| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第13-19页 |
| 1.1 课题背景 | 第13-14页 |
| 1.2 本文的研究内容及主要工作 | 第14-17页 |
| 1.2.1 本文的研究内容 | 第14-16页 |
| 1.2.2 本文的特色工作 | 第16-17页 |
| 1.3 本文的内容安排 | 第17-19页 |
| 第二章 一种基于信息散度的信号通路分析模型 | 第19-39页 |
| 2.1 引言 | 第19-21页 |
| 2.1.1 背景 | 第19页 |
| 2.1.2 研究现状 | 第19-21页 |
| 2.2 基于信息散度的信号通路分析模型 | 第21-23页 |
| 2.2.1 基于基因表达数据模拟基因对调控程度 | 第21-22页 |
| 2.2.2 基于基因表达数据模拟基因对相关程度 | 第22页 |
| 2.2.3 基于信息散度计算基因间交互程度分布差异 | 第22-23页 |
| 2.2.4 基于置换检验评估统计显著性 | 第23页 |
| 2.3 实验 | 第23-38页 |
| 2.3.1 实验数据 | 第24-25页 |
| 2.3.2 实验分析 | 第25-38页 |
| 2.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 第三章 一种基于随机游走的信号通路分析方法 | 第39-55页 |
| 3.1 引言 | 第39-40页 |
| 3.1.1 背景 | 第39页 |
| 3.1.2 研究现状 | 第39-40页 |
| 3.2 基于随机游走的信号通路分析方法 | 第40-44页 |
| 3.2.1 基于通路拓扑结构量化基因间实际调控程度 | 第41-42页 |
| 3.2.2 基于基因表达数据模拟基因间调控程度 | 第42页 |
| 3.2.3 基于KL信息散度计算实际vs拟合通路基因对活性分布差异 | 第42-43页 |
| 3.2.4 基于置换检验评估统计显著性 | 第43-44页 |
| 3.3 实验分析 | 第44-52页 |
| 3.3.1 实际vs拟合通路基因调控程度分布差异分析 | 第45-48页 |
| 3.3.2 筛选结果精确率分析 | 第48-49页 |
| 3.3.3 敏感度与特异度分析 | 第49-52页 |
| 3.4 本章小结 | 第52-55页 |
| 第四章 面向肠癌样本细胞基因表达数据的差异分析 | 第55-69页 |
| 4.1 引言 | 第55页 |
| 4.2 芯片数据介绍和预处理 | 第55-56页 |
| 4.3 实验分析 | 第56-67页 |
| 4.3.1 药物对原发/转移肿瘤治疗情况差异分析 | 第56-62页 |
| 4.3.2 分子靶向治疗靶标的发现 | 第62-67页 |
| 4.4 本章小结 | 第67-69页 |
| 第五章 结论 | 第69-73页 |
| 5.1 工作总结 | 第69-70页 |
| 5.2 后续的主要工作 | 第70-73页 |
| 参考文献 | 第73-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第79页 |
