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肿瘤相关融合基因及融合蛋白质的序列和结构特征研究

中文摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
第一章 绪论第12-23页
    1.1 染色体转位第12-13页
    1.2 天然无规则蛋白质第13-14页
    1.3 融合蛋白质与无规则区域第14-16页
        1.3.1 转位相关融合蛋白质的形成第14-15页
        1.3.2 融合蛋白与天然无规则蛋白质的关系第15页
        1.3.3 融合蛋白质与人类癌症第15-16页
        1.3.4 融合蛋白的无规则区域与人类癌症第16页
    1.4 蛋白质翻译后修饰位点与无规则区域第16-19页
        1.4.1 蛋白质翻译后修饰位点第17-18页
        1.4.2 蛋白质翻译后修饰与无规则区域的关系第18-19页
    1.5 RNA-SEQ数据与融合基因的鉴定第19-21页
        1.5.1 RNA-seq数据鉴定融合基因的优势第19-20页
        1.5.2 利用RNA-seq数据鉴定融合基因的工具第20-21页
    1.6 研究的主要内容和意义第21-23页
第二章 融合基因和融合蛋白的序列特征第23-34页
    2.1 简介第23页
    2.2 数据来源和预处理第23-24页
        2.2.1 融合基因的数据来源和预处理第23-24页
        2.2.2 融合蛋白质的数据来源和预处理第24页
    2.3 方法第24-26页
        2.3.1 融合亲本基因断点序列特征的统计第24页
        2.3.2 融合蛋白质中无规则结构的预测第24-25页
        2.3.3 融合蛋白质中磷酸化翻译后修饰位点的预测第25页
        2.3.4 融合蛋白质EML4-ALK的结构建模第25-26页
    2.4 结果和讨论第26-33页
        2.4.1 融合亲本基因断点周围的序列特征第26-27页
        2.4.2 融合蛋白质的序列特征第27-28页
        2.4.3 融合蛋白质的翻译后修饰位点第28-30页
        2.4.4 非小细胞肺癌中融合蛋白质的致癌机理第30-33页
    2.5 本章小结第33-34页
第三章 肿瘤相关融合蛋白质背景数据库的构建第34-41页
    3.1 简介第34页
    3.2 数据来源和预处理第34-35页
    3.3 方法第35-37页
        3.3.1 利用TopHat-Fusion鉴定肿瘤中融合基因第35-36页
        3.3.2 肿瘤相关融合蛋白质背景数据库构建流程第36-37页
    3.4 结果和讨论第37-40页
        3.4.1 TopHat-Fusion鉴定结果分析第37-39页
        3.4.2 背景数据库构建结果第39-40页
    3.5 本章小结第40-41页
第四章 结论与展望第41-43页
    4.1 结论第41-42页
    4.2 展望第42-43页
参考文献第43-51页
附录第51-53页
    附录1 附图第51-53页
在读期间公开发表的论文和承担科研项目及取得成果第53-54页
    一、论文第53页
    二、科研项目第53-54页
致谢第54页

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