| 摘要 | 第3-7页 |
| abstract | 第7-11页 |
| 缩略词中英文对照 | 第16-19页 |
| 前言 | 第19-25页 |
| 第1章 人皮肤增生性瘢痕与正常皮肤组织中lncRNA和circRNA的差异表达分析 | 第25-89页 |
| 1 实验材料 | 第25-29页 |
| 1.1 研究对象 | 第25-26页 |
| 1.1.1 样本来源与分组 | 第25-26页 |
| 1.1.2 样本采集 | 第26页 |
| 1.2 实验材料 | 第26-29页 |
| 1.2.1 主要试剂 | 第26-27页 |
| 1.2.2 主要仪器设备 | 第27-28页 |
| 1.2.3 数据库及分析软件 | 第28-29页 |
| 2 实验方法 | 第29-42页 |
| 2.1 高通量测序检测lncRNA、circRNA和mRNA在人增生性瘢痕与正常皮肤组织中的表达 | 第29-33页 |
| 2.1.1 增生性瘢痕及正常皮肤组织总RNA提取 | 第30-31页 |
| 2.1.2 总RNA质检 | 第31页 |
| 2.1.3 测序 | 第31-33页 |
| 2.2 HS相关lncRNA、circRNA和mRNA生物信息学分析 | 第33-42页 |
| 2.2.1 测序质量评估 | 第33-36页 |
| 2.2.2 实时荧光定量PCR实验对测序结果进行验证 | 第36-40页 |
| 2.2.3 统计学处理 | 第40页 |
| 2.2.4 基因相关分析 | 第40-42页 |
| 3 结果 | 第42-85页 |
| 3.1 RNA质检结果 | 第42-43页 |
| 3.2 测序质量评估结果 | 第43-46页 |
| 3.2.1 碱基质量分布 | 第43-44页 |
| 3.2.2 BaseContent分布 | 第44页 |
| 3.2.3 GCContent分布 | 第44-45页 |
| 3.2.4 SequenceBaseQuality | 第45-46页 |
| 3.3 参考信息比对结果 | 第46-50页 |
| 3.3.1 比对结果基本统计 | 第46-47页 |
| 3.3.2 比对区域分布统计 | 第47-49页 |
| 3.3.3 比对结果质控分析结果 | 第49-50页 |
| 3.4 基于表达量的测序质量评估结果 | 第50-54页 |
| 3.4.1 样品表达模式 | 第50-51页 |
| 3.4.2 测序饱和度 | 第51-52页 |
| 3.4.3 基因覆盖均一度 | 第52-53页 |
| 3.4.4 PCA分析 | 第53-54页 |
| 3.5 生物信息学分析 | 第54-81页 |
| 3.5.1 两组样本mRNA相关生物信息学分析 | 第54-59页 |
| 3.5.2 两组样本lncRNA相关生物信息学分析 | 第59-75页 |
| 3.5.3 两组样本circRNA相关生物信息学分析 | 第75-81页 |
| 3.6 qRT-PCR验证结果 | 第81-82页 |
| 3.7 两组样本差异基因的网络构建及功能分析 | 第82-85页 |
| 3.7.1 差异表达基因的CNC网络构建及分析 | 第82-84页 |
| 3.7.2 差异表达基因的ceRNA网络构建与分析 | 第84-85页 |
| 4 讨论 | 第85-89页 |
| 第2章 自噬及外泌体干预后体外培养人增生性瘢痕成纤维细胞lncRNA和circRNA的表达变化 | 第89-130页 |
| 一、细胞自噬与增生性瘢痕 | 第89页 |
| 二、外泌体与增生性瘢痕 | 第89-130页 |
| 1 实验材料 | 第90-92页 |
| 1.1 研究对象 | 第90-91页 |
| 1.2 实验材料 | 第91-92页 |
| 2 实验方法 | 第92-98页 |
| 2.1 体外培养人增生性瘢痕皮肤成纤维细胞 | 第92-94页 |
| 2.1.1 组织块法培养人增生性瘢痕皮肤成纤维细胞 | 第92页 |
| 2.1.2 成纤维细胞的传代培养 | 第92-93页 |
| 2.1.3 成纤维细胞的冻存 | 第93页 |
| 2.1.4 成纤维细胞的复苏 | 第93-94页 |
| 2.2 人羊膜间充质干细胞的分离与培养 | 第94-95页 |
| 2.3 羊膜间充质干细胞上清液中外泌体的分离与纯化 | 第95页 |
| 2.4 实验细胞分组 | 第95页 |
| 2.5 细胞RNA提取 | 第95-96页 |
| 2.6 细胞RNA质检 | 第96页 |
| 2.6.1 微量分光光度计检测浓度及纯度 | 第96页 |
| 2.6.2 琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性 | 第96页 |
| 2.7 细胞RNA测序 | 第96-97页 |
| 2.8 细胞RNA相关生物学分析 | 第97-98页 |
| 2.9 统计学处理 | 第98页 |
| 3 结果 | 第98-123页 |
| 3.1 RNA质检结果 | 第98-99页 |
| 3.2 测序质量评估结果 | 第99-102页 |
| 3.2.1 测序数据整理和过滤 | 第99-100页 |
| 3.2.2 碱基质量分布 | 第100-101页 |
| 3.2.3 BaseContent分布 | 第101页 |
| 3.2.4 GCContent分布 | 第101-102页 |
| 3.2.5 SequenceBaseQuality | 第102页 |
| 3.3 参考信息比对结果 | 第102-106页 |
| 3.3.1 比对结果基本统计 | 第102-103页 |
| 3.3.2 比对区域分布统计 | 第103-105页 |
| 3.3.3 比对结果质控分析结果 | 第105-106页 |
| 3.4 基于表达量的测序质量评估结果 | 第106-109页 |
| 3.4.1 样品表达模式 | 第106-107页 |
| 3.4.2 测序饱和度 | 第107页 |
| 3.4.3 基因覆盖均一度 | 第107-108页 |
| 3.4.4 PCA分析 | 第108-109页 |
| 3.5 生物信息学分析 | 第109-123页 |
| 3.5.1 三组样本差异表达的RNA聚类分析 | 第109页 |
| 3.5.2 A与B两组样本测序结果相关生物信息学分析 | 第109-116页 |
| 3.5.3 A与C两组样本测序结果相关生物信息学分析 | 第116-123页 |
| 4 讨论 | 第123-130页 |
| 4.1 增生性瘢痕中细胞自噬与lncRNA、circRNA的调节 | 第123-127页 |
| 4.2 外泌体与增生性瘢痕细胞中lncRNA、circRNA的调节 | 第127-130页 |
| 第3章 结论与展望 | 第130-132页 |
| 3.1 结论 | 第130页 |
| 3.2 进一步工作的方向 | 第130-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
| 参考文献 | 第133-141页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第141-142页 |
| 综述一 细胞自噬调控在创面修复中的作用研究进展 | 第142-152页 |
| 参考文献 | 第149-152页 |
| 综述二 ceRNA在皮肤病理性瘢痕中的研究进展 | 第152-160页 |
| 参考文献 | 第158-160页 |
