| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第13-25页 |
| 1.1 QTL定位的原理及方法 | 第13-14页 |
| 1.1.1 QTL定位的原理 | 第13页 |
| 1.1.2 QTL定位的步骤 | 第13页 |
| 1.1.3 QTL的初定位 | 第13-14页 |
| 1.1.4 QTL的精细定位 | 第14页 |
| 1.2 水稻粒型相关基因的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3 关联分析定位 | 第15-17页 |
| 1.4 水稻耐淹性研究进展 | 第17-19页 |
| 1.4.1 水淹胁迫对我国水稻的危害 | 第17-18页 |
| 1.4.2 水淹胁迫的产生 | 第18-19页 |
| 1.4.3 水稻耐淹的分子机理研究 | 第19页 |
| 1.5 逆境胁迫下的钙信号 | 第19-22页 |
| 1.5.1 Ca~(2+)信号 | 第19-20页 |
| 1.5.2 Ca~(2+)信号的调节蛋白 | 第20-22页 |
| 1.5.2.1 钙调素 | 第20-21页 |
| 1.5.2.2 钙依赖蛋白激酶 | 第21页 |
| 1.5.2.3 类钙调磷酸酶B亚基蛋白 | 第21-22页 |
| 1.6 植物CBL-CIPK信号系统的研究进展 | 第22-24页 |
| 1.6.1 CBL-CIPK信号通路的激活 | 第22-23页 |
| 1.6.2 CBL-CIPK信号通路在植物响应逆境中的作用 | 第23-24页 |
| 1.7 本研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-40页 |
| 2.1 材料 | 第25-28页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第25页 |
| 2.1.2 载体与菌株 | 第25页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第25-26页 |
| 2.1.4 实验引物 | 第26-28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-40页 |
| 2.2.1 CTAB法提取水稻基因组DNA | 第28页 |
| 2.2.2 水稻基因组RNA的提取及反转录为cDNA | 第28-30页 |
| 2.2.3 半定量PCR | 第30-31页 |
| 2.2.4 DNA片段的扩增与载体的构建 | 第31-35页 |
| 2.2.4.1 DNA片段的扩增 | 第31页 |
| 2.2.4.2 目的片段的胶回收 | 第31-33页 |
| 2.2.4.3 酶切反应 | 第33页 |
| 2.2.4.4 连接反应 | 第33页 |
| 2.2.4.5 质粒DNA的提取 | 第33-35页 |
| 2.2.5 大肠杆菌及农杆菌的转化 | 第35-36页 |
| 2.2.5.1 大肠杆菌的转化 | 第35页 |
| 2.2.5.2 农杆菌的转化 | 第35-36页 |
| 2.2.6 淀粉酶的活性测定 | 第36-37页 |
| 2.2.7 植物蛋白免疫印染技术 | 第37-38页 |
| 2.2.7.1 SDS-PAGE电泳 | 第37页 |
| 2.2.7.2 Western Blot | 第37-38页 |
| 2.2.8 Ca~(2+)通量在水稻胚芽鞘中的测定 | 第38页 |
| 2.2.9 GUS报告基因的定性和定量检测 | 第38-40页 |
| 2.2.9.1 GUS报告基因的定性检测 | 第38-39页 |
| 2.2.9.2 GUS报告基因的定量检测 | 第39-40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-65页 |
| 3.1 控制水稻籽粒厚度基因的QTL定位 | 第40-49页 |
| 3.1.1 大粒突变体粒型的表型分析 | 第40-41页 |
| 3.1.2 水稻粒型性状的相关性分析 | 第41-42页 |
| 3.1.3 粒型相关QTL的初定位 | 第42-43页 |
| 3.1.4 控制粒厚的主效QTL位点qGT2的精细定位 | 第43-45页 |
| 3.1.4.1 构建qGT2的近等基因系 | 第43-44页 |
| 3.1.4.2 利用高通量测序结果预测qGT2区域内候选基因 | 第44-45页 |
| 3.1.5 候选SNP位点在F2代极端厚粒中的连锁分析 | 第45-48页 |
| 3.1.6 候选基因的分析 | 第48-49页 |
| 3.2 OsCBL10在水稻萌发时抗淹能力调控中的分子机制 | 第49-65页 |
| 3.2.1 不同水稻品种对水淹胁迫的响应 | 第49-50页 |
| 3.2.2 OsCBL10作为候选基因在水淹过程中介导钙信号 | 第50-55页 |
| 3.2.2.1 水淹胁迫下两种水稻Ca~(2+)流量的变化 | 第50-51页 |
| 3.2.2.2 水淹萌发过程中可能有钙结合蛋白的参与 | 第51-52页 |
| 3.2.2.3 OsCBL10可能是不同品种水稻种子水淹敏感性的候选基因 | 第52页 |
| 3.2.2.4 利用转基因技术验证在水稻种子水淹萌发中OsCBL10的作用 | 第52-55页 |
| 3.2.3 OsCBL10的启动子区域可能在水淹萌发中具有重要的调控作用 | 第55-61页 |
| 3.2.3.1 耐淹和非耐淹水稻在OsCBL10启动子区域存在差异 | 第55-57页 |
| 3.2.3.2 利用两种生态型的多个品种对OsCBL10响应水淹胁迫进行验证 | 第57-58页 |
| 3.2.3.3 比较两种类型启动子的转录活性 | 第58-61页 |
| 3.2.4 寻找OsCBL10的下游信号 | 第61页 |
| 3.2.5 OsCBL10在水稻水淹萌发过程中调控OsCIPK15介导的糖信号转导 | 第61-65页 |
| 4 讨论 | 第65-69页 |
| 4.1 高通量测序与BSA法相结合的快速定位方法 | 第65页 |
| 4.2 候选基因的验证 | 第65-66页 |
| 4.3 水稻其他粒型相关基因的确定 | 第66页 |
| 4.4 粒型相关基因在农业生产上的应用 | 第66页 |
| 4.5 水稻萌发过程中的水淹耐受性也是农业生产上一个重要性状 | 第66-67页 |
| 4.6 钙信号是应对水淹胁迫的关键信号 | 第67页 |
| 4.7 OsCBL10调节不同水稻品种的水淹耐受性 | 第67-68页 |
| 4.8 CBL-CIPK介导的Ca~(2+)信号通路可能参与调控水稻的水淹耐受性 | 第68-69页 |
| 5 结论 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 攻读学位期间发表的论文及成果 | 第79页 |
