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枇杷花期调控的分子生物学研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
缩略词表第8-12页
第1章 前言第12-22页
    1.1 高等植物花期调控分子机理研究进展第12-19页
        1.1.1 自主途径 (autonomous pathway)第12-13页
        1.1.2 年龄途径 (aging pathway)第13-14页
        1.1.3 光周期途径 (photoperiod pathway)第14-15页
        1.1.4 温度对开花的调控第15-17页
            1.1.4.1 春化途径 (vernalization pathway)第15页
            1.1.4.2 热感应途径 (thermosensory pathway或ambient temperature pathway)第15-17页
        1.1.5 赤霉素途径 (gibberellin pathway)第17页
        1.1.6 干旱对植物开花的影响第17-18页
        1.1.7 开花调控在一些作物中的研究进展第18-19页
    1.2 枇杷花期调控的研究现状及本研究的目的与意义第19-21页
    1.3 本研究的技术路线第21-22页
第2章 枇杷花期调控相关基因的克隆,功能验证及表达分析第22-63页
    2.1 引言第22页
    2.2 材料与方法第22-29页
        2.2.1 材料第22页
        2.2.2 枇杷样品采集第22-23页
            2.2.2.1 不同时期样品第22-23页
            2.2.2.2 组织样品第23页
            2.2.2.3 昼夜节律样品第23页
        2.2.3 枇杷顶芽顶端分生组织的形态解剖学观察第23-24页
        2.2.4 总RNA的提取及cDNA第一链的合成第24页
        2.2.5 基因克隆第24页
        2.2.6 实时荧光定量PCR (qPCR) 分析第24-26页
        2.2.7 载体构建第26-27页
        2.2.8 拟南芥转基因实验第27-28页
            2.2.8.1 农杆菌感受态细胞的制备第27页
            2.2.8.2 农杆菌感受态细胞的转化第27页
            2.2.8.3 转化拟南芥第27-28页
        2.2.9 烟草瞬时转化实验第28-29页
    2.3 结果与分析第29-60页
        2.3.1 台湾枇杷恒春变型顶芽的成花观察第29-30页
        2.3.2 枇杷花期调控相关基因的克隆第30-40页
            2.3.2.1 FT的克隆第30-32页
            2.3.2.2 bZIP转录因子基因FD的克隆第32-33页
            2.3.2.3 光周期途径基因CO的克隆第33-35页
            2.3.2.4 光周期途径基因GI的克隆第35-36页
            2.3.2.5 MADS-Box转录因子基因SOC1和SVP的克隆第36-38页
            2.3.2.6 bZIP转录因子基因PIF4的克隆第38-40页
        2.3.3 花期调控相关基因在台湾枇杷恒春变型中的时空表达分析第40-45页
            2.3.3.1 在台湾枇杷恒春变型不同组织中的表达分析第40-41页
            2.3.3.2 在台湾枇杷恒春变型不同时期叶片中的表达分析第41-44页
            2.3.3.3 在台湾枇杷恒春变型不同时期顶芽中的表达分析第44-45页
        2.3.4 光周期基因EdGI,EdCO和EdFT的昼夜节律表达分析第45页
        2.3.5 枇杷花期调控相关基因编码蛋白的亚细胞定位第45-48页
        2.3.6 枇杷花期调控相关基因的遗传功能验证第48-54页
            2.3.6.1 EdFT显著加速拟南芥开花第48-49页
            2.3.6.2 EdFDs加速拟南芥开花第49-50页
            2.3.6.3 光周期途径基因EdCO和EdGI加速拟南芥开花第50-52页
            2.3.6.4 EdSOC1加速拟南芥开花第52-54页
            2.3.6.5 EdPIF4过表达不影响野生型拟南芥开花时间第54页
        2.3.7 EdFT与EdFDs的相互作用第54-55页
        2.3.8 普通枇杷不同开花时间品种花期调控的初步研究第55-60页
    2.4 讨论第60-63页
第3章 不同花期枇杷的转录组测序与生物信息学分析第63-82页
    3.1 引言第63页
    3.2 材料与方法第63-65页
        3.2.1 材料第63页
        3.2.2 测序样品时期的确定第63页
        3.2.3 RNA提取,文库构建及测序第63页
        3.2.4 转录组数据组装及功能注释第63-64页
        3.2.5 预测编码蛋白框(CDS)第64页
        3.2.6 转录组unigene的差异表达基因 (DEG) 分析第64页
        3.2.7 基因共表达网络构建第64页
        3.2.8 花期相关基因的鉴定第64-65页
        3.2.9 差异表达基因的定量验证第65页
    3.3 结果与分析第65-79页
        3.3.1 测序样品所选时期的茎顶端状态观察第65-66页
        3.3.2 转录组测序及组装结果与分析第66-68页
        3.3.3 Unigene功能注释结果与分析第68-71页
            3.3.3.1 Unigene序列同源性分析第68-69页
            3.3.3.2 COG功能分类第69-70页
            3.3.3.3 GO分类第70-71页
        3.3.4 CDS预测结果第71-72页
        3.3.5 差异表达基因分析第72页
        3.3.6 基因共表达网络分析第72-76页
        3.3.7 花期调控相关同源基因的鉴定及表达分析第76-78页
        3.3.8 差异表达基因的RNA-Seq表达量和qPCR验证分析第78-79页
    3.4 讨论第79-82页
第4章 论文结论、创新点及进一步研究设想第82-85页
    4.1 结论第82-83页
    4.2 本论文创新之处第83页
    4.3 进一步研究设想第83-85页
致谢第85-87页
参考文献第87-98页
附录A 枇杷花期调控相关基因的核苷酸序列和推导的氨基酸序列第98-105页
附录B 转录组数据中鉴定的花期调控相关基因第105-109页
附录C 攻读博士学位期间论文发表情况第109页

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