
        2.2.7 PCR产物检测第28-29页
        2.2.8 扩增体系稳定性验证第29页
    2.3 结果与分析第29-37页
        2.3.1 火龙果转录组序列中SSR的总体特点及出现频率第29-31页
        2.3.2 火龙果转录组序列中SSR基元分布第31-32页
        2.3.3 火龙果基因组DNA的提取第32-33页
        2.3.4 PCR体系的优化第33页
        2.3.5 引物退火温度筛选第33-34页
        2.3.6 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术体系第34-35页
        2.3.7 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳不同上样量第35-36页
        2.3.8 扩增体系稳定性验证第36-37页
    2.4 讨论第37-40页
第三章 贵州火龙果种质遗传多样性评价第40-52页
    3.1 研究材料第40页
        3.1.1 植物材料第40页
        3.1.2 药品耗材与仪器设备第40页
    3.2 研究方法第40-41页
        3.2.1 形态性状调查第40页
        3.2.2 DNA提取与检测第40页
        3.2.3 EST-SSR反应体系第40页
        3.2.4 PCR扩增反应程序第40-41页
        3.2.5 电泳检测第41页
        3.2.6 数据处理第41页
    3.3 结果与分析第41-49页
        3.3.1 火龙果种质DNA提取第41-42页
        3.3.2 火龙果EST-SSR引物筛选第42-43页
        3.3.3 EST-SSR分子标记引物多态性分析第43-44页
        3.3.4 EST-SSR位点的验证及多样性第44-46页
        3.3.5 火龙果种质的亲缘关系分析第46-47页
        3.3.6 火龙果EST-SSR指纹图谱的构建第47-49页
    3.4 讨论第49-52页
第四章 结论与展望第52-54页
    4.1 结论第52-53页
        1.火龙果EST-SSR位点分析第52页
        2.火龙果EST-SSR-PCR体系优化第52页
        3.火龙果EST-SSR标记分析第52页
        4.UPGMA聚类分析第52页
        5.火龙果EST-SSR指纹图谱构建第52-53页
    4.2 展望第53-54页
参考文献第54-65页
致谢第65-66页
附录 论文发表情况第66-67页

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