| 中文摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第12-23页 |
| 1.1 染色体转位 | 第12-13页 |
| 1.2 天然无规则蛋白质 | 第13-14页 |
| 1.3 融合蛋白质与无规则区域 | 第14-16页 |
| 1.3.1 转位相关融合蛋白质的形成 | 第14-15页 |
| 1.3.2 融合蛋白与天然无规则蛋白质的关系 | 第15页 |
| 1.3.3 融合蛋白质与人类癌症 | 第15-16页 |
| 1.3.4 融合蛋白的无规则区域与人类癌症 | 第16页 |
| 1.4 蛋白质翻译后修饰位点与无规则区域 | 第16-19页 |
| 1.4.1 蛋白质翻译后修饰位点 | 第17-18页 |
| 1.4.2 蛋白质翻译后修饰与无规则区域的关系 | 第18-19页 |
| 1.5 RNA-SEQ数据与融合基因的鉴定 | 第19-21页 |
| 1.5.1 RNA-seq数据鉴定融合基因的优势 | 第19-20页 |
| 1.5.2 利用RNA-seq数据鉴定融合基因的工具 | 第20-21页 |
| 1.6 研究的主要内容和意义 | 第21-23页 |
| 第二章 融合基因和融合蛋白的序列特征 | 第23-34页 |
| 2.1 简介 | 第23页 |
| 2.2 数据来源和预处理 | 第23-24页 |
| 2.2.1 融合基因的数据来源和预处理 | 第23-24页 |
| 2.2.2 融合蛋白质的数据来源和预处理 | 第24页 |
| 2.3 方法 | 第24-26页 |
| 2.3.1 融合亲本基因断点序列特征的统计 | 第24页 |
| 2.3.2 融合蛋白质中无规则结构的预测 | 第24-25页 |
| 2.3.3 融合蛋白质中磷酸化翻译后修饰位点的预测 | 第25页 |
| 2.3.4 融合蛋白质EML4-ALK的结构建模 | 第25-26页 |
| 2.4 结果和讨论 | 第26-33页 |
| 2.4.1 融合亲本基因断点周围的序列特征 | 第26-27页 |
| 2.4.2 融合蛋白质的序列特征 | 第27-28页 |
| 2.4.3 融合蛋白质的翻译后修饰位点 | 第28-30页 |
| 2.4.4 非小细胞肺癌中融合蛋白质的致癌机理 | 第30-33页 |
| 2.5 本章小结 | 第33-34页 |
| 第三章 肿瘤相关融合蛋白质背景数据库的构建 | 第34-41页 |
| 3.1 简介 | 第34页 |
| 3.2 数据来源和预处理 | 第34-35页 |
| 3.3 方法 | 第35-37页 |
| 3.3.1 利用TopHat-Fusion鉴定肿瘤中融合基因 | 第35-36页 |
| 3.3.2 肿瘤相关融合蛋白质背景数据库构建流程 | 第36-37页 |
| 3.4 结果和讨论 | 第37-40页 |
| 3.4.1 TopHat-Fusion鉴定结果分析 | 第37-39页 |
| 3.4.2 背景数据库构建结果 | 第39-40页 |
| 3.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 结论与展望 | 第41-43页 |
| 4.1 结论 | 第41-42页 |
| 4.2 展望 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-51页 |
| 附录 | 第51-53页 |
| 附录1 附图 | 第51-53页 |
| 在读期间公开发表的论文和承担科研项目及取得成果 | 第53-54页 |
| 一、论文 | 第53页 |
| 二、科研项目 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
