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基于转录组数据分析副溶血性弧菌对超高压的耐受机理

摘要第3-6页
ABSTRACT第6-9页
第1章 引言第13-24页
    1.1 超高压工作原理及其在食品工业中的应用第13-15页
        1.1.1 超高压工作原理第13页
        1.1.2 超高压在食品工业中的应用第13-15页
    1.2 超高压杀菌机制第15-17页
        1.2.1 超高压对微生物细胞壁膜的影响第15-16页
        1.2.2 超高压对微生物酶活性的影响第16页
        1.2.3 超高压处理对蛋白质的影响第16-17页
    1.3 微生物抗逆机制第17-21页
        1.3.1 微生物耐盐机制第17-18页
        1.3.2 微生物耐热机制第18-19页
        1.3.3 微生物耐药机制第19-20页
        1.3.4 微生物耐酸机制第20页
        1.3.5 微生物耐压机制第20-21页
    1.4 本文研究内容及意义第21-24页
        1.4.1 技术路线第21-22页
        1.4.2 研究内容第22页
        1.4.3 研究意义第22-24页
第2章 副溶血性弧菌耐压菌株的筛选及其细胞生物学分析第24-34页
    2.1 前言第24页
    2.2 实验材料与设备第24-25页
        2.2.1 实验材料第24-25页
        2.2.2 实验仪器与设备第25页
    2.3 实验方法第25-28页
        2.3.1 耐压菌筛选方法第25-26页
        2.3.2 副溶血性弧菌菌株存活率的测定第26页
        2.3.3 原始菌株和耐压菌株细胞膜Na~+/K~+-ATP酶活性测定第26页
        2.3.4 原始菌株和耐压菌株细胞膜通透性测定第26页
        2.3.5 原始菌株和耐压菌株细胞表面zeta电位测定第26-27页
        2.3.6 原始菌株和耐压菌株的透射电镜观察第27页
        2.3.7 原始菌株和耐压菌株细胞内过氧化氢酶活性测定第27-28页
    2.4 结果与分析第28-32页
        2.4.1 超高压处理后原始菌株与耐压菌株存活率的差异第28页
        2.4.2 超高压处理对副溶血性弧菌细胞膜Na~+/K~+-ATP酶活性的影响第28-29页
        2.4.3 超高压处理对副溶血性弧菌细胞膜通透性的破坏第29-30页
        2.4.4 超高压处理对副溶血性弧菌细胞表面zeta电位的影响第30页
        2.4.5 超高压处理对副溶血性弧菌细胞超微结构的影响第30-32页
        2.4.6 超高压处理对副溶血性弧菌细胞内过氧化氢酶活性的影响第32页
    2.5 本章小结第32-34页
第3章 基于转录组测序的副溶血性弧菌耐压分子机制第34-55页
    3.1 前言第34页
    3.2 实验材料与设备第34-35页
        3.2.1 实验材料第34-35页
        3.2.2 实验设备第35页
    3.3 实验方法第35-41页
        3.3.1 副溶血性弧菌原始菌株与耐压菌株的超高压胁迫处理第35页
        3.3.2 RNA提取及纯化第35-37页
        3.3.3 RNA样本质量检测第37页
        3.3.4 RNA-Seq测序cDNA文库制备第37-38页
        3.3.5 转录组测序第38页
        3.3.6 reads质量分析第38-39页
        3.3.7 转录组数据分析第39-41页
    3.4 结果分析与讨论第41-53页
        3.4.1 RNA样品质量分析第41-42页
        3.4.2 reads质量分析第42-44页
        3.4.3 超高压胁迫处理后的差异表达分析第44-53页
    3.5 本章小结第53-55页
第4章 原始菌株与耐压菌株差异核苷酸位点分析及实时荧光定量PCR分析第55-73页
    4.1 前言第55页
    4.2 实验材料与设备第55-58页
        4.2.1 实验材料第55页
        4.2.2 用于差异核苷酸位点PCR验证引物第55-57页
        4.2.3 用于荧光定量PCR引物第57-58页
        4.2.4 实验设备第58页
    4.3 实验方法第58-62页
        4.3.1 副溶血性弧菌原始菌株与耐压菌株差异核苷酸位点分析第58-59页
        4.3.2 差异核苷酸位点PCR验证第59-60页
        4.3.3 实时荧光定量PCR验证分析第60-62页
    4.4 实验结果与分析第62-71页
        4.4.1 差异核苷酸位点分析结果第62-63页
        4.4.2 差异核苷酸位点PCR验证结果第63-68页
        4.4.3 实时荧光定量PCR分析结果第68-71页
    4.5 本章小结第71-73页
第5章 结论、创新点及展望第73-76页
    5.1 结论第73-74页
    5.2 创新点第74页
    5.3 展望第74-76页
参考文献第76-81页
硕士期间发表的论文第81-82页
致谢第82-83页

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