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庚型肝炎病毒与HIV、HCV相互作蛋白的筛选及E2与LTα蛋白互作验证

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略表第17-18页
第一章 绪论第18-35页
    1.1 庚型肝炎病毒第18页
    1.2 庚型肝炎病毒的分子生物学第18-20页
        1.2.1 庚型肝炎病毒结构第18页
        1.2.2 庚型肝炎病毒基因结构第18-20页
    1.3 人类免疫缺陷病毒的分子生物学第20-22页
        1.3.1 人类免疫缺陷病毒的结构第20-22页
    1.4 丙型肝炎病毒的分子生物学第22-24页
        1.4.1 丙型肝炎病毒的结构第22-24页
    1.5 GBV-C、HIV与HCV的传播第24-26页
        1.5.1 GBV-C、HIV与HCV的传播途径第24页
        1.5.2 GBV-C、HIV与HCV的血液传播第24-25页
        1.5.3 GBV-C、HIV与HCV的性传播第25页
        1.5.4 GBV-C、HIV与HCV的母婴传播第25-26页
    1.6 GBV-C研究意义第26-29页
        1.6.1 GBV-C研究现状第26-27页
        1.6.2 GBV-C对HIV-1相互作用机制研究现状第27-29页
        1.6.3 GBV-C对HCV的临床意义第29页
    1.7 蛋白质相互作用研究方法第29-32页
        1.7.1 验证蛋白质之间相互作用实验的方法第30-32页
        1.7.2 数据库比对以及计算机分析预测蛋白质的相互作用第32页
    1.8 本研究的主要目的第32-34页
    1.9 技术路线图第34-35页
第二章 HIV-1、HCV (J6/JFH-1-6u)及GBV-C-7文库质粒的构建第35-58页
    2.1 实验材料第36-41页
        2.1.1 菌株和毒株第36-37页
        2.1.2 主要设备第37页
        2.1.3 主要试剂第37页
        2.1.4 培养基及其他缓冲液的配制第37页
        2.1.5 引物设计第37-41页
    2.2 实验方法第41-45页
        2.2.1 血清中HIV病毒总RNA提取第41-42页
        2.2.2 目的片段的克隆第42页
        2.2.3 目的基因与载体的双酶切第42-43页
        2.2.4 目的片段与载体连接第43-44页
        2.2.5 目的片段的连接与转化第44页
        2.2.6 重组质粒的提取及双酶切验证第44-45页
    2.3 实验结果第45-54页
        2.3.1 重组质粒的双酶切验证及测序结果第45-54页
    2.4 讨论第54-57页
        2.4.1 构建文库所用毒株选择第54-55页
        2.4.2 文库片段划分第55-56页
        2.4.3 酵母双杂交文库构建方法选择第56页
        2.4.4 展望第56-57页
    2.5 小结第57-58页
第三章 酵母双杂交筛选与GBV-C诱饵相互作用的HIV-1、HCV及GBV-C 蛋白第58-81页
    3.1 试剂与材料第59-60页
        3.1.1 菌株及载体第59页
        3.1.2 主要试剂第59页
        3.1.3 主要试剂的配制第59-60页
    3.2 实验方法第60-62页
        3.2.1 酵母的复苏及感受态的制备第60-61页
        3.2.2 质粒转化酵母感受态细胞、自激活及毒性检测第61页
        3.2.3 诱饵质粒与HIV、HCV及GBV-C文库的杂交实验第61-62页
    3.3 实验结果第62-74页
        3.3.1 文库质粒的自激活毒性检测第62-64页
        3.3.2 相互作用蛋白的筛选第64-74页
    3.4 讨论第74-80页
        3.4.1 酵母双杂交体系选择第74-76页
        3.4.2 文库质粒自激活及毒性验证第76-77页
        3.4.3 阳性对照与阴性对照的设置第77页
        3.4.4 假阴性与假阳性的排除第77-78页
        3.4.5 酵母转化方法选择第78-79页
        3.4.6 互作蛋白分析第79页
        3.4.7 展望第79-80页
    3.5 本章小结第80-81页
第四章 GBV-C包膜糖蛋白E2与肿瘤坏死因子LTα相互作用验证以及E2对LTα mRNA量化关系研究第81-113页
    4.1 材料与试剂第81-83页
        4.1.1 载体与细胞第81-82页
        4.1.2 主要试剂第82页
        4.1.3 主要仪器设备第82-83页
    4.2 实验方法第83-96页
        4.2.1 缓冲液的配制第83页
        4.2.2 动物细胞表达质粒的构建第83-87页
        4.2.3 动物细胞内蛋白质相互作用的验证第87-90页
        4.2.4 GBV-C E2对LTαmRNA量化关系研究第90-96页
    4.3 实验结果第96-105页
        4.3.1 重组质粒双酶切验证第96-97页
        4.3.2 蛋白定量结果第97-99页
        4.3.3 转染效率的优化第99页
        4.3.4 免疫共沉淀结果第99-100页
        4.3.5 激光共聚焦实验结果第100-101页
        4.3.6 细胞内总RNA提取结果第101-102页
        4.3.7 Jurkat细胞内LTα基因的PCR检测以及定量引物检测第102-103页
        4.3.8 相对定量结果第103页
        4.3.9 GBV-C E2对Jurkat细胞中LTα mRNA表达量的影响第103-105页
    4.4 讨论第105-111页
        4.4.1 实验细胞的选择第105-106页
        4.4.2 蛋白定量的方法选择第106-107页
        4.4.3 转染的方法选择第107-109页
        4.4.4 免疫共沉淀抗体的选择以及抗体轻重链的去除第109页
        4.4.5 定量方法选择第109-110页
        4.4.6 定量实验结果分析第110-111页
        4.4.7 展望第111页
    4.5 本章小结第111-113页
第五章 总结第113-114页
致谢第114-115页
参考文献第115-126页
附录 A 攻读硕士期间发表论文目录第126页

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