| 中文摘要 | 第3-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 英文缩略词表 | 第8-11页 |
| 1. 前言 | 第11-15页 |
| 1.1 选题背景 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外有关本选题的研究动态和自己的见解 | 第12-14页 |
| 1.3 本课题的研究意义 | 第14-15页 |
| 2. 资料与方法 | 第15-20页 |
| 2.1 资料来源 | 第15页 |
| 2.2 方法 | 第15-20页 |
| 2.2.1 芯片数据预处理方法 | 第15-16页 |
| 2.2.2 差异基因筛选方法 | 第16-17页 |
| 2.2.3 细胞信号通路分析方法 | 第17-18页 |
| 2.2.4 基因间调控关系分析方法 | 第18-19页 |
| 2.2.5 核心基因分型准确性的验证方法 | 第19-20页 |
| 3. 结果 | 第20-47页 |
| 3.1 乳腺癌基因芯片样本预后类型及病理类型分布 | 第20页 |
| 3.2 差异表达基因筛选结果 | 第20-24页 |
| 3.2.1 前20位差异表达基因的生物学功能及其变化特征 | 第21-22页 |
| 3.2.2 前20位差异表达基因与不同乳腺癌预后分型的关联性分析 | 第22-24页 |
| 3.3 细胞信号通路富集分析结果 | 第24-27页 |
| 3.3.1 前20位细胞信号通路富集结果 | 第24-25页 |
| 3.3.2 前20位细胞信号通路特征及通路中发生差异表达的基因 | 第25-27页 |
| 3.4 基因共表达网络结果 | 第27-45页 |
| 3.4.1 决定乳腺癌预后基因共表达网络模块的整体结果 | 第27-35页 |
| 3.4.1.1 决定乳腺癌预后基因共表达网络模块中核心基因的筛选 | 第27-30页 |
| 3.4.1.2 决定乳腺癌预后的共表达网络基因功能描述 | 第30-35页 |
| 3.4.2 核心基因PIK3CA与乳腺癌预后关系的meta分析 | 第35-39页 |
| 3.4.2.1 资料来源和文献纳入标准 | 第35-36页 |
| 3.4.2.2 统计学方法 | 第36页 |
| 3.4.2.3 meta分析结果 | 第36-39页 |
| 3.4.3 决定乳腺癌预后基因共表达网络模块的局部结果分析 | 第39-45页 |
| 3.5 基因共表达网络的验证 | 第45-47页 |
| 3.5.1 简单交叉验证法结果 | 第45-46页 |
| 3.5.2 k折交叉验证法结果 | 第46页 |
| 3.5.3 留一交叉验证法结果 | 第46-47页 |
| 4. 讨论 | 第47-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-59页 |
| 综述 | 第59-66页 |
| 参考文献 | 第63-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第67-68页 |
