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肿瘤抑制蛋白APC与Amer1的结合机理研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略词表第10-11页
目录第11-14页
第一章 绪论第14-21页
    1.1 APC 蛋白及其 Armadillo 结构域第14-18页
        1.1.1 APC 蛋白的结构第14-15页
        1.1.2 APC 蛋白的功能第15-17页
        1.1.3 Armadillo 结构域的结构特点第17-18页
    1.2 Amer1 蛋白的结构与功能第18-20页
        1.2.1 Amer1 蛋白的结构第18-19页
        1.2.2 Amer1 蛋白的功能第19-20页
    1.3 本实验的研究内容和意义第20-21页
第二章 材料与方法第21-35页
    2.1 主要仪器及设备第21页
    2.2 实验材料第21-23页
        2.2.1 大肠杆菌菌株第21-22页
        2.2.2 质粒载体第22页
        2.2.3 Amer111 肽第22页
        2.2.4 主要的酶及试剂第22-23页
    2.3 主要试剂的配制第23-25页
        2.3.1 培养基及常用溶液的配制第23-25页
        2.3.2 亲和层析、凝胶过滤的缓冲液第25页
        2.3.3 抗生素及其它试剂使用浓度第25页
    2.4 主要实验方法第25-35页
        2.4.1 引物的设计、合成及配制第25-26页
        2.4.2 PCR 扩增目的基因第26-27页
        2.4.3 目的基因的琼脂糖凝胶电泳及胶回收第27页
        2.4.4 目的基因回收片段及质粒的限制性内切酶切割第27页
        2.4.5 酶切片段与载体的连接第27-28页
        2.4.6 连接产物转化感受态细胞第28页
        2.4.7 质粒的小规模抽提第28页
        2.4.8 质粒测序及再次转化感受态细胞第28页
        2.4.9 目的蛋白的小规模表达检测第28-29页
        2.4.10 目的蛋白的大规模表达第29页
        2.4.11 凝胶过滤层析纯化蛋白第29-30页
        2.4.12 SDS-PAGE 分析法第30-31页
        2.4.13 Native-PAGE 分析法第31页
        2.4.14 蛋白质结晶初筛优化及冻存第31-32页
        2.4.15 晶体的 X-Ray 衍射及结构解析第32-33页
        2.4.16 GST-Pulldown 实验设计及分析第33页
        2.4.17 等温滴定量热(ITC)实验第33-35页
第三章 蛋白 APC 与 Amer1365-375 片段复合物的晶体学研究第35-46页
    3.1 前言第35-36页
    3.2 实验结果第36-44页
        3.2.1 蛋白 APC407-775 与 Amer1365-375 的表达及纯化第36-39页
        3.2.2 APC 与 Amer1365-375 的 GST-Pulldown 实验第39页
        3.2.3 APC 与 Amer1365-375 的 ITC 实验第39-40页
        3.2.4 APC 与 Amer1365-375 的晶体筛选及结构解析第40-44页
    3.3 本章小结第44-46页
第四章 蛋白 APC 与 Amer1 其他片段的结合研究第46-53页
    4.1 前言第46-48页
    4.2 实验结果第48-51页
        4.2.1 GST 标签融合蛋白 Amer1716-834、766-823、766-777、786-823、766-823Δ778-794 的表达及纯化第48页
        4.2.2 Amer1 蛋白片段与 APC 的 GST-Pulldown 结果第48-50页
        4.2.3 Amer1 蛋白片段与 APC 的 ITC 结果第50-51页
    4.3 本章小结第51-53页
第五章 蛋白 APC 与 Amer1766-823Δ778-794 复合物纯化及晶体初筛第53-60页
    5.1 前言第53页
    5.2 实验结果第53-58页
        5.2.1 Ni 柱纯化蛋白 APC 与 Amer1766-823Δ778-794 复合物第53-55页
        5.2.2 Thrombin 酶切蛋白 APC-ARM 与 Amer1766-823Δ778-794 复合物第55-56页
        5.2.3 第二次过 Ni 柱去除 GST 标签第56页
        5.2.4 凝胶层析纯化去标签后的复合物第56-57页
        5.2.5 复合物的非变性胶鉴定第57-58页
        5.2.6 复合物的晶体初筛第58页
    5.3 本章小结第58-60页
第六章 蛋白 APC 与 Amer1 融合蛋白的表达纯化及晶体初筛第60-67页
    6.1 前言第60页
    6.2 实验结果第60-66页
        6.2.1 融合蛋白 APC407-775 TEVAmer1740/766-823 的纯化第60-63页
        6.2.2 融合蛋白 APC407-775 TEV Amer1740/766-823 的 TEV 及 Trypsin酶切和纯化第63-65页
        6.2.3 融合蛋白酶切后非变性胶验证第65页
        6.2.4 融合蛋白的晶体初筛第65-66页
    6.3 本章小结第66-67页
第七章 总结及讨论第67-69页
参考文献第69-73页
致谢第73-75页
攻读硕士期间论文发表及专利申请情况第75页

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