| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1. 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-11页 |
| 1.3 论文工作与安排 | 第11-13页 |
| 2. DNA二级结构与近邻热力学模型 | 第13-21页 |
| 2.1 DNA二级结构生物学知识 | 第13-15页 |
| 2.2 DNA二级结构定义 | 第15-16页 |
| 2.3 近邻热力学模型 | 第16-19页 |
| 2.3.1 Nearest-Neighbor热力学模型 | 第16-17页 |
| 2.3.2 茎区热力学计算模型 | 第17-18页 |
| 2.3.3 环区热力学计算模型 | 第18页 |
| 2.3.4 悬挂末端热力学计算模型 | 第18-19页 |
| 2.4 小结 | 第19-21页 |
| 3. 基于近邻热力学模型的DNA二级结构预测算法 | 第21-31页 |
| 3.1 Nussinov算法 | 第21-26页 |
| 3.1.1 算法思想 | 第21-22页 |
| 3.1.2 算法描述 | 第22-26页 |
| 3.2 改进的Nussinov算法 | 第26-29页 |
| 3.2.1 算法思想 | 第26-27页 |
| 3.2.2 算法描述 | 第27-28页 |
| 3.2.3 算例分析 | 第28页 |
| 3.2.4 算法分析 | 第28-29页 |
| 3.3 基于近邻热力学模型的DNA二级结构预测 | 第29-30页 |
| 3.4 小结 | 第30-31页 |
| 4. DNA二级结构平面嵌入算法 | 第31-45页 |
| 4.1 ST-编号平面嵌入算法 | 第31-39页 |
| 4.1.1 基础知识 | 第31-33页 |
| 4.1.2 ST-编号算法 | 第33-37页 |
| 4.1.3 ST-编号平面嵌入算法 | 第37-39页 |
| 4.1.4 算法分析 | 第39页 |
| 4.2 DNA二级结构平面嵌入算法 | 第39-44页 |
| 4.2.1 基础知识 | 第40-41页 |
| 4.2.2 迭代过程 | 第41-43页 |
| 4.2.3 算法分析 | 第43-44页 |
| 4.3 小结 | 第44-45页 |
| 5. 基于QT的可视化DNA二级结构预测系统设计与实现 | 第45-53页 |
| 5.1 XNA设计 | 第45-47页 |
| 5.2 XNA界面 | 第47-50页 |
| 5.3 XNA与RNAStructure软件分析对比 | 第50-52页 |
| 5.4 小结 | 第52-53页 |
| 6. 总结与展望 | 第53-55页 |
| 6.1 工作总结 | 第53-54页 |
| 6.2 展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 附录1 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第59-60页 |
| 附录2 攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第60页 |
