| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第11-13页 |
| 第一部分 文献综述 | 第13-49页 |
| 第一章 植物基因精细定位研究进展 | 第13-29页 |
| 1. 植物基因精细定位策略 | 第13-21页 |
| 1.1 植物分子标记遗传图谱的研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2 质量性状基因定位的策略 | 第18-19页 |
| 1.3 数量性状基因定位的策略 | 第19-21页 |
| 2. 植物基因精细定位方法 | 第21-25页 |
| 2.1 作图群体的建立 | 第21-22页 |
| 2.2 寻找与目的基因连锁的分子标记 | 第22-24页 |
| 2.3 目的基因的初步定位 | 第24-25页 |
| 2.4 目的基因的精细定位 | 第25页 |
| 3. 植物基因精细定位的研究进展 | 第25-29页 |
| 第二章 植物转录组学研究进展 | 第29-41页 |
| 1. 植物转录组学主要分析方法 | 第29-32页 |
| 1.1 基于测序的表达谱分析手段 | 第30-31页 |
| 1.2 基于杂交的表达谱分析手段 | 第31-32页 |
| 2. 基因芯片的数据处理与分析 | 第32-35页 |
| 2.1 芯片图像的处理与数据的获得 | 第32页 |
| 2.2 芯片数据的归一化处理 | 第32-33页 |
| 2.3 差异基因的筛选 | 第33-34页 |
| 2.4 数据的聚类分析 | 第34-35页 |
| 3. 芯片表达谱技术在植物中的应用 | 第35-41页 |
| 3.1 芯片表达谱技术在模式植物中的应用 | 第35-36页 |
| 3.2 芯片表达谱技术在棉纤维表达中的应用 | 第36-41页 |
| 第三章 陆地棉极短纤维突变体遗传及生理生化与分子生物学研究进展 | 第41-48页 |
| 1. 陆地棉极短纤维突变体遗传研究进展 | 第41-43页 |
| 1.1 棉纤维极端缩短突变体遗传研究方法 | 第41-42页 |
| 1.2 陆地棉极短纤维突变体遗传研究进展 | 第42-43页 |
| 2. 陆地棉极短纤维突变体生理生化与分子生物学研究进展 | 第43-48页 |
| 2.1 极短纤维突变体生理生化研究进展 | 第44-46页 |
| 2.2 极短纤维突变体分子生物学研究进展 | 第46-48页 |
| 本研究目的和意义 | 第48-49页 |
| 第二部分 研究报告 | 第49-111页 |
| 第四章 陆地棉极短纤维突变体基因Li_1、Li_2的精细定位 | 第49-73页 |
| 1. 材料 | 第49-51页 |
| 1.1 实验材料 | 第49-50页 |
| 1.2 SSR分子标记及其来源 | 第50-51页 |
| 2. 方法 | 第51-56页 |
| 2.1 性状调查 | 第51-52页 |
| 2.2 棉花基因组DNA的提取方法 | 第52-54页 |
| 2.3 SSR分子标记分析 | 第54-55页 |
| 2.4 标记基因型数据收集和分离比检测 | 第55-56页 |
| 2.5 遗传图谱的构建 | 第56页 |
| 3. 结果与分析 | 第56-69页 |
| 3.1 Li_1基因的精细定位 | 第56-64页 |
| 3.2 Li_2基因的精细定位 | 第64-69页 |
| 4. 讨论 | 第69-73页 |
| 4.1 Li_1基因定位的作图群体的选择 | 第69-70页 |
| 4.2 精细定位的其他影响因素 | 第70-72页 |
| 4.3 新标记的开发 | 第72页 |
| 4.4 本研究结果的应用 | 第72-73页 |
| 第五章 陆地棉极短纤维突变体Li_1、Li_2的表达谱分析 | 第73-93页 |
| 1. 材料与方法 | 第73-77页 |
| 1.1. 实验材料 | 第73-74页 |
| 1.2. 方法 | 第74-77页 |
| 2. 结果与分析 | 第77-88页 |
| 2.1 芯片数据的有效性 | 第77-79页 |
| 2.2 差异表达基因的总体特征 | 第79-81页 |
| 2.3 Li_1、Li_2芯片中差异表达基因的比较 | 第81-87页 |
| 2.4 Li_1突变体中表达上调的氧化酶、过氧化物酶相关基因 | 第87-88页 |
| 2.5 Li_1突变体中表达上调的转录因子相关基因 | 第88页 |
| 3. 讨论 | 第88-93页 |
| 3.1 突变体Li_1、Li_2棉纤维伸长发育的不同机制 | 第88-90页 |
| 3.2 H_2O_2在Li_1突变体棉纤维伸长发育中的作用 | 第90-93页 |
| 第六章 Li_1基因纯合不致死突变体(Li-R)的遗传分析 | 第93-111页 |
| 1. 材料和方法 | 第93-96页 |
| 1.1 实验材料 | 第93-95页 |
| 1.2 方法 | 第95-96页 |
| 2. 结果与分析 | 第96-107页 |
| 2.1 Li_1突变体显性纯合致死效应的证明 | 第96-99页 |
| 2.2 Li_1基因纯合不致死突变体(即Li-R重组体)的发现 | 第99页 |
| 2.3 Li_1基因纯合不致死突变体(即Li-R重组体)的遗传分析 | 第99-107页 |
| 3. 讨论 | 第107-111页 |
| 3.1 三种类型的Li-R重组体及其可能的基因型 | 第107-108页 |
| 3.2 Li_a位点与Li_1突变体多效性的关系 | 第108-110页 |
| 3.3 Li-R重组体中的li_a基因与Li_1基因的进化关系 | 第110-111页 |
| 全文结论 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-123页 |
| 致谢 | 第123-125页 |
| 攻读博士学位期间待发表的论文 | 第125页 |
