| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略语 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-18页 |
| 第一章 鼠疫菌aspA基因第363位密码子多态性分析 | 第18-27页 |
| 1. 引言 | 第18页 |
| 2. 材料和方法 | 第18-21页 |
| 2.1 实验菌株 | 第18页 |
| 2.2 试剂和试剂盒 | 第18-19页 |
| 2.3 实验仪器 | 第19页 |
| 2.4 引物设计 | 第19页 |
| 2.5 实验方法 | 第19-21页 |
| 2.5.1 DNA的提取（酚氯仿抽提法） | 第19-20页 |
| 2.5.2 819 株鼠疫菌aspA基因第363位密码子测序 | 第20-21页 |
| 3. 结果与讨论 | 第21-27页 |
| 3.1 819 株鼠疫菌菌种信息 | 第21-22页 |
| 3.2 819 株鼠疫菌aspA基因第363位密码子测序 | 第22-24页 |
| 3.3 鼠疫菌进化中的aspA基因第363位密码子 | 第24-27页 |
| 第二章 鼠疫菌aspA基因突变株的构建 | 第27-40页 |
| 1. 引言 | 第27-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-36页 |
| 2.1 菌株和质粒 | 第28页 |
| 2.2 试剂和试剂盒 | 第28-29页 |
| 2.3 实验仪器 | 第29页 |
| 2.4 引物设计 | 第29-30页 |
| 2.5 实验方法 | 第30-36页 |
| 2.5.1 菌株的培养 | 第30页 |
| 2.5.2 鼠疫菌201菌株aspA基因敲除 | 第30-32页 |
| 2.5.3 辅助质粒的构建 | 第32-35页 |
| 2.5.4 二步重组 | 第35-36页 |
| 2.5.5 pREDTKI重组质粒的消除 | 第36页 |
| 3. 结果与讨论 | 第36-40页 |
| 3.1 201 菌株中aspA基因的敲除 | 第36-37页 |
| 3.2 辅助质粒的鉴定 | 第37-38页 |
| 3.3 二步重组筛选 | 第38-39页 |
| 3.4 小结 | 第39-40页 |
| 第三章 鼠疫菌201菌株野生株及aspA基因突变株表型差异分析 | 第40-69页 |
| 1. 引言 | 第40页 |
| 2. 材料与方法 | 第40-50页 |
| 2.1 菌株、细胞和动物模型 | 第40页 |
| 2.2 试剂和试剂盒 | 第40-41页 |
| 2.3 实验仪器 | 第41页 |
| 2.4 实验方法 | 第41-50页 |
| 2.4.1 菌株的培养 | 第41页 |
| 2.4.2 细胞的培养 | 第41页 |
| 2.4.3 201 菌株野生株与突变株生长曲线的绘制 | 第41-44页 |
| 2.4.4 Biolog检测 | 第44-46页 |
| 2.4.5 酚红显色实验 | 第46页 |
| 2.4.6 酸生存实验 | 第46-47页 |
| 2.4.7 H_2O_2抗性实验 | 第47-48页 |
| 2.4.8 aspA基因对鼠疫菌在巨噬细胞内增殖能力影响 | 第48-49页 |
| 2.4.9 实时细胞动态监测（RTCA）实验 | 第49页 |
| 2.4.10 攻毒小鼠实验 | 第49-50页 |
| 3. 结果与讨论 | 第50-69页 |
| 3.1 aspA基因第363位密码子突变对鼠疫菌生长的影响 | 第50-53页 |
| 3.2 Biolog生化检验结果 | 第53-58页 |
| 3.3 酚红显色实验结果 | 第58-59页 |
| 3.4 酸生存实验结果 | 第59-61页 |
| 3.5 H_2O_2抗性实验结果 | 第61页 |
| 3.6 aspA基因对鼠疫菌巨噬细胞内增殖能力影响 | 第61-63页 |
| 3.7 aspA基因第363位密码子突变对鼠疫菌毒力的影响 | 第63-68页 |
| 3.7.1 RTCA实验 | 第63-65页 |
| 3.7.2 攻毒小鼠实验 | 第65-68页 |
| 3.8 小结 | 第68-69页 |
| 第四章 鼠疫菌201野生株与aspA基因突变株适应度差异分析 | 第69-76页 |
| 1. 引言 | 第69页 |
| 2. 材料和方法 | 第69-73页 |
| 2.1 实验菌株 | 第69-70页 |
| 2.2 试剂和试剂盒 | 第70页 |
| 2.3 实验仪器 | 第70页 |
| 2.4 实验方法 | 第70-73页 |
| 2.4.1 竞争实验 | 第70-71页 |
| 2.4.2 aspA基因扩增 | 第71-72页 |
| 2.4.3 高通量测序 | 第72-73页 |
| 3. 结果与讨论 | 第73-76页 |
| 3.1 PCR扩增偏性检测 | 第73-74页 |
| 3.2 竞争实验结果 | 第74-75页 |
| 3.3 小结 | 第75-76页 |
| 结论 | 第76-78页 |
| 博士期间完成其他工作 | 第78-99页 |
| 1. 引言 | 第78页 |
| 2. 材料和方法 | 第78-86页 |
| 2.1 菌株和质粒 | 第78-79页 |
| 2.2 试剂和试剂盒 | 第79页 |
| 2.3 实验仪器 | 第79-80页 |
| 2.4 实验方法 | 第80-86页 |
| 2.4.1 菌株培养 | 第80页 |
| 2.4.2 A3ET菌株在抗生素条件下生长曲线的绘制 | 第80页 |
| 2.4.3 药敏实验 | 第80-82页 |
| 2.4.4 A3ET菌株全基因组测序 | 第82页 |
| 2.4.5 碳青霉烯酶活性检测与蛋白质组学分析 | 第82-83页 |
| 2.4.6 对碳青霉烯酶PAD-1 的生物信息学分析 | 第83页 |
| 2.4.7 碳青霉烯酶PAD-1 的表达与纯化 | 第83-86页 |
| 2.4.8 酶动力学分析 | 第86页 |
| 3. 结果与讨论 | 第86-99页 |
| 3.1 A3ET菌株的抗药性 | 第86-89页 |
| 3.1.1 A3ET菌株在抗生素条件下的生长曲线 | 第86-87页 |
| 3.1.2 A3ET菌株的抗性谱 | 第87-89页 |
| 3.2 碳青霉烯酶PAD-1 的发现 | 第89-91页 |
| 3.2.1 Cloverleaf Test实验结果 | 第89-90页 |
| 3.2.2 蛋白质组实验结果 | 第90-91页 |
| 3.3 碳青霉烯酶PAD-1 的生物信息学分析结果 | 第91-94页 |
| 3.4 碳青霉烯酶PAD-1 的酶动力学分析 | 第94-97页 |
| 3.5 小结 | 第97-99页 |
| 参考文献 | 第99-107页 |
| 附表 | 第107-123页 |
| 攻读博士期间参与发表论文 | 第123-124页 |
| 个人简历 | 第124-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
