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植物病原镰孢菌遗传多样性及系统发育研究

摘要第6-7页
前言第7-16页
    1 镰孢菌概述第7-8页
    2 镰孢菌分类研究进展第8-10页
    3 镰孢菌系统发育关系的研究进展第10-11页
    4 系统发育树的构建第11-14页
        4.1 主要建树方法第11-12页
        4.2 系统树的不同分类层级构建方法的优、缺点第12-14页
    5 尖镰孢菌遗传多样性分析研究进展第14-15页
    6 本课题研究目的意义第15-16页
第一章 尖镰孢菌基因组SSR信息分析第16-23页
    1 材料和方法第16页
        1.1 材料第16页
        1.2 尖镰孢菌基因组序列的SSR检索与信息分析第16页
    2 结果与分析第16-21页
        2.1 尖镰孢菌7条染色体基因组序列中SSR位点搜索结果第16-17页
        2.2 SSR位点的分布特点及出现的频率第17-21页
            2.2.1 尖镰孢菌基因组中SSR位点分布特点第17页
            2.2.2 尖镰孢菌基因组中SSR位点分布密度第17-19页
            2.2.3 尖镰孢菌基因组中SSR位点重复次数及长度分布情况第19-21页
    3 结论与讨论第21-23页
第二章 21株尖镰孢菌SSR遗传多样性研究第23-33页
    1 材料与方法第23-26页
        1.1 试验材料第23-24页
            1.1.1 供试菌株及来源第23-24页
            1.1.2 供试引物第24页
        1.2 试验仪器第24页
        1.3 试验方法第24-26页
            1.3.1 菌丝培养第24页
            1.3.2 CTAB法提取DNA第24-25页
            1.3.3 SSR引物筛选第25页
            1.3.4 PCR产物PAGE电泳检测第25页
            1.3.5 条带的记录及数据统计第25-26页
    2 结果与分析第26-31页
        2.1 PCR扩增结果第26-27页
        2.2 供试的尖镰孢菌的相似性系数矩阵分析第27-30页
        2.3 21株尖镰孢菌SSR-PCR扩增结果的聚类分析第30-31页
    3 讨论第31-33页
第三章 基于线粒体小亚基和组蛋白H3基因片段的镰孢菌系统发育分析第33-46页
    1 试验材料和方法第33-37页
        1.1 试验材料第33-35页
        1.2 试验仪器第35页
        1.3 试验方法第35-37页
            1.3.1 菌丝培养第35页
            1.3.2 CTAB法提取DNA第35页
            1.3.3 PCR扩增第35-36页
            1.3.4 扩增产物的电泳检测第36-37页
    2 结果与分析第37-44页
        2.1 PCR扩增结果第37-38页
        2.2 mtSSU rDNA及histone H3基因序列信息分析第38-39页
        2.3 mtSSU rDNA、histone H3遗传距离分析第39页
        2.4 镰孢菌系统发育分析第39-44页
            2.4.1 histone H3基因片段分析第39-42页
            2.4.2 mtSSU rDNA基因片段分析第42-44页
    3 结论与讨论第44-46页
第四章 基于mtSSU rDNA+histone H3联合基因的镰孢菌系统发育分析第46-50页
    1 试验材料和方法第46页
    2 结果与分析第46-49页
        2.1 mtSSU rDNA+histone H3基因序列信息分析第46-47页
        2.2 mtSSU rDNA+histone H3遗传距离分析第47页
        2.3 镰孢菌系统发育分析第47-49页
    3 结论与讨论第49-50页
参考文献第50-57页
Abstract第57-58页
致谢第59页

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