猪生长、胴体及肉质与候选基因集的关联分析研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 1 引言 | 第10-24页 |
| ·复杂性状的主要研究方法 | 第10-17页 |
| ·候选基因法 | 第10-11页 |
| ·全基因组扫描 | 第11-12页 |
| ·全基因组关联分析 | 第12-13页 |
| ·候选基因集法 | 第13-17页 |
| ·相关基因及通路研究进展 | 第17-21页 |
| ·相关基因 | 第17-20页 |
| ·相关通路 | 第20-21页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第21-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-38页 |
| ·表型测定 | 第24-26页 |
| ·实验动物 | 第24页 |
| ·生长性状测定 | 第24页 |
| ·胴体性状测定 | 第24-25页 |
| ·肉质性状测定 | 第25-26页 |
| ·基因集的定义 | 第26页 |
| ·QTL 上的映射 | 第26-27页 |
| ·SNP 位点的推断 | 第27-29页 |
| ·标签SNP 位点的筛选 | 第27页 |
| ·预测潜在的SNP | 第27-29页 |
| ·SNP 检测分型 | 第29-32页 |
| ·试剂与药品 | 第29-30页 |
| ·基因组DNA 的提取及检测 | 第30-31页 |
| ·SNaPshot 分型 | 第31页 |
| ·PCR-RFLP 分型 | 第31-32页 |
| ·关联分析 | 第32-33页 |
| ·最小二乘分析 | 第32-33页 |
| ·多元多重回归分析 | 第33页 |
| ·基于模型的多因素降维方法（MB-MDR） | 第33页 |
| ·荧光定量 PCR 验证 | 第33-38页 |
| ·试剂及药品 | 第33-34页 |
| ·RNA 的提取及检测 | 第34-35页 |
| ·总RNA 的反转录 | 第35页 |
| ·实时定量PCR 的反应体系及反应条件 | 第35-36页 |
| ·结果计算及统计分析 | 第36-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-62页 |
| ·猪的通路基因 | 第38页 |
| ·QTL 上的映射 | 第38-39页 |
| ·SNP 点的推断 | 第39-43页 |
| ·SNP 检测分型 | 第43页 |
| ·关联分析 | 第43-57页 |
| ·生长性状 | 第43-55页 |
| ·胴体性状 | 第55页 |
| ·肉质性状 | 第55-57页 |
| ·部分显著相关基因组织表达量分析 | 第57-62页 |
| ·引物溶解曲线检测结果 | 第57页 |
| ·标准曲线 | 第57-59页 |
| ·基因表达结果 | 第59-62页 |
| 4 讨论 | 第62-70页 |
| ·通路候选基因 | 第62-64页 |
| ·丙酸代谢通路候选基因的功能 | 第62页 |
| ·脂肪酸代谢通路候选基因的功能 | 第62-64页 |
| ·候选基因与性状的关系分析 | 第64-70页 |
| ·显著位点基因频率分析 | 第64-66页 |
| ·静态数据与动态数据结果差异分析 | 第66-67页 |
| ·单个SNP 位点与基因互作效应对比分析 | 第67-70页 |
| 5 结论 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 攻读硕士学位期间发表或录用的论文 | 第82-84页 |
