| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第9-22页 |
| 1.1 植物miRNA的起源与进化 | 第10-12页 |
| 1.1.1 miRNA的发现 | 第10-11页 |
| 1.1.2 植物miRNA的起源 | 第11-12页 |
| 1.2 植物miRNA的生物发生及对靶基因的识别 | 第12-18页 |
| 1.2.1 植物miRNA的生物合成 | 第12-13页 |
| 1.2.2 植物miRNA在基因组的分布 | 第13-14页 |
| 1.2.3 植物miRNA对靶基因的识别机制 | 第14-16页 |
| 1.2.4 植物miRNA的功能 | 第16-18页 |
| 1.3 稻属植物的驯化 | 第18-19页 |
| 1.4 植物miRNA功能研究的手段 | 第19-20页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第20-22页 |
| 第二章 干旱胁迫下miRNA对水稻应激条件下基因表达的调控 | 第22-39页 |
| 2.1 前言 | 第22-23页 |
| 2.2 材料和方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 水稻品系 | 第23页 |
| 2.2.2 水稻种子的消毒、萌发和培养 | 第23-24页 |
| 2.2.3 水稻的干旱胁迫处理 | 第24-25页 |
| 2.2.4 水稻RNA提取 | 第25页 |
| 2.2.5 小RNA文库和cDNA文库的制备和分析 | 第25-27页 |
| 2.2.6 实时定量PCR | 第27-28页 |
| 2.3 结果 | 第28-37页 |
| 2.3.1 抗系和敏感系水稻干旱胁迫后miRNA及基因的表达 | 第28-34页 |
| 2.3.2 存在差异表达的miRNA靶基因及其对应的miRNA在干旱胁迫后24小时内表达量的变化 | 第34-37页 |
| 2.4 讨论 | 第37-39页 |
| 第三章 稻属非洲野生稻与栽培稻miRNA的种间表达差异及其对转录本的影响 | 第39-49页 |
| 3.1 前言 | 第39-40页 |
| 3.2 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.2.1 水稻品系 | 第40页 |
| 3.2.2 非洲野生稻和栽培稻的种子萌发与幼苗培养 | 第40-41页 |
| 3.2.3 测序样本的收集 | 第41页 |
| 3.2.4 非洲水稻RNA的提取和测序文库的构建和分析 | 第41-42页 |
| 3.3 结果 | 第42-48页 |
| 3.3.1 非洲稻的小RNA文库分析和新miRNA的预测 | 第42-48页 |
| 3.4 讨论 | 第48-49页 |
| 第四章 一种利用反义寡核苷酸沉默拟南芥内源miRNA的方法的开发及实践 | 第49-59页 |
| 4.1 前言 | 第49-50页 |
| 4.2 材料和方法 | 第50-54页 |
| 4.2.1 拟南芥种子的消毒与萌发 | 第50-52页 |
| 4.2.2 反义寡核苷酸的设计与合成 | 第52页 |
| 4.2.3 miRNA沉默步骤 | 第52页 |
| 4.2.4 总RNA提取 | 第52-53页 |
| 4.2.5 miRNA的荧光实时定量PCR检测 | 第53页 |
| 4.2.6 mRNA的荧光实时定量PCR检测 | 第53页 |
| 4.2.7 持续使用反义寡核苷酸处理后拟南芥表型的观察 | 第53-54页 |
| 4.3 结果 | 第54-58页 |
| 4.3.1 高纯水反义寡核苷酸对拟南芥内源miRNA的沉默效力 | 第54-55页 |
| 4.3.2 高纯水反义寡核苷酸对拟南芥内源miRNA沉默作用的持续时效 | 第55-56页 |
| 4.3.3 持续反义寡核苷酸处理对拟南芥发育的表型观察 | 第56-58页 |
| 4.4 讨论 | 第58-59页 |
| 第五章 总结与展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 附录 | 第66-86页 |
| 附录Ⅰ 水稻品系信息 | 第66-67页 |
| 附录Ⅱ 抗旱系及敏感系水稻胁迫后miRNA和靶基因反转及荧光定量PCR引物 | 第67-68页 |
| 附录Ⅲ 非洲稻可能的新miRNA与基因组比对信息 | 第68-83页 |
| 附录Ⅳ 非洲稻转录组文库reads质量信息 | 第83-84页 |
| 附录Ⅴ 反义寡核苷酸序列及miRNA反转引物序列 | 第84-85页 |
| 附录Ⅵ 发明专利证书 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86页 |
